RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591824.5

POP4-211, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 5

Gene POP4, Length 846 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-211ENST00000591824 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.13■■□□□ 1.61
POP4-211ENST00000591824 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.13■■□□□ 1.61
POP4-211ENST00000591824 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.11■■□□□ 1.61
POP4-211ENST00000591824 NPATQ14207 1427 aa25.11■■□□□ 1.61
POP4-211ENST00000591824 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.1■■□□□ 1.61
POP4-211ENST00000591824 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.08■■□□□ 1.61
POP4-211ENST00000591824 PTPRKQ15262 1439 aa25.06■■□□□ 1.6
POP4-211ENST00000591824 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.06■■□□□ 1.6
POP4-211ENST00000591824 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
POP4-211ENST00000591824 ERBINQ96RT1 1412 aa25.04■■□□□ 1.6
POP4-211ENST00000591824 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
POP4-211ENST00000591824 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
POP4-211ENST00000591824 NCOA1Q15788 1441 aa25.01■■□□□ 1.59
POP4-211ENST00000591824 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
POP4-211ENST00000591824 PZPP20742 1482 aa24.99■■□□□ 1.59
POP4-211ENST00000591824 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
POP4-211ENST00000591824 ABCC3O15438 1527 aa24.97■■□□□ 1.59
POP4-211ENST00000591824 ADGRL2O95490 1459 aa24.97■■□□□ 1.59
POP4-211ENST00000591824 ITGAEP38570 1179 aa24.97■■□□□ 1.59
POP4-211ENST00000591824 TNRQ92752 1358 aa24.96■■□□□ 1.59
POP4-211ENST00000591824 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.96■■□□□ 1.59
POP4-211ENST00000591824 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.95■■□□□ 1.58
POP4-211ENST00000591824 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
POP4-211ENST00000591824 KANK1Q14678 1352 aa24.93■■□□□ 1.58
POP4-211ENST00000591824 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.93■■□□□ 1.58
POP4-211ENST00000591824 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
POP4-211ENST00000591824 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
POP4-211ENST00000591824 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.89■■□□□ 1.58
POP4-211ENST00000591824 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.89■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.88■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 CEP152O94986 1710 aa24.87■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 STRCQ7RTU9 1775 aa24.86■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 DEPDC5O75140 1603 aa24.86■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 ROCK1Q13464 1354 aa24.85■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.84■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 ERVK-7P63135 1459 aa24.83■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
POP4-211ENST00000591824 NLRP1Q9C000 1473 aa24.83■■□□□ 1.56
POP4-211ENST00000591824 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.81■■□□□ 1.56
POP4-211ENST00000591824 PLA2R1Q13018 1463 aa24.81■■□□□ 1.56
POP4-211ENST00000591824 PTPRTO14522 1441 aa24.8■■□□□ 1.56
POP4-211ENST00000591824 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.8■■□□□ 1.56
POP4-211ENST00000591824 PKD2Q13563 968 aa24.79■■□□□ 1.56
POP4-211ENST00000591824 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.77■■□□□ 1.56
POP4-211ENST00000591824 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
POP4-211ENST00000591824 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
POP4-211ENST00000591824 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.76■■□□□ 1.55
POP4-211ENST00000591824 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.76■■□□□ 1.55
POP4-211ENST00000591824 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.71■■□□□ 1.55
POP4-211ENST00000591824 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.71■■□□□ 1.55
POP4-211ENST00000591824 CERKQ8TCT0 537 aa24.7■■□□□ 1.54
POP4-211ENST00000591824 UNC13BO14795 1591 aa24.68■■□□□ 1.54
POP4-211ENST00000591824 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
POP4-211ENST00000591824 FBXO41Q8TF61 875 aa24.67■■□□□ 1.54
POP4-211ENST00000591824 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.67■■□□□ 1.54
POP4-211ENST00000591824 NUP155O75694 1391 aa24.67■■□□□ 1.54
POP4-211ENST00000591824 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 TET3O43151 1660 aa24.62■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 NOS1P29475 1434 aa24.62■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 IDI1Q13907 227 aa24.62■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.6■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.6■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 NAIPQ13075 1403 aa24.6■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 SYNMO15061 1565 aa24.59■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 PIK3C2BO00750 1634 aa24.58■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.58■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.58■■□□□ 1.53
POP4-211ENST00000591824 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.56■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.56■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 EID1Q9Y6B2 187 aa24.56■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.56■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 HFM1A2PYH4 1435 aa24.54■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 MED14O60244 1454 aa24.54■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.53■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 SLIT1O75093 1534 aa24.52■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 LTKP29376 864 aa24.52■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 TRIM52Q96A61 297 aa24.52■■□□□ 1.52
POP4-211ENST00000591824 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.51■■□□□ 1.51
POP4-211ENST00000591824 E9PCH4 1651 aa24.51■■□□□ 1.51
POP4-211ENST00000591824 ADGRB3O60242 1522 aa24.51■■□□□ 1.51
POP4-211ENST00000591824 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
POP4-211ENST00000591824 IQGAP1P46940 1657 aa24.5■■□□□ 1.51
POP4-211ENST00000591824 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
POP4-211ENST00000591824 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.43■■□□□ 1.5
POP4-211ENST00000591824 BCANQ96GW7 911 aa24.42■■□□□ 1.5
POP4-211ENST00000591824 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
POP4-211ENST00000591824 CPS1P31327 1500 aa24.4■■□□□ 1.5
POP4-211ENST00000591824 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
POP4-211ENST00000591824 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
POP4-211ENST00000591824 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.38■■□□□ 1.49
POP4-211ENST00000591824 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
POP4-211ENST00000591824 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.38■■□□□ 1.49
POP4-211ENST00000591824 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.35■■□□□ 1.49
POP4-211ENST00000591824 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms