RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640726.1

SLC35A3-223, Transcript of solute carrier family 35 member A3, human

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,636 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC35A3-223	ENST00000640726	GGT6	Q6P531	493 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SLC35A3-223	ENST00000640726	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.73
SLC35A3-223	ENST00000640726	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SLC35A3-223	ENST00000640726	UNC13B	O14795	1591 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SLC35A3-223	ENST00000640726	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.04	■■■□□ 2.72
SLC35A3-223	ENST00000640726	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SLC35A3-223	ENST00000640726	MLEC	Q14165	292 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SLC35A3-223	ENST00000640726	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SLC35A3-223	ENST00000640726	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
SLC35A3-223	ENST00000640726	NUP155	O75694	1391 aa		32	■■■□□ 2.71
SLC35A3-223	ENST00000640726	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32	■■■□□ 2.71
SLC35A3-223	ENST00000640726	KANK1	Q14678	1352 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SLC35A3-223	ENST00000640726	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.95	■■■□□ 2.7
SLC35A3-223	ENST00000640726	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SLC35A3-223	ENST00000640726	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SLC35A3-223	ENST00000640726	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SLC35A3-223	ENST00000640726	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SLC35A3-223	ENST00000640726	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
SLC35A3-223	ENST00000640726	PZP	P20742	1482 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SLC35A3-223	ENST00000640726	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
SLC35A3-223	ENST00000640726	ABCC3	O15438	1527 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SLC35A3-223	ENST00000640726	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
SLC35A3-223	ENST00000640726	CEP152	O94986	1710 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SLC35A3-223	ENST00000640726	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SLC35A3-223	ENST00000640726	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SLC35A3-223	ENST00000640726	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SLC35A3-223	ENST00000640726	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SLC35A3-223	ENST00000640726	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SLC35A3-223	ENST00000640726	TET3	O43151	1660 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SLC35A3-223	ENST00000640726	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SLC35A3-223	ENST00000640726	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SLC35A3-223	ENST00000640726	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SLC35A3-223	ENST00000640726	PKD2	Q13563	968 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SLC35A3-223	ENST00000640726	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SLC35A3-223	ENST00000640726	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SLC35A3-223	ENST00000640726	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SLC35A3-223	ENST00000640726	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SLC35A3-223	ENST00000640726	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SLC35A3-223	ENST00000640726		E9PCH4	1651 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SLC35A3-223	ENST00000640726	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
SLC35A3-223	ENST00000640726	NPAT	Q14207	1427 aa		31.7	■■■□□ 2.66
SLC35A3-223	ENST00000640726	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SLC35A3-223	ENST00000640726	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SLC35A3-223	ENST00000640726	FOXD1	Q16676	465 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SLC35A3-223	ENST00000640726	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.64	■■■□□ 2.65
SLC35A3-223	ENST00000640726	C3	P01024	1663 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SLC35A3-223	ENST00000640726	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
SLC35A3-223	ENST00000640726	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
SLC35A3-223	ENST00000640726	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
SLC35A3-223	ENST00000640726	PTPRM	P28827	1452 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SLC35A3-223	ENST00000640726	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SLC35A3-223	ENST00000640726	PTPRT	O14522	1441 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SLC35A3-223	ENST00000640726	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SLC35A3-223	ENST00000640726	NOS1	P29475	1434 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SLC35A3-223	ENST00000640726	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SLC35A3-223	ENST00000640726	ERVK-7	P63135	1459 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SLC35A3-223	ENST00000640726	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SLC35A3-223	ENST00000640726	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SLC35A3-223	ENST00000640726	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SLC35A3-223	ENST00000640726	TRPM2	O94759	1503 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SLC35A3-223	ENST00000640726	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SLC35A3-223	ENST00000640726	SYNM	O15061	1565 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SLC35A3-223	ENST00000640726	TNR	Q92752	1358 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SLC35A3-223	ENST00000640726	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
SLC35A3-223	ENST00000640726	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.45	■■■□□ 2.62
SLC35A3-223	ENST00000640726	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SLC35A3-223	ENST00000640726	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SLC35A3-223	ENST00000640726	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SLC35A3-223	ENST00000640726	CLTCL1	P53675	1640 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SLC35A3-223	ENST00000640726	IDI1	Q13907	227 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SLC35A3-223	ENST00000640726	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SLC35A3-223	ENST00000640726	NLRP1	Q9C000	1473 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SLC35A3-223	ENST00000640726	NEUROD1	Q13562	356 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SLC35A3-223	ENST00000640726	KIF1B	O60333	1816 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SLC35A3-223	ENST00000640726	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SLC35A3-223	ENST00000640726	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
SLC35A3-223	ENST00000640726	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SLC35A3-223	ENST00000640726	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	RGL3	Q3MIN7	710 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SLC35A3-223	ENST00000640726	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
SLC35A3-223	ENST00000640726	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
SLC35A3-223	ENST00000640726	TONSL	Q96HA7	1378 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SLC35A3-223	ENST00000640726	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SLC35A3-223	ENST00000640726	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SLC35A3-223	ENST00000640726	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SLC35A3-223	ENST00000640726	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SLC35A3-223	ENST00000640726	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SLC35A3-223	ENST00000640726	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SLC35A3-223	ENST00000640726	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
SLC35A3-223	ENST00000640726	SLIT1	O75093	1534 aa		31.05	■■■□□ 2.56

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