RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	41.41	■■■■■ 4.22
BRD4-208	ENST00000597315	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.4	■■■■■ 4.22
BRD4-208	ENST00000597315	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.4	■■■■■ 4.22
BRD4-208	ENST00000597315	HSPA2	P54652	639 aa		41.4	■■■■■ 4.22
BRD4-208	ENST00000597315	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		41.39	■■■■■ 4.22
BRD4-208	ENST00000597315	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.37	■■■■■ 4.21
BRD4-208	ENST00000597315	NPAT	Q14207	1427 aa		41.35	■■■■■ 4.21
BRD4-208	ENST00000597315	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.34	■■■■■ 4.21
BRD4-208	ENST00000597315	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.34	■■■■■ 4.21
BRD4-208	ENST00000597315	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.33	■■■■■ 4.21
BRD4-208	ENST00000597315	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.28	■■■■■ 4.2
BRD4-208	ENST00000597315	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.26	■■■■■ 4.2
BRD4-208	ENST00000597315	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.23	■■■■■ 4.19
BRD4-208	ENST00000597315	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.22	■■■■■ 4.19
BRD4-208	ENST00000597315	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.18	■■■■■ 4.18
BRD4-208	ENST00000597315	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	41.15	■■■■■ 4.18
BRD4-208	ENST00000597315	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	41.15	■■■■■ 4.18	2e-8	■■□□□ 14.1
BRD4-208	ENST00000597315	PZP	P20742	1482 aa		41.14	■■■■■ 4.18
BRD4-208	ENST00000597315	ITGAE	P38570	1179 aa		41.13	■■■■■ 4.17
BRD4-208	ENST00000597315	KANK1	Q14678	1352 aa		41.12	■■■■■ 4.17
BRD4-208	ENST00000597315	ABCC3	O15438	1527 aa		41.12	■■■■■ 4.17
BRD4-208	ENST00000597315	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.11	■■■■■ 4.17	1e-6	■■□□□ 13.5
BRD4-208	ENST00000597315	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	41.1	■■■■■ 4.17
BRD4-208	ENST00000597315	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		41.08	■■■■■ 4.17
BRD4-208	ENST00000597315	TNR	Q92752	1358 aa		41.08	■■■■■ 4.17
BRD4-208	ENST00000597315	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		41.07	■■■■■ 4.16
BRD4-208	ENST00000597315	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	41.05	■■■■■ 4.16
BRD4-208	ENST00000597315	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		41.05	■■■■■ 4.16
BRD4-208	ENST00000597315	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.03	■■■■■ 4.16
BRD4-208	ENST00000597315	CEP152	O94986	1710 aa		41.02	■■■■■ 4.16
BRD4-208	ENST00000597315	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	41	■■■■■ 4.15
BRD4-208	ENST00000597315	DEPDC5	O75140	1603 aa		41	■■■■■ 4.15
BRD4-208	ENST00000597315	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.99	■■■■■ 4.15
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.98	■■■■■ 4.15
BRD4-208	ENST00000597315	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.98	■■■■■ 4.15
BRD4-208	ENST00000597315	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.97	■■■■■ 4.15
BRD4-208	ENST00000597315	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.96	■■■■■ 4.15
BRD4-208	ENST00000597315	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.91	■■■■■ 4.14
BRD4-208	ENST00000597315	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.89	■■■■■ 4.14
BRD4-208	ENST00000597315	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.88	■■■■■ 4.13
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.87	■■■■■ 4.13
BRD4-208	ENST00000597315	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.86	■■■■■ 4.13
BRD4-208	ENST00000597315	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.83	■■■■■ 4.13
BRD4-208	ENST00000597315	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.83	■■■■■ 4.13
BRD4-208	ENST00000597315	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.83	■■■■■ 4.13
BRD4-208	ENST00000597315	PKD2	Q13563	968 aa		40.82	■■■■■ 4.13
BRD4-208	ENST00000597315	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.82	■■■■■ 4.12
BRD4-208	ENST00000597315	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.81	■■■■■ 4.12
BRD4-208	ENST00000597315	PTPRT	O14522	1441 aa		40.81	■■■■■ 4.12
BRD4-208	ENST00000597315	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.8	■■■■■ 4.12
BRD4-208	ENST00000597315	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.78	■■■■■ 4.12
BRD4-208	ENST00000597315	UNC13B	O14795	1591 aa		40.71	■■■■■ 4.11
BRD4-208	ENST00000597315	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.71	■■■■■ 4.11
BRD4-208	ENST00000597315	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.69	■■■■■ 4.1
BRD4-208	ENST00000597315	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.68	■■■■■ 4.1
BRD4-208	ENST00000597315	NUP155	O75694	1391 aa		40.65	■■■■■ 4.1
BRD4-208	ENST00000597315	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.65	■■■■■ 4.1
BRD4-208	ENST00000597315	TET3	O43151	1660 aa		40.63	■■■■■ 4.1
BRD4-208	ENST00000597315	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
BRD4-208	ENST00000597315	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.57	■■■■■ 4.09
BRD4-208	ENST00000597315	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
BRD4-208	ENST00000597315	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.57	■■■■■ 4.09
BRD4-208	ENST00000597315	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.56	■■■■■ 4.08
BRD4-208	ENST00000597315	NOS1	P29475	1434 aa		40.55	■■■■■ 4.08
BRD4-208	ENST00000597315	NAIP	Q13075	1403 aa		40.55	■■■■■ 4.08
BRD4-208	ENST00000597315	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.54	■■■■■ 4.08
BRD4-208	ENST00000597315	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.53	■■■■■ 4.08
BRD4-208	ENST00000597315	IDI1	Q13907	227 aa		40.52	■■■■■ 4.08
BRD4-208	ENST00000597315	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.5	■■■■■ 4.07
BRD4-208	ENST00000597315	HFM1	A2PYH4	1435 aa		40.5	■■■■■ 4.07
BRD4-208	ENST00000597315	SYNM	O15061	1565 aa		40.49	■■■■■ 4.07
BRD4-208	ENST00000597315	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.47	■■■■■ 4.07
BRD4-208	ENST00000597315	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.45	■■■■■ 4.07
BRD4-208	ENST00000597315	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
BRD4-208	ENST00000597315	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.44	■■■■■ 4.06
BRD4-208	ENST00000597315		E9PCH4	1651 aa		40.43	■■■■■ 4.06
BRD4-208	ENST00000597315	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.42	■■■■■ 4.06
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
BRD4-208	ENST00000597315	MED14	O60244	1454 aa		40.4	■■■■■ 4.06
BRD4-208	ENST00000597315	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
BRD4-208	ENST00000597315	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
BRD4-208	ENST00000597315	SLIT1	O75093	1534 aa		40.38	■■■■■ 4.06
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.37	■■■■■ 4.05
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.36	■■■■■ 4.05
BRD4-208	ENST00000597315	ADGRB3	O60242	1522 aa		40.36	■■■■■ 4.05
BRD4-208	ENST00000597315	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.35	■■■■■ 4.05
BRD4-208	ENST00000597315	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.34	■■■■■ 4.05
BRD4-208	ENST00000597315	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
BRD4-208	ENST00000597315	LTK	P29376	864 aa		40.32	■■■■■ 4.05
BRD4-208	ENST00000597315	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
BRD4-208	ENST00000597315	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	40.24	■■■■■ 4.03
BRD4-208	ENST00000597315	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.21	■■■■■ 4.03
BRD4-208	ENST00000597315	BCAN	Q96GW7	911 aa		40.21	■■■■■ 4.03
BRD4-208	ENST00000597315	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	40.2	■■■■■ 4.03
BRD4-208	ENST00000597315	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		40.19	■■■■■ 4.02
BRD4-208	ENST00000597315	CPS1	P31327	1500 aa		40.17	■■■■■ 4.02
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		40.17	■■■■■ 4.02
BRD4-208	ENST00000597315	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
BRD4-208	ENST00000597315	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	40.14	■■■■■ 4.02	3e-9	■□□□□ 8.7
BRD4-208	ENST00000597315	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		40.14	■■■■■ 4.02

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