RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 SIP14410 1827 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 RFC2P35250 354 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 ASIC1P78348 528 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 MAPK7Q13164 816 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 DRP2Q13474 957 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 FAM26DQ5JW98 314 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA20Q8TB22 786 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM143Q96AN5 459 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 SCLT1Q96NL6 688 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 GINS2Q9Y248 185 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 KLRC4O43908 158 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 HIP1RO75146 1068 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 CHRNA1P02708 482 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 MGAT3Q09327 533 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 DAW1Q8N136 415 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 SMC2O95347 1197 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF131P52739 623 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 KIZQ2M2Z5 673 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 UNC13DQ70J99 1090 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 IDEP14735 1019 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 CDC42EP1Q00587 391 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 TET1Q8NFU7 2136 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 NLRP7Q8WX94 980 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 KIFAP3Q92845 792 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 SMARCE1Q969G3 411 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 DRC1Q96MC2 740 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 GSDMAQ96QA5 445 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 POLD4Q9HCU8 107 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 IL23AQ9NPF7 189 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 PANK4Q9NVE7 773 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD11-201ENST00000249504 SYCE3A1L190 88 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 FAM13AO94988 1023 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PFKMP08237 780 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ARL2P36404 184 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 GPC3P51654 580 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 MBTPS1Q14703 1052 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 NLRP4Q96MN2 994 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 OSMRQ99650 979 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ASAP2O43150 1006 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 NBNO60934 754 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 GPR32O75388 356 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ACRP10323 421 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 GHRP10912 638 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 EHHADHQ08426 723 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 COASYQ13057 564 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 KCNB1Q14721 858 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 GDF15Q99988 308 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PARVGQ9HBI0 331 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 SFI1A8K8P3 1242 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 GAP43P17677 238 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF410Q86VK4 478 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 RMND1Q9NWS8 449 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 RHOBTB3O94955 611 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 CXCL10P02778 98 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PLS3P13797 630 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 TFDP1Q14186 410 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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