RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
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ZNF548-208ENST00000597576 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.62□□□□□ -0.39
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ZNF548-208ENST00000597576 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
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ZNF548-208ENST00000597576 GGT6Q6P531 493 aa12.57□□□□□ -0.4
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ZNF548-208ENST00000597576 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
ZNF548-208ENST00000597576 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
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ZNF548-208ENST00000597576 SHPRHQ149N8 1683 aa12.51□□□□□ -0.41
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ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.47□□□□□ -0.41
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ZNF548-208ENST00000597576 DIP2AQ14689 1571 aa12.42□□□□□ -0.42
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ZNF548-208ENST00000597576 CEP162Q5TB80 1403 aa12.33□□□□□ -0.44
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ZNF548-208ENST00000597576 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
ZNF548-208ENST00000597576 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.31□□□□□ -0.44
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ZNF548-208ENST00000597576 AFF2P51816 1311 aa12.31□□□□□ -0.44
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.3□□□□□ -0.44
ZNF548-208ENST00000597576 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.3□□□□□ -0.44
ZNF548-208ENST00000597576 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.3□□□□□ -0.44
ZNF548-208ENST00000597576 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
ZNF548-208ENST00000597576 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.29□□□□□ -0.44
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ZNF548-208ENST00000597576 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.26□□□□□ -0.45
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