RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 GRM1Q13255 1194 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 IFNL1Q8IU54 200 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 CHP1Q99653 195 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 ARID3AQ99856 593 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 TBX20Q9UMR3 447 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGAP1Q07960 439 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 RETREG2Q8NC44 543 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 DNAJC7Q99615 494 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 VTA1Q9NP79 307 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 KCND1Q9NSA2 647 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 CENPFP49454 3210 aa23.16■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 LGR5O75473 907 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 FECHP22830 423 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 SLC35C1Q96A29 364 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 EXOC3O60645 756 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 WDR59Q6PJI9 974 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.14■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 DRP2Q13474 957 aa23.14■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 FIGNQ5HY92 759 aa23.14■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 TINF2Q9BSI4 451 aa23.14■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.14■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.14■■□□□ 1.3
RFXAP-201ENST00000255476 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.14■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ZBED6P86452 979 aa23.14■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 IFT74Q96LB3 600 aa23.14■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 RTP1P59025 263 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 PLCB4Q15147 1175 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 USP20Q9Y2K6 914 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 TNNT1P13805 278 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 GLRA2P23416 452 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 SLC9A9Q8IVB4 645 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 NEK11Q8NG66 645 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.13■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 A0A1W2PQJ5 194 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 KIF3CO14782 793 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 TLR2O60603 784 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 NOL4O94818 638 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 C17orf99Q6UX52 265 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 HSPBP1Q9NZL4 362 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 EMSYQ7Z589 1322 aa23.12■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM49P0CI25 452 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM49CP0CI26 452 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ADSSP30520 456 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ARL2P36404 184 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 AFG1LQ8WV93 481 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 FAM167AQ96KS9 214 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 A0A0U1RQJ8 604 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 GH1P01241 217 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ACTN1P12814 892 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 SLC9A1P19634 815 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 CNGA1P29973 690 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 LAMC2Q13753 1193 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 PTPN14Q15678 1187 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 MORN1Q5T089 497 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.11■■□□□ 1.29
RFXAP-201ENST00000255476 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms