RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635970.1

CLN8-209, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 1,958 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-209ENST00000635970 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-209ENST00000635970 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CLN8-209ENST00000635970 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CLN8-209ENST00000635970 NEUROD1Q13562 356 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-209ENST00000635970 ROCK1Q13464 1354 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN8-209ENST00000635970 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CLN8-209ENST00000635970 KIF3BO15066 747 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN8-209ENST00000635970 ERBINQ96RT1 1412 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN8-209ENST00000635970 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN8-209ENST00000635970 GGT6Q6P531 493 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN8-209ENST00000635970 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CLN8-209ENST00000635970 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN8-209ENST00000635970 DEPDC5O75140 1603 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN8-209ENST00000635970 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN8-209ENST00000635970 MYT1Q01538 1121 aa22.72■■□□□ 1.23
CLN8-209ENST00000635970 PTPRMP28827 1452 aa22.71■■□□□ 1.23
CLN8-209ENST00000635970 CEP152O94986 1710 aa22.7■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 C3P01024 1663 aa22.69■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 NAIPQ13075 1403 aa22.68■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 MROH2AA6NES4 1674 aa22.67■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.66■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 HFM1A2PYH4 1435 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 UNC13BO14795 1591 aa22.65■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CLN8-209ENST00000635970 ABCC3O15438 1527 aa22.64■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.63■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.62■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.61■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.59■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 ZMYM3Q14202 1370 aa22.58■■□□□ 1.21
CLN8-209ENST00000635970 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-209ENST00000635970 KANK1Q14678 1352 aa22.54■■□□□ 1.2
CLN8-209ENST00000635970 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CLN8-209ENST00000635970 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-209ENST00000635970 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 TET3O43151 1660 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 PZPP20742 1482 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 NUP155O75694 1391 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 E9PCH4 1651 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 NPATQ14207 1427 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-209ENST00000635970 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.44■■□□□ 1.18
CLN8-209ENST00000635970 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.44■■□□□ 1.18
CLN8-209ENST00000635970 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CLN8-209ENST00000635970 ERVK-7P63135 1459 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-209ENST00000635970 TRIM52Q96A61 297 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-209ENST00000635970 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-209ENST00000635970 TNRQ92752 1358 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-209ENST00000635970 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CLN8-209ENST00000635970 SYNMO15061 1565 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-209ENST00000635970 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-209ENST00000635970 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-209ENST00000635970 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CLN8-209ENST00000635970 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CLN8-209ENST00000635970 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.35■■□□□ 1.17
CLN8-209ENST00000635970 NOS1P29475 1434 aa22.33■■□□□ 1.17
CLN8-209ENST00000635970 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CLN8-209ENST00000635970 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.32■■□□□ 1.16
CLN8-209ENST00000635970 PIK3C2BO00750 1634 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-209ENST00000635970 NLRP1Q9C000 1473 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-209ENST00000635970 HSPA2P54652 639 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-209ENST00000635970 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-209ENST00000635970 PKD2Q13563 968 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-209ENST00000635970 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-209ENST00000635970 FOXD1Q16676 465 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-209ENST00000635970 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.27■■□□□ 1.15
CLN8-209ENST00000635970 MIER1Q8N108 512 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-209ENST00000635970 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-209ENST00000635970 PTPRTO14522 1441 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-209ENST00000635970 TRPM2O94759 1503 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-209ENST00000635970 CLTCL1P53675 1640 aa22.23■■□□□ 1.15
CLN8-209ENST00000635970 PLA2R1Q13018 1463 aa22.23■■□□□ 1.15
CLN8-209ENST00000635970 IDI1Q13907 227 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-209ENST00000635970 ADGRB3O60242 1522 aa22.2■■□□□ 1.15
CLN8-209ENST00000635970 STRCQ7RTU9 1775 aa22.2■■□□□ 1.14
CLN8-209ENST00000635970 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CLN8-209ENST00000635970 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.18■■□□□ 1.14
CLN8-209ENST00000635970 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN8-209ENST00000635970 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CLN8-209ENST00000635970 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CLN8-209ENST00000635970 KIF1BO60333 1816 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-209ENST00000635970 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN8-209ENST00000635970 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CLN8-209ENST00000635970 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CLN8-209ENST00000635970 SLIT1O75093 1534 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-209ENST00000635970 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.1■■□□□ 1.13
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