RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619939.4

LHX1-204, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene LHX1, Length 1,840 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-204ENST00000619939 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.45■■□□□ 1.18
LHX1-204ENST00000619939 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
LHX1-204ENST00000619939 ADGRL2O95490 1459 aa22.44■■□□□ 1.18
LHX1-204ENST00000619939 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
LHX1-204ENST00000619939 NCOA1Q15788 1441 aa22.43■■□□□ 1.18
LHX1-204ENST00000619939 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.43■■□□□ 1.18
LHX1-204ENST00000619939 HRCP23327 699 aa22.43■■□□□ 1.18
LHX1-204ENST00000619939 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.43■■□□□ 1.18
LHX1-204ENST00000619939 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.4■■□□□ 1.18
LHX1-204ENST00000619939 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.36■■□□□ 1.17
LHX1-204ENST00000619939 CERKQ8TCT0 537 aa22.35■■□□□ 1.17
LHX1-204ENST00000619939 C3P01024 1663 aa22.35■■□□□ 1.17
LHX1-204ENST00000619939 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LHX1-204ENST00000619939 KIF15Q9NS87 1388 aa22.34■■□□□ 1.17
LHX1-204ENST00000619939 ATP7AQ04656 1500 aa22.34■■□□□ 1.17
LHX1-204ENST00000619939 NPATQ14207 1427 aa22.32■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 PLXNC1O60486 1568 aa22.31■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.31■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 MROH2AA6NES4 1674 aa22.31■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 A2MP01023 1474 aa22.31■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.3■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 TRIM52Q96A61 297 aa22.3■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 ZMYM3Q14202 1370 aa22.29■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 PTPRTO14522 1441 aa22.28■■□□□ 1.16
LHX1-204ENST00000619939 STRCQ7RTU9 1775 aa22.25■■□□□ 1.15
LHX1-204ENST00000619939 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.24■■□□□ 1.15
LHX1-204ENST00000619939 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.23■■□□□ 1.15
LHX1-204ENST00000619939 GGT6Q6P531 493 aa22.22■■□□□ 1.15
LHX1-204ENST00000619939 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LHX1-204ENST00000619939 ERBINQ96RT1 1412 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX1-204ENST00000619939 MYT1Q01538 1121 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX1-204ENST00000619939 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LHX1-204ENST00000619939 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX1-204ENST00000619939 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.14■■□□□ 1.14
LHX1-204ENST00000619939 PKD2Q13563 968 aa22.14■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 NUP155O75694 1391 aa22.14■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 PLA2R1Q13018 1463 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 KIF3BO15066 747 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 UNC13BO14795 1591 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 PZPP20742 1482 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX1-204ENST00000619939 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LHX1-204ENST00000619939 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.06■■□□□ 1.12
LHX1-204ENST00000619939 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LHX1-204ENST00000619939 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.04■■□□□ 1.12
LHX1-204ENST00000619939 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.04■■□□□ 1.12
LHX1-204ENST00000619939 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.04■■□□□ 1.12
LHX1-204ENST00000619939 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.03■■□□□ 1.12
LHX1-204ENST00000619939 FOXD1Q16676 465 aa22.03■■□□□ 1.12
LHX1-204ENST00000619939 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.01■■□□□ 1.11
LHX1-204ENST00000619939 NEUROD1Q13562 356 aa22.01■■□□□ 1.11
LHX1-204ENST00000619939 TNRQ92752 1358 aa22.01■■□□□ 1.11
LHX1-204ENST00000619939 DEPDC5O75140 1603 aa22■■□□□ 1.11
LHX1-204ENST00000619939 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22■■□□□ 1.11
LHX1-204ENST00000619939 KANK1Q14678 1352 aa21.99■■□□□ 1.11
LHX1-204ENST00000619939 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
LHX1-204ENST00000619939 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 NLRP1Q9C000 1473 aa21.95■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.94■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.93■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.92■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.9■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
LHX1-204ENST00000619939 TONSLQ96HA7 1378 aa21.88■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.88■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 TET3O43151 1660 aa21.88■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 ABCC3O15438 1527 aa21.85■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 CEP152O94986 1710 aa21.85■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.85■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.84■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 E9PCH4 1651 aa21.84■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LHX1-204ENST00000619939 CPS1P31327 1500 aa21.83■■□□□ 1.08
LHX1-204ENST00000619939 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.83■■□□□ 1.08
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LHX1-204ENST00000619939 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.81■■□□□ 1.08
LHX1-204ENST00000619939 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX1-204ENST00000619939 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.79■■□□□ 1.08
LHX1-204ENST00000619939 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX1-204ENST00000619939 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX1-204ENST00000619939 ERVK-7P63135 1459 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX1-204ENST00000619939 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LHX1-204ENST00000619939 TOM1O60784 492 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX1-204ENST00000619939 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX1-204ENST00000619939 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
LHX1-204ENST00000619939 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.72■■□□□ 1.07
LHX1-204ENST00000619939 TRPM2O94759 1503 aa21.72■■□□□ 1.07
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