RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616894.1

ATRNL1-210, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATRNL1, Length 1,701 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-210ENST00000616894 ADGRL2O95490 1459 aa35.4■■■■□ 3.26
ATRNL1-210ENST00000616894 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
ATRNL1-210ENST00000616894 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.38■■■■□ 3.25
ATRNL1-210ENST00000616894 ZMYM3Q14202 1370 aa35.38■■■■□ 3.25
ATRNL1-210ENST00000616894 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
ATRNL1-210ENST00000616894 ERBINQ96RT1 1412 aa35.36■■■■□ 3.25
ATRNL1-210ENST00000616894 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.36■■■■□ 3.25
ATRNL1-210ENST00000616894 ITGAEP38570 1179 aa35.35■■■■□ 3.25
ATRNL1-210ENST00000616894 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.34■■■■□ 3.25
ATRNL1-210ENST00000616894 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.34■■■■□ 3.25
ATRNL1-210ENST00000616894 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.33■■■■□ 3.25
ATRNL1-210ENST00000616894 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.3■■■■□ 3.24
ATRNL1-210ENST00000616894 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.3■■■■□ 3.24
ATRNL1-210ENST00000616894 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
ATRNL1-210ENST00000616894 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.29■■■■□ 3.24
ATRNL1-210ENST00000616894 CEP152O94986 1710 aa35.23■■■■□ 3.23
ATRNL1-210ENST00000616894 DEPDC5O75140 1603 aa35.23■■■■□ 3.23
ATRNL1-210ENST00000616894 ABCC3O15438 1527 aa35.23■■■■□ 3.23
ATRNL1-210ENST00000616894 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
ATRNL1-210ENST00000616894 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
ATRNL1-210ENST00000616894 ROCK1Q13464 1354 aa35.21■■■■□ 3.23
ATRNL1-210ENST00000616894 NPATQ14207 1427 aa35.21■■■■□ 3.23
ATRNL1-210ENST00000616894 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.2■■■■□ 3.23
ATRNL1-210ENST00000616894 HSPA2P54652 639 aa35.19■■■■□ 3.22
ATRNL1-210ENST00000616894 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.19■■■■□ 3.22
ATRNL1-210ENST00000616894 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.18■■■■□ 3.22
ATRNL1-210ENST00000616894 PZPP20742 1482 aa35.15■■■■□ 3.22
ATRNL1-210ENST00000616894 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.14■■■■□ 3.22
ATRNL1-210ENST00000616894 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
ATRNL1-210ENST00000616894 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.11■■■■□ 3.21
ATRNL1-210ENST00000616894 KANK1Q14678 1352 aa35.08■■■■□ 3.21
ATRNL1-210ENST00000616894 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
ATRNL1-210ENST00000616894 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.07■■■■□ 3.2
ATRNL1-210ENST00000616894 TNRQ92752 1358 aa35.02■■■■□ 3.2
ATRNL1-210ENST00000616894 UNC13BO14795 1591 aa35.02■■■■□ 3.2
ATRNL1-210ENST00000616894 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
ATRNL1-210ENST00000616894 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
ATRNL1-210ENST00000616894 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35■■■■□ 3.19
ATRNL1-210ENST00000616894 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.98■■■■□ 3.19
ATRNL1-210ENST00000616894 ERVK-7P63135 1459 aa34.97■■■■□ 3.19
ATRNL1-210ENST00000616894 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.96■■■■□ 3.19
ATRNL1-210ENST00000616894 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.96■■■■□ 3.19
ATRNL1-210ENST00000616894 NAIPQ13075 1403 aa34.94■■■■□ 3.18
ATRNL1-210ENST00000616894 STRCQ7RTU9 1775 aa34.93■■■■□ 3.18
ATRNL1-210ENST00000616894 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.93■■■■□ 3.18
ATRNL1-210ENST00000616894 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.92■■■■□ 3.18
ATRNL1-210ENST00000616894 TET3O43151 1660 aa34.88■■■■□ 3.17
ATRNL1-210ENST00000616894 HFM1A2PYH4 1435 aa34.88■■■■□ 3.17
ATRNL1-210ENST00000616894 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.87■■■■□ 3.17
ATRNL1-210ENST00000616894 NLRP1Q9C000 1473 aa34.87■■■■□ 3.17
ATRNL1-210ENST00000616894 NUP155O75694 1391 aa34.85■■■■□ 3.17
ATRNL1-210ENST00000616894 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.8■■■■□ 3.16
ATRNL1-210ENST00000616894 E9PCH4 1651 aa34.79■■■■□ 3.16
ATRNL1-210ENST00000616894 SYNMO15061 1565 aa34.77■■■■□ 3.16
ATRNL1-210ENST00000616894 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
ATRNL1-210ENST00000616894 PLA2R1Q13018 1463 aa34.76■■■■□ 3.16
ATRNL1-210ENST00000616894 NOS1P29475 1434 aa34.75■■■■□ 3.15
ATRNL1-210ENST00000616894 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.74■■■■□ 3.15
ATRNL1-210ENST00000616894 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.72■■■■□ 3.15
ATRNL1-210ENST00000616894 PIK3C2BO00750 1634 aa34.71■■■■□ 3.15
ATRNL1-210ENST00000616894 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
ATRNL1-210ENST00000616894 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.68■■■■□ 3.14
ATRNL1-210ENST00000616894 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
ATRNL1-210ENST00000616894 IDI1Q13907 227 aa34.66■■■■□ 3.14
ATRNL1-210ENST00000616894 TRIM52Q96A61 297 aa34.66■■■■□ 3.14
ATRNL1-210ENST00000616894 PKD2Q13563 968 aa34.64■■■■□ 3.14
ATRNL1-210ENST00000616894 PTPRTO14522 1441 aa34.64■■■■□ 3.14
ATRNL1-210ENST00000616894 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.6■■■■□ 3.13
ATRNL1-210ENST00000616894 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.58■■■■□ 3.13
ATRNL1-210ENST00000616894 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.58■■■■□ 3.13
ATRNL1-210ENST00000616894 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.13
ATRNL1-210ENST00000616894 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.57■■■■□ 3.12
ATRNL1-210ENST00000616894 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.56■■■■□ 3.12
ATRNL1-210ENST00000616894 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.56■■■■□ 3.12
ATRNL1-210ENST00000616894 ADGRB3O60242 1522 aa34.55■■■■□ 3.12
ATRNL1-210ENST00000616894 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.54■■■■□ 3.12
ATRNL1-210ENST00000616894 SLIT1O75093 1534 aa34.52■■■■□ 3.12
ATRNL1-210ENST00000616894 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.51■■■■□ 3.12
ATRNL1-210ENST00000616894 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
ATRNL1-210ENST00000616894 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.48■■■■□ 3.11
ATRNL1-210ENST00000616894 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.48■■■■□ 3.11
ATRNL1-210ENST00000616894 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.47■■■■□ 3.11
ATRNL1-210ENST00000616894 LTKP29376 864 aa34.47■■■■□ 3.11
ATRNL1-210ENST00000616894 MED14O60244 1454 aa34.46■■■■□ 3.11
ATRNL1-210ENST00000616894 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
ATRNL1-210ENST00000616894 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
ATRNL1-210ENST00000616894 IQGAP1P46940 1657 aa34.46■■■■□ 3.11
ATRNL1-210ENST00000616894 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.44■■■■□ 3.1
ATRNL1-210ENST00000616894 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
ATRNL1-210ENST00000616894 TRPM2O94759 1503 aa34.41■■■■□ 3.1
ATRNL1-210ENST00000616894 EID1Q9Y6B2 187 aa34.4■■■■□ 3.1
ATRNL1-210ENST00000616894 FOXD1Q16676 465 aa34.39■■■■□ 3.1
ATRNL1-210ENST00000616894 CLTCL1P53675 1640 aa34.39■■■■□ 3.1
ATRNL1-210ENST00000616894 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
ATRNL1-210ENST00000616894 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.38■■■■□ 3.09
ATRNL1-210ENST00000616894 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.37■■■■□ 3.09
ATRNL1-210ENST00000616894 ZFYVE9O95405 1425 aa34.33■■■■□ 3.09
ATRNL1-210ENST00000616894 CERKQ8TCT0 537 aa34.32■■■■□ 3.08
ATRNL1-210ENST00000616894 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.32■■■■□ 3.08
ATRNL1-210ENST00000616894 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
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