RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CSAG3-202ENST00000617158 KIF3BO15066 747 aa31.19■■■□□ 2.58
CSAG3-202ENST00000617158 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.15■■■□□ 2.58
CSAG3-202ENST00000617158 PZPP20742 1482 aa31.14■■■□□ 2.58
CSAG3-202ENST00000617158 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.13■■■□□ 2.57
CSAG3-202ENST00000617158 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CSAG3-202ENST00000617158 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.09■■■□□ 2.57
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM52Q96A61 297 aa31.09■■■□□ 2.57
CSAG3-202ENST00000617158 NUP155O75694 1391 aa31.08■■■□□ 2.57
CSAG3-202ENST00000617158 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CSAG3-202ENST00000617158 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.07■■■□□ 2.56
CSAG3-202ENST00000617158 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.05■■■□□ 2.56
CSAG3-202ENST00000617158 GGT6Q6P531 493 aa31.04■■■□□ 2.56
CSAG3-202ENST00000617158 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CSAG3-202ENST00000617158 CEP152O94986 1710 aa31.02■■■□□ 2.56
CSAG3-202ENST00000617158 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.01■■■□□ 2.55
CSAG3-202ENST00000617158 ABCC3O15438 1527 aa30.98■■■□□ 2.55
CSAG3-202ENST00000617158 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.98■■■□□ 2.55
CSAG3-202ENST00000617158 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
CSAG3-202ENST00000617158 MLECQ14165 292 aa30.96■■■□□ 2.55
CSAG3-202ENST00000617158 TET3O43151 1660 aa30.95■■■□□ 2.55
CSAG3-202ENST00000617158 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
CSAG3-202ENST00000617158 KANK1Q14678 1352 aa30.93■■■□□ 2.54
CSAG3-202ENST00000617158 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CSAG3-202ENST00000617158 E9PCH4 1651 aa30.91■■■□□ 2.54
CSAG3-202ENST00000617158 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.9■■■□□ 2.54
CSAG3-202ENST00000617158 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CSAG3-202ENST00000617158 PKD2Q13563 968 aa30.89■■■□□ 2.54
CSAG3-202ENST00000617158 FOXD1Q16676 465 aa30.89■■■□□ 2.54
CSAG3-202ENST00000617158 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.89■■■□□ 2.54
CSAG3-202ENST00000617158 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.88■■■□□ 2.53
CSAG3-202ENST00000617158 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.88■■■□□ 2.53
CSAG3-202ENST00000617158 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.86■■■□□ 2.53
CSAG3-202ENST00000617158 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.82■■■□□ 2.52
CSAG3-202ENST00000617158 NPATQ14207 1427 aa30.81■■■□□ 2.52
CSAG3-202ENST00000617158 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CSAG3-202ENST00000617158 PLA2R1Q13018 1463 aa30.81■■■□□ 2.52
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.8■■■□□ 2.52
CSAG3-202ENST00000617158 MADDQ8WXG6 1647 aa30.8■■■□□ 2.52
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.79■■■□□ 2.52
CSAG3-202ENST00000617158 MROH2AA6NES4 1674 aa30.78■■■□□ 2.52
CSAG3-202ENST00000617158 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CSAG3-202ENST00000617158 PTPRTO14522 1441 aa30.74■■■□□ 2.51
CSAG3-202ENST00000617158 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.74■■■□□ 2.51
CSAG3-202ENST00000617158 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
CSAG3-202ENST00000617158 ZMYM3Q14202 1370 aa30.73■■■□□ 2.51
CSAG3-202ENST00000617158 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.73■■■□□ 2.51
CSAG3-202ENST00000617158 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
CSAG3-202ENST00000617158 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.7■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 C3P01024 1663 aa30.69■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 NOS1P29475 1434 aa30.69■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.69■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.67■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 TRPM2O94759 1503 aa30.67■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 SYNMO15061 1565 aa30.66■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 ERVK-7P63135 1459 aa30.65■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.63■■■□□ 2.49
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CSAG3-202ENST00000617158 CLTCL1P53675 1640 aa30.62■■■□□ 2.49
CSAG3-202ENST00000617158 PIK3C2BO00750 1634 aa30.58■■■□□ 2.49
CSAG3-202ENST00000617158 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.58■■■□□ 2.49
CSAG3-202ENST00000617158 PTPRMP28827 1452 aa30.54■■■□□ 2.48
CSAG3-202ENST00000617158 NEUROD1Q13562 356 aa30.52■■■□□ 2.48
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.52■■■□□ 2.48
CSAG3-202ENST00000617158 TNRQ92752 1358 aa30.48■■■□□ 2.47
CSAG3-202ENST00000617158 IDI1Q13907 227 aa30.47■■■□□ 2.47
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.46■■■□□ 2.47
CSAG3-202ENST00000617158 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.45■■■□□ 2.47
CSAG3-202ENST00000617158 KIF1BO60333 1816 aa30.43■■■□□ 2.46
CSAG3-202ENST00000617158 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.42■■■□□ 2.46
CSAG3-202ENST00000617158 ADGRB3O60242 1522 aa30.42■■■□□ 2.46
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.4■■■□□ 2.46
CSAG3-202ENST00000617158 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.4■■■□□ 2.46
CSAG3-202ENST00000617158 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.4■■■□□ 2.46
CSAG3-202ENST00000617158 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.38■■■□□ 2.45
CSAG3-202ENST00000617158 NLRP1Q9C000 1473 aa30.35■■■□□ 2.45
CSAG3-202ENST00000617158 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.34■■■□□ 2.45
CSAG3-202ENST00000617158 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
CSAG3-202ENST00000617158 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.33■■■□□ 2.45
CSAG3-202ENST00000617158 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.31■■■□□ 2.44
CSAG3-202ENST00000617158 TONSLQ96HA7 1378 aa30.3■■■□□ 2.44
CSAG3-202ENST00000617158 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
CSAG3-202ENST00000617158 RGL3Q3MIN7 710 aa30.3■■■□□ 2.44
CSAG3-202ENST00000617158 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.29■■■□□ 2.44
CSAG3-202ENST00000617158 IFT172Q9UG01 1749 aa30.29■■■□□ 2.44
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CSAG3-202ENST00000617158 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CSAG3-202ENST00000617158 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
CSAG3-202ENST00000617158 PPLO60437 1756 aa30.25■■■□□ 2.43
CSAG3-202ENST00000617158 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.24■■■□□ 2.43
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CSAG3-202ENST00000617158 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CSAG3-202ENST00000617158 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.18■■■□□ 2.42
CSAG3-202ENST00000617158 ZFYVE9O95405 1425 aa30.17■■■□□ 2.42
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CSAG3-202ENST00000617158 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.16■■■□□ 2.42
CSAG3-202ENST00000617158 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.16■■■□□ 2.42
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