RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637315.1

EFHC1-231, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 3

Gene EFHC1, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-231	ENST00000637315	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		18.64	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	18.63	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		18.62	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	NPAT	Q14207	1427 aa		18.61	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	PTPRK	Q15262	1439 aa		18.61	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		18.6	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	MROH2A	A6NES4	1674 aa		18.6	■□□□□ 0.57
EFHC1-231	ENST00000637315	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		18.57	■□□□□ 0.56
EFHC1-231	ENST00000637315	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		18.57	■□□□□ 0.56
EFHC1-231	ENST00000637315	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		18.57	■□□□□ 0.56
EFHC1-231	ENST00000637315	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	18.56	■□□□□ 0.56
EFHC1-231	ENST00000637315	ADGRL2	O95490	1459 aa		18.56	■□□□□ 0.56
EFHC1-231	ENST00000637315	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
EFHC1-231	ENST00000637315	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
EFHC1-231	ENST00000637315	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		18.52	■□□□□ 0.56
EFHC1-231	ENST00000637315	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		18.52	■□□□□ 0.56
EFHC1-231	ENST00000637315	PZP	P20742	1482 aa		18.52	■□□□□ 0.55
EFHC1-231	ENST00000637315	ABCC3	O15438	1527 aa		18.51	■□□□□ 0.55
EFHC1-231	ENST00000637315	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		18.51	■□□□□ 0.55
EFHC1-231	ENST00000637315	ROCK1	Q13464	1354 aa		18.51	■□□□□ 0.55
EFHC1-231	ENST00000637315	KANK1	Q14678	1352 aa		18.51	■□□□□ 0.55
EFHC1-231	ENST00000637315	TNR	Q92752	1358 aa		18.51	■□□□□ 0.55
EFHC1-231	ENST00000637315	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
EFHC1-231	ENST00000637315	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		18.49	■□□□□ 0.55
EFHC1-231	ENST00000637315	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		18.47	■□□□□ 0.55
EFHC1-231	ENST00000637315	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		18.43	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		18.43	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	CEP152	O94986	1710 aa		18.43	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	STRC	Q7RTU9	1775 aa		18.42	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	DEPDC5	O75140	1603 aa		18.42	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		18.42	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		18.42	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	ERVK-7	P63135	1459 aa		18.41	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	PKD2	Q13563	968 aa		18.4	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	NLRP1	Q9C000	1473 aa		18.39	■□□□□ 0.54
EFHC1-231	ENST00000637315	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		18.39	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		18.38	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		18.38	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	IDI1	Q13907	227 aa		18.37	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		18.37	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	NUP155	O75694	1391 aa		18.37	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	PTPRT	O14522	1441 aa		18.37	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		18.35	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	PLA2R1	Q13018	1463 aa		18.35	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	NAIP	Q13075	1403 aa		18.34	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		18.34	■□□□□ 0.53
EFHC1-231	ENST00000637315	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	CERK	Q8TCT0	537 aa		18.32	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		18.31	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	NOS1	P29475	1434 aa		18.31	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		18.3	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	TRIM52	Q96A61	297 aa		18.3	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	UNC13B	O14795	1591 aa		18.3	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	LTK	P29376	864 aa		18.28	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		18.28	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	HFM1	A2PYH4	1435 aa		18.28	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
EFHC1-231	ENST00000637315	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	TET3	O43151	1660 aa		18.25	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	EID1	Q9Y6B2	187 aa		18.25	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	SYNM	O15061	1565 aa		18.25	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	FBXO41	Q8TF61	875 aa		18.24	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		18.23	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		18.22	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		18.22	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	PIK3C2B	O00750	1634 aa		18.22	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315		E9PCH4	1651 aa		18.21	■□□□□ 0.51
EFHC1-231	ENST00000637315	MED14	O60244	1454 aa		18.2	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		18.2	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		18.2	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		18.2	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	SLIT1	O75093	1534 aa		18.18	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		18.18	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	BCAN	Q96GW7	911 aa		18.15	■□□□□ 0.5
EFHC1-231	ENST00000637315	FOXD1	Q16676	465 aa		18.14	■□□□□ 0.49
EFHC1-231	ENST00000637315	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
EFHC1-231	ENST00000637315	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		18.14	■□□□□ 0.49
EFHC1-231	ENST00000637315	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		18.14	■□□□□ 0.49
EFHC1-231	ENST00000637315	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		18.14	■□□□□ 0.49
EFHC1-231	ENST00000637315	ADGRB3	O60242	1522 aa		18.13	■□□□□ 0.49
EFHC1-231	ENST00000637315	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
EFHC1-231	ENST00000637315	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
EFHC1-231	ENST00000637315	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	18.11	■□□□□ 0.49
EFHC1-231	ENST00000637315	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		18.11	■□□□□ 0.49

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