RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx10Q9CWT3 201 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cfap57Q9D180 1249 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Llcfc1Q9D9P8 108 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cpne8Q9DC53 577 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scgb2b20Q9JI02 112 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp2ab1S4R196 498 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SynrgQ5SV85 1306 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Astn1Q61137 1302 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbf1A2A870 1173 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xrcc6P23475 608 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tas2r134Q7TQB0 298 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nemp2Q8CB65 421 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Entpd5Q9WUZ9 427 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Heatr4E9Q357 955 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif5bQ61768 963 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssxb10Q6XAR7 170 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc25Q78PG9 208 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HhatQ8BMT9 499 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Reep2Q8VCD6 254 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx24Q9CRB0 169 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Irx5Q9JKQ4 484 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psme4Q5SSW2 1843 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp2c2A7L9Z8 944 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hspa1lP16627 641 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oca2Q62052 833 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Efcab14Q8BGQ6 484 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Als2cr12Q8BVM7 383 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PaoxQ8C0L6 504 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klhl36Q8R124 613 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trex1Q91XB0 314 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r77L7N2B7 854 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AfpP02772 605 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ercc5P35689 1170 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phactr1Q2M3X8 580 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psmd1Q3TXS7 953 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttf2Q5NC05 1138 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gas7Q60780 421 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8BGD0 127 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kat5Q8CHK4 513 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Appl2Q8K3G9 662 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 OtoaQ8K561 1137 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdha5Q91Y15 934 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grhl1Q921D9 618 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Extl2Q9ES89 330 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chmp6P0C0A3 200 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CatspereP0DP43 985 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pon1P52430 355 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp3caP63328 521 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MaeaQ4VC33 396 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf652Q5DU09 608 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp13a3Q5XF89 1219 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb7bQ64321 544 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ece2Q80Z60 881 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc45Q8CIM1 670 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ly75Q60767 1723 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Skor2A7M7C7 1008 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyb5rlB1AS42 316 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hsf3D0VYS2 492 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3127E9Q9P5 263 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3453K7N724 263 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Barx2O08686 283 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EsrrbQ61539 433 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plcg2Q8CIH5 1265 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnm1lQ8K1M6 742 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpsm2Q8VDU0 679 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q922C1 641 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ambra1A2AH22 1300 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pdk4O70571 412 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tigd5Q499M4 642 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rccd1Q8BTU7 377 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Iws1Q8C1D8 766 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Calcoco1Q8CGU1 691 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Med24Q99K74 987 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cabp5Q9JLK3 173 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Magea4F2Z493 315 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnajb6O54946 365 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 VimP20152 466 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Shox2P70390 331 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q3TTJ4 293 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cracr2aQ3UP38 310 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klra6Q60653 266 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp1r1bQ60829 194 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxo10Q7TQF2 950 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gprc5cQ8K3J9 440 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MlxiplQ99MZ3 864 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.2 ms