RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 CERKQ8TCT0 537 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRVP-204ENST00000639439 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRVP-204ENST00000639439 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRVP-204ENST00000639439 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRVP-204ENST00000639439 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRVP-204ENST00000639439 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRVP-204ENST00000639439 PZPP20742 1482 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
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PTPRVP-204ENST00000639439 ABCC5O15440 1437 aa24.2■■□□□ 1.46
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PTPRVP-204ENST00000639439 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.2■■□□□ 1.46
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PTPRVP-204ENST00000639439 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRVP-204ENST00000639439 TNRQ92752 1358 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRVP-204ENST00000639439 PLA2R1Q13018 1463 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRVP-204ENST00000639439 PKD2Q13563 968 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRVP-204ENST00000639439 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRVP-204ENST00000639439 KIF15Q9NS87 1388 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRVP-204ENST00000639439 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRVP-204ENST00000639439 DAPK1P53355 1430 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRVP-204ENST00000639439 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRVP-204ENST00000639439 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRVP-204ENST00000639439 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRVP-204ENST00000639439 ERBINQ96RT1 1412 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRVP-204ENST00000639439 ABCC3O15438 1527 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRVP-204ENST00000639439 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRVP-204ENST00000639439 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRVP-204ENST00000639439 NLRP1Q9C000 1473 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRVP-204ENST00000639439 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.08■■□□□ 1.45
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PTPRVP-204ENST00000639439 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRVP-204ENST00000639439 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRVP-204ENST00000639439 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRVP-204ENST00000639439 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRVP-204ENST00000639439 KANK1Q14678 1352 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRVP-204ENST00000639439 ERVK-7P63135 1459 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ADGRL2O95490 1459 aa24■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 CEP152O94986 1710 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 DEPDC5O75140 1603 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.433e-6■■■■□ 26.4
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRVP-204ENST00000639439 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRVP-204ENST00000639439 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRVP-204ENST00000639439 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRVP-204ENST00000639439 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRVP-204ENST00000639439 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRVP-204ENST00000639439 MED14O60244 1454 aa23.89■■□□□ 1.42
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PTPRVP-204ENST00000639439 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRVP-204ENST00000639439 ROCK1Q13464 1354 aa23.85■■□□□ 1.41
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PTPRVP-204ENST00000639439 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 IQGAP1P46940 1657 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 SLIT1O75093 1534 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 NOS1P29475 1434 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 EID1Q9Y6B2 187 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 IDI1Q13907 227 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRVP-204ENST00000639439 PIK3C2BO00750 1634 aa23.75■■□□□ 1.39
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PTPRVP-204ENST00000639439 ITGAEP38570 1179 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRVP-204ENST00000639439 UNC13BO14795 1591 aa23.73■■□□□ 1.39
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PTPRVP-204ENST00000639439 ADGRB3O60242 1522 aa23.68■■□□□ 1.38
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PTPRVP-204ENST00000639439 NUP155O75694 1391 aa23.65■■□□□ 1.38
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PTPRVP-204ENST00000639439 E9PCH4 1651 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRVP-204ENST00000639439 PIP4K2BP78356 416 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRVP-204ENST00000639439 ZFYVE9O95405 1425 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRVP-204ENST00000639439 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRVP-204ENST00000639439 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRVP-204ENST00000639439 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRVP-204ENST00000639439 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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