RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 CENPPQ6IPU0 288 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 DEFB118Q96PH6 123 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 UBE4BO95155 1302 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 NRCAMQ92823 1304 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 CLCN3P51790 818 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 ALCAMQ13740 583 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 TTI2Q6NXR4 508 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KSR1Q8IVT5 923 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 TSG101Q99816 390 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KCNA1Q09470 495 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
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HOXA4-201ENST00000360046 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 BRCA2P51587 3418 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R37O75864 691 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 HOXD13P35453 343 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 NAMPTP43490 491 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC63Q05C16 580 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 DEPTORQ8TB45 409 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 TMOD1P28289 359 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 STRA6Q9BX79 667 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 DENND3A2RUS2 1198 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 CAPSQ13938 189 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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HOXA4-201ENST00000360046 H0YCG3 227 aa24.06■■□□□ 1.44
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HOXA4-201ENST00000360046 GTF2BQ00403 316 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF333Q96JL9 665 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ACCSQ96QU6 501 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 AKT3Q9Y243 479 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ACLYP53396 1101 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 MAP7D2Q96T17 732 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 GNAT1P11488 350 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ATP1A3P13637 1013 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 RNF149Q8NC42 400 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 NLRP4Q96MN2 994 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM206Q9H813 350 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 TBX20Q9UMR3 447 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 KBTBD13C9JR72 458 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 PDXKO00764 312 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 TFDP1Q14186 410 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 ARMC5Q96C12 935 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 HVCN1Q96D96 273 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA4-201ENST00000360046 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
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