RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 LPXNO60711 386 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 STC2O76061 302 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 NAT1P18440 290 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 FAM209AQ5JX71 171 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ST8SIA2Q92186 375 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF185O15231 689 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 TYRP1P17643 537 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 RGS3P49796 1198 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 TAP1Q03518 808 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 SPATC1Q76KD6 591 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 C16orf92Q96LL3 132 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRC-202ENST00000367364 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 HK1P19367 917 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 DGKDQ16760 1214 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 ARL8AQ96BM9 186 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 AHRRA9YTQ3 701 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 PRLP01236 227 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 LAG3P18627 525 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 GABREP78334 506 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 FAM189BP81408 668 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 SPIDRQ14159 915 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 KRT40Q6A162 431 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 CDC6Q99741 560 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 SYBUQ9NX95 663 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 UNCXA6NJT0 531 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 EXOC2Q96KP1 924 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 NCDNQ9UBB6 729 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 SLC12A8A0AV02 714 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRC-202ENST00000367364 SLC6A3Q01959 620 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 ARID5AQ03989 594 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRC-202ENST00000367364 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRC-202ENST00000367364 GYPEP15421 78 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-202ENST00000367364 PTH2RP49190 550 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 WDR92Q96MX6 357 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 KCNH6Q9H252 994 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 DNAI1Q9UI46 699 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRC-202ENST00000367364 USP14P54578 494 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 NPEPPSP55786 919 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 RAB33AQ14088 237 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 PRR16Q569H4 304 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 DYDC2Q96IM9 177 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-202ENST00000367364 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRC-202ENST00000367364 IRF9Q00978 393 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 ROM1Q03395 351 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 RSAD1Q9HA92 442 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 CFBP00751 764 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-202ENST00000367364 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.45□□□□□ -1.38
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