RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 TAPT1Q6NXT6 567 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 C12orf56Q8IXR9 622 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 SLC7A3Q8WY07 619 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 GLG1Q92896 1179 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 IFT74Q96LB3 600 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 VTA1Q9NP79 307 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 EXOC7Q9UPT5 735 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 TISP43B9A030 160 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 LGR5O75473 907 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 CCDC175P0C221 793 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 CPA4Q9UI42 421 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 KCNG1Q9UIX4 513 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ADGRG1Q9Y653 693 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 RFC5P40937 340 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 TMEM143Q96AN5 459 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 FAM167AQ96KS9 214 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 NOL4O94818 638 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 TRIM50Q86XT4 487 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 RDH13Q8NBN7 331 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 MAML3Q96JK9 1138 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 MARK3P27448 753 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ARL2P36404 184 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 PPP2R5AQ15172 486 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 RRAGAQ7L523 313 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 BAP1Q92560 729 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 KATNBL1Q9H079 304 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 CEP72Q9P209 647 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 PPME1Q9Y570 386 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 EMSYQ7Z589 1322 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 PASKQ96RG2 1323 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 H0YCG3 227 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 CNGA1P29973 690 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ABCD1P33897 745 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 LAMC2Q13753 1193 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ZNF592Q92610 1267 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 TUBB4AP04350 444 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 SLC26A2P50443 739 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 CDK17Q00537 523 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP1Q07960 439 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-201ENST00000331803 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 LRRC53A6NM62 1247 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 NDUFA10O95299 355 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GH1P01241 217 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SLC10A3P09131 477 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 SLC9A1P19634 815 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GLRA2P23416 452 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ADSSP30520 456 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 INHBEP58166 350 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 BFSP1Q12934 665 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 PLCB4Q15147 1175 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 GBP6Q6ZN66 633 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 TINF2Q9BSI4 451 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 PON1P27169 355 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 NAMPTP43490 491 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 APBA1Q02410 837 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 PDXDC1Q6P996 788 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 IFNL1Q8IU54 200 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-201ENST00000331803 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms