RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 NF2P35240 595 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 IQCEQ6IPM2 695 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 BSNDQ8WZ55 320 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 RABGGTAQ92696 567 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.18■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 ATG7O95352 703 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 FAM228BP0C875 321 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 KIFAP3Q92845 792 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 CCDC169A6NNP5 214 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 MOCS3O95396 460 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 SMTNP53814 917 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 MOGSQ13724 837 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 TBX20Q9UMR3 447 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 ARID3AQ99856 593 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 KRT13P13646 458 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 ATP4AP20648 1035 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 CLCN6P51797 869 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 PPIL2Q13356 520 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 HVCN1Q96D96 273 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 MAPK13O15264 365 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 SRGAP2O75044 1071 aa20.15■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 VAMP7P51809 220 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 MYL7Q01449 175 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 XKR3Q5GH77 459 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 LMO3Q8TAP4 145 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC11-201ENST00000243082 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.15■□□□□ 0.82
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HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 CTAGE8P0CG41 777 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC11-201ENST00000243082 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.14■□□□□ 0.81
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