RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.9■■□□□ 1.42
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PTPRM-201ENST00000332175 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
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PTPRM-201ENST00000332175 LY9Q9HBG7 655 aa23.9■■□□□ 1.42
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PTPRM-201ENST00000332175 H3BRJ5 948 aa23.86■■□□□ 1.41
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PTPRM-201ENST00000332175 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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PTPRM-201ENST00000332175 F5H6K3 240 aa23.86■■□□□ 1.41
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PTPRM-201ENST00000332175 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
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PTPRM-201ENST00000332175 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 PODNQ7Z5L7 613 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINI1Q99574 410 aa23.86■■□□□ 1.41
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