RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 MYL7Q01449 175 aa23.31■■□□□ 1.32
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PTDSS1-201ENST00000337004 GPR88Q9GZN0 384 aa23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1-201ENST00000337004 CARD9Q9H257 536 aa23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTDSS1-201ENST00000337004 DPH5Q9H2P9 285 aa23.29■■□□□ 1.32
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.29■■□□□ 1.32
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PTDSS1-201ENST00000337004 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.27■■□□□ 1.32
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PTDSS1-201ENST00000337004 AGPAT1Q99943 283 aa23.27■■□□□ 1.32
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PTDSS1-201ENST00000337004 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.26■■□□□ 1.31
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PTDSS1-201ENST00000337004 ICE2Q659A1 982 aa23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 ERP44Q9BS26 406 aa23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 LXNQ9BS40 222 aa23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM51Q9BSJ1 452 aa23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM187AA6NFU0 413 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-201ENST00000337004 HIP1RO75146 1068 aa23.25■■□□□ 1.31
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