RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597298.5

GPR108-210, Transcript of G protein-coupled receptor 108, humanhuman

TSL 5

Gene GPR108, Length 765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR108-210ENST00000597298 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.65■■■□□ 2.18
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GPR108-210ENST00000597298 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
GPR108-210ENST00000597298 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.63■■■□□ 2.17
GPR108-210ENST00000597298 DAPK1P53355 1430 aa28.62■■■□□ 2.17
GPR108-210ENST00000597298 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.6■■■□□ 2.17
GPR108-210ENST00000597298 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.6■■■□□ 2.17
GPR108-210ENST00000597298 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GPR108-210ENST00000597298 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.59■■■□□ 2.17
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GPR108-210ENST00000597298 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.55■■■□□ 2.16
GPR108-210ENST00000597298 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
GPR108-210ENST00000597298 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.55■■■□□ 2.16
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GPR108-210ENST00000597298 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
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GPR108-210ENST00000597298 PTPRTO14522 1441 aa28.45■■■□□ 2.15
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GPR108-210ENST00000597298 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.43■■■□□ 2.14
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GPR108-210ENST00000597298 ADGRL2O95490 1459 aa28.4■■■□□ 2.14
GPR108-210ENST00000597298 PLA2R1Q13018 1463 aa28.4■■■□□ 2.14
GPR108-210ENST00000597298 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.142e-7■□□□□ 8
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GPR108-210ENST00000597298 ERVK-7P63135 1459 aa28.36■■■□□ 2.13
GPR108-210ENST00000597298 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
GPR108-210ENST00000597298 NLRP1Q9C000 1473 aa28.34■■■□□ 2.13
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GPR108-210ENST00000597298 KANK1Q14678 1352 aa28.31■■■□□ 2.12
GPR108-210ENST00000597298 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.31■■■□□ 2.12
GPR108-210ENST00000597298 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.28■■■□□ 2.12
GPR108-210ENST00000597298 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.27■■■□□ 2.12
GPR108-210ENST00000597298 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.27■■■□□ 2.12
GPR108-210ENST00000597298 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
GPR108-210ENST00000597298 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.27■■■□□ 2.12
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GPR108-210ENST00000597298 ITGAEP38570 1179 aa28.25■■■□□ 2.11
GPR108-210ENST00000597298 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.24■■■□□ 2.11
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GPR108-210ENST00000597298 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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GPR108-210ENST00000597298 TET3O43151 1660 aa28.13■■■□□ 2.09
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GPR108-210ENST00000597298 MED14O60244 1454 aa28.09■■■□□ 2.09
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GPR108-210ENST00000597298 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.78■■■□□ 2.04
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