RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 MYBL1P10243 752 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D25Q3MII6 688 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 TMX2Q9Y320 296 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 STK24Q9Y6E0 443 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 EPHB4P54760 987 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 FAM151AQ8WW52 585 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 GOPCQ9HD26 462 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 CNTNAP1P78357 1384 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 FAM170AA1A519 330 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 FAM153BP0C7A2 387 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 RXRBP28702 533 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 PAFAH1B1P43034 410 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 XRCC4Q13426 336 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 DLGAP5Q15398 846 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 FAM153CQ494X1 144 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 STK32BQ9NY57 414 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 MYBP10242 640 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 SLC9A1P19634 815 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 ASIC2Q16515 512 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 C8orf74Q6P047 294 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 ZNF570Q96NI8 536 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 SPAG5Q96R06 1193 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 BATF3Q9NR55 127 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 STIM2Q9P246 746 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 GGA2Q9UJY4 613 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 ANP32DO95626 131 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 PYGLP06737 847 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 RSPH10BP0C881 870 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 CCDC174Q6PII3 467 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 GMLQ99445 158 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 EBF2Q9HAK2 575 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 EML1O00423 815 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 PDXKO00764 312 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 CFBP00751 764 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 C15orf41Q9Y2V0 281 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 WDR18Q9BV38 432 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 RNF14Q9UBS8 474 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 EMBQ6PCB8 327 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 IQCKQ8N0W5 287 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 ASTN1O14525 1302 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 AKAP3O75969 853 aa21.83■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 GLI1P08151 1106 aa21.83■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 TNFRSF8P28908 595 aa21.83■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 KCNA1Q09470 495 aa21.83■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 CFAP58Q5T655 872 aa21.83■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.83■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HPS6-201ENST00000299238 UCHL3P15374 230 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 PTK2Q05397 1052 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R7Q15435 360 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 OGFOD1Q8N543 542 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 TTLL6Q8N841 843 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 TCP11Q8WWU5 503 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 RGL1Q9NZL6 768 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 SFI1A8K8P3 1242 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 PON1P27169 355 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms