RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
BRD4-208ENST00000597315 KIF15Q9NS87 1388 aa41.4■■■■■ 4.22
BRD4-208ENST00000597315 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.4■■■■■ 4.22
BRD4-208ENST00000597315 HSPA2P54652 639 aa41.4■■■■■ 4.22
BRD4-208ENST00000597315 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.39■■■■■ 4.22
BRD4-208ENST00000597315 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.37■■■■■ 4.21
BRD4-208ENST00000597315 NPATQ14207 1427 aa41.35■■■■■ 4.21
BRD4-208ENST00000597315 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.34■■■■■ 4.21
BRD4-208ENST00000597315 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
BRD4-208ENST00000597315 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.33■■■■■ 4.21
BRD4-208ENST00000597315 ERBINQ96RT1 1412 aa41.28■■■■■ 4.2
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BRD4-208ENST00000597315 NCOA1Q15788 1441 aa41.22■■■■■ 4.19
BRD4-208ENST00000597315 ADGRL2O95490 1459 aa41.18■■■■■ 4.18
BRD4-208ENST00000597315 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
BRD4-208ENST00000597315 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.182e-8■■□□□ 14.1
BRD4-208ENST00000597315 PZPP20742 1482 aa41.14■■■■■ 4.18
BRD4-208ENST00000597315 ITGAEP38570 1179 aa41.13■■■■■ 4.17
BRD4-208ENST00000597315 KANK1Q14678 1352 aa41.12■■■■■ 4.17
BRD4-208ENST00000597315 ABCC3O15438 1527 aa41.12■■■■■ 4.17
BRD4-208ENST00000597315 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.171e-6■■□□□ 13.5
BRD4-208ENST00000597315 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
BRD4-208ENST00000597315 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.08■■■■■ 4.17
BRD4-208ENST00000597315 TNRQ92752 1358 aa41.08■■■■■ 4.17
BRD4-208ENST00000597315 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.07■■■■■ 4.16
BRD4-208ENST00000597315 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
BRD4-208ENST00000597315 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.05■■■■■ 4.16
BRD4-208ENST00000597315 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.03■■■■■ 4.16
BRD4-208ENST00000597315 CEP152O94986 1710 aa41.02■■■■■ 4.16
BRD4-208ENST00000597315 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
BRD4-208ENST00000597315 DEPDC5O75140 1603 aa41■■■■■ 4.15
BRD4-208ENST00000597315 ROCK1Q13464 1354 aa40.99■■■■■ 4.15
BRD4-208ENST00000597315 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
BRD4-208ENST00000597315 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.98■■■■■ 4.15
BRD4-208ENST00000597315 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
BRD4-208ENST00000597315 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.96■■■■■ 4.15
BRD4-208ENST00000597315 STRCQ7RTU9 1775 aa40.91■■■■■ 4.14
BRD4-208ENST00000597315 NLRP1Q9C000 1473 aa40.89■■■■■ 4.14
BRD4-208ENST00000597315 ERVK-7P63135 1459 aa40.88■■■■■ 4.13
BRD4-208ENST00000597315 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.87■■■■■ 4.13
BRD4-208ENST00000597315 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.86■■■■■ 4.13
BRD4-208ENST00000597315 PLA2R1Q13018 1463 aa40.83■■■■■ 4.13
BRD4-208ENST00000597315 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
BRD4-208ENST00000597315 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.83■■■■■ 4.13
BRD4-208ENST00000597315 PKD2Q13563 968 aa40.82■■■■■ 4.13
BRD4-208ENST00000597315 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.82■■■■■ 4.12
BRD4-208ENST00000597315 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
BRD4-208ENST00000597315 PTPRTO14522 1441 aa40.81■■■■■ 4.12
BRD4-208ENST00000597315 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.8■■■■■ 4.12
BRD4-208ENST00000597315 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.78■■■■■ 4.12
BRD4-208ENST00000597315 UNC13BO14795 1591 aa40.71■■■■■ 4.11
BRD4-208ENST00000597315 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.71■■■■■ 4.11
BRD4-208ENST00000597315 FBXO41Q8TF61 875 aa40.69■■■■■ 4.1
BRD4-208ENST00000597315 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.68■■■■■ 4.1
BRD4-208ENST00000597315 NUP155O75694 1391 aa40.65■■■■■ 4.1
BRD4-208ENST00000597315 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.65■■■■■ 4.1
BRD4-208ENST00000597315 TET3O43151 1660 aa40.63■■■■■ 4.1
BRD4-208ENST00000597315 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
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BRD4-208ENST00000597315 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
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BRD4-208ENST00000597315 NOS1P29475 1434 aa40.55■■■■■ 4.08
BRD4-208ENST00000597315 NAIPQ13075 1403 aa40.55■■■■■ 4.08
BRD4-208ENST00000597315 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.54■■■■■ 4.08
BRD4-208ENST00000597315 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.53■■■■■ 4.08
BRD4-208ENST00000597315 IDI1Q13907 227 aa40.52■■■■■ 4.08
BRD4-208ENST00000597315 PIK3C2BO00750 1634 aa40.5■■■■■ 4.07
BRD4-208ENST00000597315 HFM1A2PYH4 1435 aa40.5■■■■■ 4.07
BRD4-208ENST00000597315 SYNMO15061 1565 aa40.49■■■■■ 4.07
BRD4-208ENST00000597315 EID1Q9Y6B2 187 aa40.47■■■■■ 4.07
BRD4-208ENST00000597315 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.45■■■■■ 4.07
BRD4-208ENST00000597315 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
BRD4-208ENST00000597315 TRIM52Q96A61 297 aa40.44■■■■■ 4.06
BRD4-208ENST00000597315 E9PCH4 1651 aa40.43■■■■■ 4.06
BRD4-208ENST00000597315 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.42■■■■■ 4.06
BRD4-208ENST00000597315 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
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BRD4-208ENST00000597315 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
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BRD4-208ENST00000597315 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.35■■■■■ 4.05
BRD4-208ENST00000597315 IQGAP1P46940 1657 aa40.34■■■■■ 4.05
BRD4-208ENST00000597315 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
BRD4-208ENST00000597315 LTKP29376 864 aa40.32■■■■■ 4.05
BRD4-208ENST00000597315 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
BRD4-208ENST00000597315 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
BRD4-208ENST00000597315 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.21■■■■■ 4.03
BRD4-208ENST00000597315 BCANQ96GW7 911 aa40.21■■■■■ 4.03
BRD4-208ENST00000597315 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
BRD4-208ENST00000597315 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.19■■■■■ 4.02
BRD4-208ENST00000597315 CPS1P31327 1500 aa40.17■■■■■ 4.02
BRD4-208ENST00000597315 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.17■■■■■ 4.02
BRD4-208ENST00000597315 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
BRD4-208ENST00000597315 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.023e-9■□□□□ 8.7
BRD4-208ENST00000597315 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.14■■■■■ 4.02
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