RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614051.1

CCL3-206, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3, Length 1,494 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3-206ENST00000614051 ERBINQ96RT1 1412 aa23.14■■□□□ 1.29
CCL3-206ENST00000614051 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.12■■□□□ 1.29
CCL3-206ENST00000614051 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CCL3-206ENST00000614051 HRCP23327 699 aa23.1■■□□□ 1.29
CCL3-206ENST00000614051 TRIM52Q96A61 297 aa23.09■■□□□ 1.29
CCL3-206ENST00000614051 KIF3BO15066 747 aa23.08■■□□□ 1.29
CCL3-206ENST00000614051 REREQ9P2R6 1566 aa23.07■■□□□ 1.28
CCL3-206ENST00000614051 UNC13BO14795 1591 aa23.06■■□□□ 1.28
CCL3-206ENST00000614051 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
CCL3-206ENST00000614051 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.05■■□□□ 1.28
CCL3-206ENST00000614051 DEPDC5O75140 1603 aa23.04■■□□□ 1.28
CCL3-206ENST00000614051 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.03■■□□□ 1.28
CCL3-206ENST00000614051 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CCL3-206ENST00000614051 NUP155O75694 1391 aa23.01■■□□□ 1.27
CCL3-206ENST00000614051 AGLP35573 1532 aa23■■□□□ 1.27
CCL3-206ENST00000614051 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCL3-206ENST00000614051 GGT6Q6P531 493 aa22.99■■□□□ 1.27
CCL3-206ENST00000614051 PZPP20742 1482 aa22.99■■□□□ 1.27
CCL3-206ENST00000614051 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.98■■□□□ 1.27
CCL3-206ENST00000614051 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.97■■□□□ 1.27
CCL3-206ENST00000614051 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CCL3-206ENST00000614051 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CCL3-206ENST00000614051 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.95■■□□□ 1.26
CCL3-206ENST00000614051 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.95■■□□□ 1.26
CCL3-206ENST00000614051 CEP152O94986 1710 aa22.95■■□□□ 1.26
CCL3-206ENST00000614051 MLECQ14165 292 aa22.94■■□□□ 1.26
CCL3-206ENST00000614051 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCL3-206ENST00000614051 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.94■■□□□ 1.26
CCL3-206ENST00000614051 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CCL3-206ENST00000614051 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCL3-206ENST00000614051 KANK1Q14678 1352 aa22.92■■□□□ 1.26
CCL3-206ENST00000614051 ABCC3O15438 1527 aa22.87■■□□□ 1.25
CCL3-206ENST00000614051 PKD2Q13563 968 aa22.87■■□□□ 1.25
CCL3-206ENST00000614051 TET3O43151 1660 aa22.86■■□□□ 1.25
CCL3-206ENST00000614051 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.86■■□□□ 1.25
CCL3-206ENST00000614051 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCL3-206ENST00000614051 E9PCH4 1651 aa22.85■■□□□ 1.25
CCL3-206ENST00000614051 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCL3-206ENST00000614051 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.84■■□□□ 1.25
CCL3-206ENST00000614051 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.83■■□□□ 1.25
CCL3-206ENST00000614051 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCL3-206ENST00000614051 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.81■■□□□ 1.24
CCL3-206ENST00000614051 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.78■■□□□ 1.24
CCL3-206ENST00000614051 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.74■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 NPATQ14207 1427 aa22.74■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 MADDQ8WXG6 1647 aa22.73■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.73■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.73■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.73■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 PTPRMP28827 1452 aa22.72■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 PLA2R1Q13018 1463 aa22.71■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 MROH2AA6NES4 1674 aa22.71■■□□□ 1.23
CCL3-206ENST00000614051 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.7■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.7■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 ZMYM3Q14202 1370 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 NEUROD1Q13562 356 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 C3P01024 1663 aa22.67■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 PTPRTO14522 1441 aa22.66■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 TRPM2O94759 1503 aa22.65■■□□□ 1.22
CCL3-206ENST00000614051 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CCL3-206ENST00000614051 SYNMO15061 1565 aa22.64■■□□□ 1.21
CCL3-206ENST00000614051 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.64■■□□□ 1.21
CCL3-206ENST00000614051 NOS1P29475 1434 aa22.63■■□□□ 1.21
CCL3-206ENST00000614051 CLTCL1P53675 1640 aa22.63■■□□□ 1.21
CCL3-206ENST00000614051 ERVK-7P63135 1459 aa22.63■■□□□ 1.21
CCL3-206ENST00000614051 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.6■■□□□ 1.21
CCL3-206ENST00000614051 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.59■■□□□ 1.21
CCL3-206ENST00000614051 PIK3C2BO00750 1634 aa22.56■■□□□ 1.2
CCL3-206ENST00000614051 KIF1BO60333 1816 aa22.54■■□□□ 1.2
CCL3-206ENST00000614051 TNRQ92752 1358 aa22.52■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 IDI1Q13907 227 aa22.51■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.5■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 TONSLQ96HA7 1378 aa22.49■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 RGL3Q3MIN7 710 aa22.48■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.48■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.47■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.47■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.46■■□□□ 1.19
CCL3-206ENST00000614051 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.45■■□□□ 1.18
CCL3-206ENST00000614051 ADGRB3O60242 1522 aa22.45■■□□□ 1.18
CCL3-206ENST00000614051 FBXO41Q8TF61 875 aa22.44■■□□□ 1.18
CCL3-206ENST00000614051 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.44■■□□□ 1.18
CCL3-206ENST00000614051 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.41■■□□□ 1.18
CCL3-206ENST00000614051 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.4■■□□□ 1.18
CCL3-206ENST00000614051 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.39■■□□□ 1.18
CCL3-206ENST00000614051 NLRP1Q9C000 1473 aa22.39■■□□□ 1.18
CCL3-206ENST00000614051 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.39■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 HSPA2P54652 639 aa22.38■■□□□ 1.17
CCL3-206ENST00000614051 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.38■■□□□ 1.17
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