RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399687.3

ABCD1P4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene ABCD1P4, Length 604 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P4-201ENST00000399687 STAG3L1P0CL83 205 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SKIP12755 728 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GUCY2CP25092 1073 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 NAMPTP43490 491 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 EFNA5P52803 228 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GRB10Q13322 594 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 DRP2Q13474 957 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GPR153Q6NV75 609 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 DEPTORQ8TB45 409 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 RSPH1Q8WYR4 309 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAGEF1Q9HAY2 307 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 CHST12Q9NRB3 414 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa15.19■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 ARL2P36404 184 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SMTNP53814 917 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GPNMBQ14956 572 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 ECM1Q16610 540 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 IQUBQ8NA54 791 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 RAD54LQ92698 747 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCDC51Q96ER9 411 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 EPSTI1Q96J88 318 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 CLIC6Q96NY7 704 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 HOXA2O43364 376 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 TLL1O43897 1013 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 AXLP30530 894 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 RAB27AP51159 221 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 AMPD3Q01432 767 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GRIN1Q05586 938 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 RINT1Q6NUQ1 792 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SLC24A5Q71RS6 500 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SV2BQ7L1I2 683 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 FAM228AQ86W67 206 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GPBP1Q86WP2 473 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 HACE1Q8IYU2 909 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 PNMA5Q96PV4 448 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 PLIN2Q99541 437 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 TCHHQ07283 1943 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GLRA2P23416 452 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 DDIT3P35638 169 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SLC12A3P55017 1021 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 PTENP60484 403 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 CAPSQ13938 189 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAPK6Q16659 721 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SPECC1Q5M775 1068 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 NOTUMQ6P988 496 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 KSR1Q8IVT5 923 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 VWCEQ96DN2 955 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 YME1L1Q96TA2 773 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 IFT122Q9HBG6 1241 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 INSL6Q9Y581 213 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 COL4A6Q14031 1691 aa15.16■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GBF1Q92538 1859 aa15.15■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 A0A087WWV3 80 aa15.15■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCDC169A6NNP5 214 aa15.15■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 HIP1RO75146 1068 aa15.15■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 FAM13AO94988 1023 aa15.15■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 GJB5O95377 273 aa15.15■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 DNAJB2P25686 324 aa15.15■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms