RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311034.6

NPAS4-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS4, Length 3,303 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS4-201ENST00000311034 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.65□□□□□ -0.06
NPAS4-201ENST00000311034 THAP2Q9H0W7 228 aa14.65□□□□□ -0.06
NPAS4-201ENST00000311034 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NPAS4-201ENST00000311034 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NPAS4-201ENST00000311034 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 YY1P25490 414 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 SLFN13Q68D06 897 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 JAMLQ86YT9 394 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 CCDC169A6NNP5 214 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 COG2Q14746 738 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ARSHQ5FYA8 562 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 BTBD6Q96KE9 485 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ERP44Q9BS26 406 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 USTQ9Y2C2 406 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 TISP43B9A030 160 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 SERPINB2P05120 415 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 MARCKSL1P49006 195 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 LONRF1Q17RB8 773 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 DPH6Q7L8W6 267 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 MIEF2Q96C03 454 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 TMEM150BA6NC51 233 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 KCNJ2P63252 427 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 PRKG1Q13976 671 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 UBOX5O94941 541 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 PALB2Q86YC2 1186 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ITGB4P16144 1822 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 A8MUI8 341 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 RASGRF2O14827 1237 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 FERP16591 822 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 EPHA7Q15375 998 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ERMNQ8TAM6 284 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ALG3Q92685 438 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 KRT35Q92764 455 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ANO3Q9BYT9 981 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 POLLQ9UGP5 575 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ESYT2A0FGR8 921 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 SPOPO43791 374 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 DIAPH2O60879 1101 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 GIT2Q14161 759 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 TNIP1Q15025 636 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 EMC10Q5UCC4 262 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 RFFLQ8WZ73 363 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 KLHL29Q96CT2 875 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 ECT2Q9H8V3 914 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 GGA2Q9UJY4 613 aa14.62□□□□□ -0.07
NPAS4-201ENST00000311034 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms