RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 CREB3O43889 395 aa21.53■■□□□ 1.04
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HOXC13-201ENST00000243056 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC13-201ENST00000243056 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.53■■□□□ 1.04
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HOXC13-201ENST00000243056 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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HOXC13-201ENST00000243056 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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HOXC13-201ENST00000243056 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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HOXC13-201ENST00000243056 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.5■■□□□ 1.03
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HOXC13-201ENST00000243056 MYH10P35580 1976 aa21.49■■□□□ 1.03
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HOXC13-201ENST00000243056 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXC13-201ENST00000243056 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXC13-201ENST00000243056 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.49■■□□□ 1.03
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HOXC13-201ENST00000243056 PREBQ9HCU5 417 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXC13-201ENST00000243056 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXC13-201ENST00000243056 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXC13-201ENST00000243056 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXC13-201ENST00000243056 SOCS7O14512 581 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXC13-201ENST00000243056 SHBGP04278 402 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXC13-201ENST00000243056 ERVK-9P63128 1117 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXC13-201ENST00000243056 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
HOXC13-201ENST00000243056 NELFBQ8WX92 580 aa21.47■■□□□ 1.03
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