RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 POTEFA5A3E0 1075 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 POTEIP0CG38 1075 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 SOX5P35711 763 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 PTGER2P43116 358 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 CHADLQ6NUI6 762 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 POTEGQ6S5H5 508 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 REEP2Q9BRK0 252 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 AZI2Q9H6S1 392 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC17-201ENST00000249377 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 VCAM1P19320 739 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GBP1P32455 592 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PTGIRP43119 386 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CASP4P49662 377 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CNBD1Q8NA66 436 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 HOOK2Q96ED9 719 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ZBTB5O15062 677 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ALADP13716 330 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 STAT3P40763 770 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SLC8A3P57103 927 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GABPAQ06546 454 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SLC29A2Q14542 456 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GLG1Q92896 1179 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 STK33Q9BYT3 514 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GOPCQ9HD26 462 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GAKO14976 1311 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 A0A1B0GUA9 196 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PHF2O75151 1096 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PLTPP55058 493 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PSMC6P62333 389 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GPR88Q9GZN0 384 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SNX24Q9Y343 169 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RTN2O75298 545 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TTLL1O95922 423 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 HSPA6P17066 643 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 RPA1P27694 616 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CHRNA3P32297 505 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 COPB2P35606 906 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 NFIL3Q16649 462 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 SLC51AQ86UW1 340 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ALG3Q92685 438 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 PARP2Q9UGN5 583 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ALAS1P13196 640 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 AKR1B1P15121 316 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CTNNA2P26232 953 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CNGA2Q16280 664 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 ACCSLQ4AC99 568 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 MFSD5Q6N075 450 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC17-201ENST00000249377 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms