RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 UBE4BO95155 1302 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 PODXLO00592 558 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 BAG2O95816 211 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 EFNA5P52803 228 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TBK1Q9UHD2 729 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 NRKQ7Z2Y5 1582 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ZBBXA8MT70 800 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SLCO1A2P46721 670 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 FAM151AQ8WW52 585 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC53A6NM62 1247 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CLGNO14967 610 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 EYA4O95677 639 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 PASD1Q8IV76 773 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GANCQ8TET4 914 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 KLC2Q9H0B6 622 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC197Q8NCU1 140 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SAAL1Q96ER3 474 aa11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 MED14O60244 1454 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 EVI5O60447 810 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RNF149Q8NC42 400 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CA4P22748 312 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 XKR3Q5GH77 459 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 MIPOL1Q8TD10 442 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 VCPKMTQ9H867 229 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RGL1Q9NZL6 768 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 DGAT1O75907 488 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GGPS1O95749 300 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TTC4O95801 387 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 AP3M2P53677 418 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RAET1EQ8TD07 263 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.03□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 A8MXQ7 604 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 KRT37O76014 449 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 NTSR2O95665 410 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CLTAP09496 248 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 COG7P83436 770 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RCN2Q14257 317 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 MUM1Q2TAK8 710 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GPD1LQ8N335 351 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 FAF2Q96CS3 445 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GINM1Q9NU53 330 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 HEY1Q9Y5J3 304 aa11.02□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ABCA6Q8N139 1617 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 PALMO75781 387 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 NR3C2P08235 984 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 GNA15P30679 374 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 SOX5P35711 763 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 CUL1Q13616 776 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 ELMOD1Q8N336 334 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 HAUS8Q9BT25 410 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 GUCY1A2P33402 732 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 ITPK1Q13572 414 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 EMBQ6PCB8 327 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 SCYL3Q8IZE3 742 aa11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
ZNF548-202ENST00000366197 LRGUKQ96M69 825 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms