RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		34.4	■■■■□ 3.1
APBA3-208	ENST00000592826	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		34.39	■■■■□ 3.1
APBA3-208	ENST00000592826	KIF15	Q9NS87	1388 aa		34.37	■■■■□ 3.09
APBA3-208	ENST00000592826	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		34.35	■■■■□ 3.09
APBA3-208	ENST00000592826	C3	P01024	1663 aa		34.35	■■■■□ 3.09
APBA3-208	ENST00000592826	NCOA1	Q15788	1441 aa		34.34	■■■■□ 3.09
APBA3-208	ENST00000592826	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		34.34	■■■■□ 3.09
APBA3-208	ENST00000592826	ADGRL2	O95490	1459 aa		34.33	■■■■□ 3.09
APBA3-208	ENST00000592826	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	34.33	■■■■□ 3.09
APBA3-208	ENST00000592826	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		34.32	■■■■□ 3.08
APBA3-208	ENST00000592826	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	34.32	■■■■□ 3.08
APBA3-208	ENST00000592826	STRC	Q7RTU9	1775 aa		34.31	■■■■□ 3.08
APBA3-208	ENST00000592826	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		34.31	■■■■□ 3.08
APBA3-208	ENST00000592826	MROH2A	A6NES4	1674 aa		34.28	■■■■□ 3.08
APBA3-208	ENST00000592826	ZMYM3	Q14202	1370 aa		34.27	■■■■□ 3.08
APBA3-208	ENST00000592826	ROCK1	Q13464	1354 aa		34.24	■■■■□ 3.07
APBA3-208	ENST00000592826	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	34.23	■■■■□ 3.07
APBA3-208	ENST00000592826	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		34.23	■■■■□ 3.07
APBA3-208	ENST00000592826	PTPRK	Q15262	1439 aa		34.21	■■■■□ 3.07
APBA3-208	ENST00000592826	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		34.2	■■■■□ 3.07
APBA3-208	ENST00000592826	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	34.2	■■■■□ 3.07
APBA3-208	ENST00000592826	PTPRT	O14522	1441 aa		34.18	■■■■□ 3.06
APBA3-208	ENST00000592826	NPAT	Q14207	1427 aa		34.17	■■■■□ 3.06
APBA3-208	ENST00000592826	ITGAE	P38570	1179 aa		34.15	■■■■□ 3.06
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		34.13	■■■■□ 3.05
APBA3-208	ENST00000592826	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	34.1	■■■■□ 3.05
APBA3-208	ENST00000592826	KANK1	Q14678	1352 aa		34.1	■■■■□ 3.05
APBA3-208	ENST00000592826	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	34.08	■■■■□ 3.05
APBA3-208	ENST00000592826	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		34.08	■■■■□ 3.05
APBA3-208	ENST00000592826	ABCC3	O15438	1527 aa		34.06	■■■■□ 3.04
APBA3-208	ENST00000592826	DEPDC5	O75140	1603 aa		34.06	■■■■□ 3.04
APBA3-208	ENST00000592826	PZP	P20742	1482 aa		34.04	■■■■□ 3.04
APBA3-208	ENST00000592826	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	34.02	■■■■□ 3.04
APBA3-208	ENST00000592826	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.99	■■■■□ 3.03
APBA3-208	ENST00000592826	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.96	■■■■□ 3.03
APBA3-208	ENST00000592826	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.95	■■■■□ 3.03
APBA3-208	ENST00000592826	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.94	■■■■□ 3.02
APBA3-208	ENST00000592826	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.94	■■■■□ 3.02
APBA3-208	ENST00000592826	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.93	■■■■□ 3.02
APBA3-208	ENST00000592826	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
APBA3-208	ENST00000592826	CEP152	O94986	1710 aa		33.92	■■■■□ 3.02
APBA3-208	ENST00000592826	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.91	■■■■□ 3.02
APBA3-208	ENST00000592826	TNR	Q92752	1358 aa		33.91	■■■■□ 3.02
APBA3-208	ENST00000592826	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.88	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	UNC13B	O14795	1591 aa		33.87	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	PKD2	Q13563	968 aa		33.86	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.86	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	NAIP	Q13075	1403 aa		33.86	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.85	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.84	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.82	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.82	■■■■□ 3.01
APBA3-208	ENST00000592826	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.81	■■■■□ 3
APBA3-208	ENST00000592826	NUP155	O75694	1391 aa		33.79	■■■■□ 3
APBA3-208	ENST00000592826	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.79	■■■■□ 3
APBA3-208	ENST00000592826	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
APBA3-208	ENST00000592826	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.78	■■■■□ 3
APBA3-208	ENST00000592826	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.77	■■■■□ 3
APBA3-208	ENST00000592826	TET3	O43151	1660 aa		33.74	■■■□□ 2.99
APBA3-208	ENST00000592826	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.74	■■■□□ 2.99
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
APBA3-208	ENST00000592826	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
APBA3-208	ENST00000592826	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
APBA3-208	ENST00000592826	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
APBA3-208	ENST00000592826	NOS1	P29475	1434 aa		33.67	■■■□□ 2.98
APBA3-208	ENST00000592826	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.66	■■■□□ 2.98
APBA3-208	ENST00000592826	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.65	■■■□□ 2.98
APBA3-208	ENST00000592826	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.61	■■■□□ 2.97
APBA3-208	ENST00000592826	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.6	■■■□□ 2.97
APBA3-208	ENST00000592826	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
APBA3-208	ENST00000592826	IDI1	Q13907	227 aa		33.57	■■■□□ 2.96
APBA3-208	ENST00000592826	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.57	■■■□□ 2.96
APBA3-208	ENST00000592826		E9PCH4	1651 aa		33.57	■■■□□ 2.96
APBA3-208	ENST00000592826	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.56	■■■□□ 2.96
APBA3-208	ENST00000592826	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.56	■■■□□ 2.96
APBA3-208	ENST00000592826	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.55	■■■□□ 2.96
APBA3-208	ENST00000592826	SYNM	O15061	1565 aa		33.55	■■■□□ 2.96
APBA3-208	ENST00000592826	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
APBA3-208	ENST00000592826	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.51	■■■□□ 2.95
APBA3-208	ENST00000592826	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.5	■■■□□ 2.95
APBA3-208	ENST00000592826	SOCS7	O14512	581 aa		33.49	■■■□□ 2.95
APBA3-208	ENST00000592826	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
APBA3-208	ENST00000592826	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.48	■■■□□ 2.95
APBA3-208	ENST00000592826	CPS1	P31327	1500 aa		33.48	■■■□□ 2.95
APBA3-208	ENST00000592826	HRC	P23327	699 aa		33.44	■■■□□ 2.94
APBA3-208	ENST00000592826	SLIT1	O75093	1534 aa		33.43	■■■□□ 2.94
APBA3-208	ENST00000592826	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.43	■■■□□ 2.94
APBA3-208	ENST00000592826	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.42	■■■□□ 2.94
APBA3-208	ENST00000592826	ADGRB3	O60242	1522 aa		33.42	■■■□□ 2.94
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.41	■■■□□ 2.94
APBA3-208	ENST00000592826	MED14	O60244	1454 aa		33.4	■■■□□ 2.94
APBA3-208	ENST00000592826	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.4	■■■□□ 2.94
APBA3-208	ENST00000592826	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
APBA3-208	ENST00000592826	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.38	■■■□□ 2.93
APBA3-208	ENST00000592826	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
APBA3-208	ENST00000592826	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.37	■■■□□ 2.93
APBA3-208	ENST00000592826	TOM1	O60784	492 aa		33.37	■■■□□ 2.93
APBA3-208	ENST00000592826	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.37	■■■□□ 2.93

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