RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM206Q9H813 350 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SOWAHDA6NJG2 315 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CYP2B6P20813 491 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GLRA2P23416 452 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ARL2P36404 184 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TAS1R3Q7RTX0 852 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD10Q9NUJ1 306 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GJD2Q9UKL4 321 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 STX10O60499 249 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 MAFO75444 373 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GH1P01241 217 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TPM1P09493 284 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SREBF2Q12772 1141 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ALCAMQ13740 583 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CNGA4Q8IV77 575 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC112Q8NEF3 446 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 USP6NLQ92738 828 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 IFT74Q96LB3 600 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 AOC2O75106 756 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ADSSP30520 456 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CYP2C19P33261 490 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 RTP1P59025 263 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM14Q14142 442 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ATP8B4Q8TF62 1192 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 EMSYQ7Z589 1322 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 EXOC3O60645 756 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 LGALS2P05162 132 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC71Q8N4P6 559 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SLC35C1Q96A29 364 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CHP1Q99653 195 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 NUP58Q9BVL2 599 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SLC5A4Q9NY91 659 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.82■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8IPA6NC78 632 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP6O43182 974 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 NRDCO43847 1150 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF286BP0CG31 522 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CNGA1P29973 690 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 RFC5P40937 340 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 FAM167AQ96KS9 214 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TRPC6Q9Y210 931 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.81■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 MGAMO43451 1857 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF236Q9UL36 1845 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CA12O43570 354 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 NOL4O94818 638 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TOMM70O94826 608 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SLC9A1P19634 815 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 WDR59Q6PJI9 974 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 PPTC7Q8NI37 304 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC51Q96ER9 411 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 DESI2Q9BSY9 194 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GJB1P08034 283 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM49P0CI25 452 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM49CP0CI26 452 aa16.8■□□□□ 0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ACTN1P12814 892 aa16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms