RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ETNK1Q9HBU6 452 aa25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP73A6NFT4 308 aa25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP26B1Q9NR63 512 aa25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SUSD4Q5VX71 490 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 LRFN2Q9ULH4 789 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1586Q9HCI6 787 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 E2F6O75461 281 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC27P30260 824 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 PADI6Q6TGC4 694 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM47Q9BQJ4 181 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF217Q8TC41 542 aa25.75■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 TXNRD1Q16881 649 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 PPM1NQ8N819 430 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 COG1Q8WTW3 980 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ING2Q9H160 280 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 DSTYKQ6XUX3 929 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD6Q96KE9 485 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FRA10AC1Q70Z53 315 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE4BO95155 1302 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT14P02533 472 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 GPS1Q13098 491 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 DRP2Q13474 957 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBED8Q8IZ13 594 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 NDE1Q9NXR1 346 aa25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 GRAPQ13588 217 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FTLP02792 175 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 RCAN1P53805 252 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD23BP54727 409 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF699Q32M78 642 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM260Q9NX78 707 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC13A4Q9UKG4 626 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 POTEB3A0JP26 581 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 POTECB2RU33 542 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 VAMP7P51809 220 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 POTEBQ6S5H4 581 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SYCE1LA8MT33 242 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR1Q13613 665 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.73■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 DIAPH2O60879 1101 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 NMT2O60551 498 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SHC4Q6S5L8 630 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQC6 194 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC16A4O15374 487 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX2O60749 519 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 MORF4L2Q15014 288 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 RASSF3Q86WH2 238 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR24Q96S15 920 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMD9Q5K651 1589 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 BAG6P46379 1132 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 GUCY1A3Q02108 690 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FSD1LQ9BXM9 530 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 KLC4Q9NSK0 619 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN3O15551 220 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 PDXDC1Q6P996 788 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 CPVLQ9H3G5 476 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 HACD3Q9P035 362 aa25.72■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX5Q9Y5X3 404 aa25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF28PB7ZC32 967 aa25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms