RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-211ENST00000592658 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-211ENST00000592658 MBD5Q9P267 1494 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-211ENST00000592658 TNRQ92752 1358 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-211ENST00000592658 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 PZPP20742 1482 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 MED14O60244 1454 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.54■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 TIAM1Q13009 1591 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 DEPDC5O75140 1603 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-211ENST00000592658 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 MIA2Q96PC5 1412 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 NLRP1Q9C000 1473 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.49■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.48■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 KIF3BO15066 747 aa21.48■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 IQGAP1P46940 1657 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.46■■□□□ 1.03
CTIF-211ENST00000592658 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.44■■□□□ 1.02
CTIF-211ENST00000592658 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTIF-211ENST00000592658 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.43■■□□□ 1.02
CTIF-211ENST00000592658 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.43■■□□□ 1.02
CTIF-211ENST00000592658 SYNMO15061 1565 aa21.42■■□□□ 1.02
CTIF-211ENST00000592658 CEP162Q5TB80 1403 aa21.42■■□□□ 1.02
CTIF-211ENST00000592658 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CTIF-211ENST00000592658 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CTIF-211ENST00000592658 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CTIF-211ENST00000592658 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.36■■□□□ 1.01
CTIF-211ENST00000592658 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.34■■□□□ 1.01
CTIF-211ENST00000592658 ABCC3O15438 1527 aa21.33■■□□□ 1
CTIF-211ENST00000592658 ERVK-7P63135 1459 aa21.32■■□□□ 1
CTIF-211ENST00000592658 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.31■■□□□ 1
CTIF-211ENST00000592658 NCOA2Q15596 1464 aa21.3■■□□□ 1
CTIF-211ENST00000592658 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.29■■□□□ 1
CTIF-211ENST00000592658 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CTIF-211ENST00000592658 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CTIF-211ENST00000592658 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.26■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.26■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 SLIT1O75093 1534 aa21.25■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 TSPY4P0CV99 314 aa21.24■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 TSPY10P0CW01 314 aa21.24■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 LTKP29376 864 aa21.24■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.23■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.23■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 POTEAQ6S8J7 498 aa21.22■□□□□ 0.99
CTIF-211ENST00000592658 CEP152O94986 1710 aa21.2■□□□□ 0.98
CTIF-211ENST00000592658 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.18■□□□□ 0.98
CTIF-211ENST00000592658 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CTIF-211ENST00000592658 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.15■□□□□ 0.98
CTIF-211ENST00000592658 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 MAP3K1Q13233 1512 aa21.13■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 TMEM94Q12767 1356 aa21.12■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 EID1Q9Y6B2 187 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 PIK3C2BO00750 1634 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CTIF-211ENST00000592658 TET3O43151 1660 aa21.08■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 KCNA6P17658 529 aa21.07■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.04■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 NWD1Q149M9 1564 aa21.03■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 ERBINQ96RT1 1412 aa21.03■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-211ENST00000592658 KIF15Q9NS87 1388 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 SLC26A8Q96RN1 970 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 PHLPP1O60346 1717 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 IDI1Q13907 227 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 JCADQ9P266 1359 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 MSH6P52701 1360 aa20.97■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 SLAIN2Q9P270 581 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CTIF-211ENST00000592658 ABCC5O15440 1437 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-211ENST00000592658 ADGRB3O60242 1522 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-211ENST00000592658 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
CTIF-211ENST00000592658 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-211ENST00000592658 NOS1P29475 1434 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-211ENST00000592658 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.93■□□□□ 0.94
CTIF-211ENST00000592658 LRP6O75581 1613 aa20.93■□□□□ 0.94
CTIF-211ENST00000592658 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.947e-6■■■■□ 22.8
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