RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591307.5

BECN1-218, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 2

Gene BECN1, Length 744 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-218ENST00000591307 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
BECN1-218ENST00000591307 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
BECN1-218ENST00000591307 STRCQ7RTU9 1775 aa27.48■■□□□ 1.99
BECN1-218ENST00000591307 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.48■■□□□ 1.99
BECN1-218ENST00000591307 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
BECN1-218ENST00000591307 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.47■■□□□ 1.99
BECN1-218ENST00000591307 KIF15Q9NS87 1388 aa27.46■■□□□ 1.99
BECN1-218ENST00000591307 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
BECN1-218ENST00000591307 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.44■■□□□ 1.98
BECN1-218ENST00000591307 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.44■■□□□ 1.98
BECN1-218ENST00000591307 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
BECN1-218ENST00000591307 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.42■■□□□ 1.98
BECN1-218ENST00000591307 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
BECN1-218ENST00000591307 NCOA1Q15788 1441 aa27.38■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 PZPP20742 1482 aa27.38■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.38■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 ABCC3O15438 1527 aa27.37■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.36■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.35■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.34■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.972e-6■■□□□ 11.6
BECN1-218ENST00000591307 TNRQ92752 1358 aa27.34■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 ERBINQ96RT1 1412 aa27.33■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.33■■□□□ 1.97
BECN1-218ENST00000591307 CEP152O94986 1710 aa27.32■■□□□ 1.96
BECN1-218ENST00000591307 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
BECN1-218ENST00000591307 ADGRL2O95490 1459 aa27.31■■□□□ 1.96
BECN1-218ENST00000591307 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
BECN1-218ENST00000591307 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.29■■□□□ 1.96
BECN1-218ENST00000591307 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.28■■□□□ 1.96
BECN1-218ENST00000591307 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
BECN1-218ENST00000591307 PTPRTO14522 1441 aa27.26■■□□□ 1.95
BECN1-218ENST00000591307 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
BECN1-218ENST00000591307 DEPDC5O75140 1603 aa27.24■■□□□ 1.95
BECN1-218ENST00000591307 ITGAEP38570 1179 aa27.23■■□□□ 1.95
BECN1-218ENST00000591307 ERVK-7P63135 1459 aa27.22■■□□□ 1.95
BECN1-218ENST00000591307 CERKQ8TCT0 537 aa27.21■■□□□ 1.95
BECN1-218ENST00000591307 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.21■■□□□ 1.95
BECN1-218ENST00000591307 PLA2R1Q13018 1463 aa27.19■■□□□ 1.94
BECN1-218ENST00000591307 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.19■■□□□ 1.94
BECN1-218ENST00000591307 FBXO41Q8TF61 875 aa27.19■■□□□ 1.94
BECN1-218ENST00000591307 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.18■■□□□ 1.94
BECN1-218ENST00000591307 PKD2Q13563 968 aa27.17■■□□□ 1.94
BECN1-218ENST00000591307 NLRP1Q9C000 1473 aa27.17■■□□□ 1.94
BECN1-218ENST00000591307 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
BECN1-218ENST00000591307 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.16■■□□□ 1.94
BECN1-218ENST00000591307 KANK1Q14678 1352 aa27.15■■□□□ 1.94
BECN1-218ENST00000591307 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.13■■□□□ 1.93
BECN1-218ENST00000591307 ROCK1Q13464 1354 aa27.12■■□□□ 1.93
BECN1-218ENST00000591307 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
BECN1-218ENST00000591307 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.11■■□□□ 1.93
BECN1-218ENST00000591307 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.1■■□□□ 1.93
BECN1-218ENST00000591307 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
BECN1-218ENST00000591307 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
BECN1-218ENST00000591307 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.08■■□□□ 1.93
BECN1-218ENST00000591307 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.07■■□□□ 1.92
BECN1-218ENST00000591307 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
BECN1-218ENST00000591307 IDI1Q13907 227 aa27.03■■□□□ 1.92
BECN1-218ENST00000591307 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.03■■□□□ 1.92
BECN1-218ENST00000591307 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.03■■□□□ 1.92
BECN1-218ENST00000591307 UNC13BO14795 1591 aa27.01■■□□□ 1.91
BECN1-218ENST00000591307 SYNMO15061 1565 aa27.01■■□□□ 1.91
BECN1-218ENST00000591307 NOS1P29475 1434 aa27■■□□□ 1.91
BECN1-218ENST00000591307 PIK3C2BO00750 1634 aa26.99■■□□□ 1.91
BECN1-218ENST00000591307 LTKP29376 864 aa26.98■■□□□ 1.91
BECN1-218ENST00000591307 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
BECN1-218ENST00000591307 TET3O43151 1660 aa26.95■■□□□ 1.91
BECN1-218ENST00000591307 MED14O60244 1454 aa26.95■■□□□ 1.91
BECN1-218ENST00000591307 NUP155O75694 1391 aa26.94■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.93■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.93■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 E9PCH4 1651 aa26.9■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.9■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.9■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.9■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 SLIT1O75093 1534 aa26.9■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 NAIPQ13075 1403 aa26.9■■□□□ 1.9
BECN1-218ENST00000591307 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.88■■□□□ 1.89
BECN1-218ENST00000591307 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.88■■□□□ 1.89
BECN1-218ENST00000591307 IQGAP1P46940 1657 aa26.88■■□□□ 1.89
BECN1-218ENST00000591307 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
BECN1-218ENST00000591307 EID1Q9Y6B2 187 aa26.82■■□□□ 1.88
BECN1-218ENST00000591307 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
BECN1-218ENST00000591307 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.81■■□□□ 1.88
BECN1-218ENST00000591307 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.81■■□□□ 1.88
BECN1-218ENST00000591307 ADGRB3O60242 1522 aa26.81■■□□□ 1.88
BECN1-218ENST00000591307 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.81■■□□□ 1.88
BECN1-218ENST00000591307 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
BECN1-218ENST00000591307 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.76■■□□□ 1.87
BECN1-218ENST00000591307 HFM1A2PYH4 1435 aa26.76■■□□□ 1.87
BECN1-218ENST00000591307 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
BECN1-218ENST00000591307 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.75■■□□□ 1.87
BECN1-218ENST00000591307 CPS1P31327 1500 aa26.74■■□□□ 1.87
BECN1-218ENST00000591307 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.73■■□□□ 1.87
BECN1-218ENST00000591307 TRIM52Q96A61 297 aa26.72■■□□□ 1.87
BECN1-218ENST00000591307 ZFYVE9O95405 1425 aa26.72■■□□□ 1.87
BECN1-218ENST00000591307 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
BECN1-218ENST00000591307 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.7■■□□□ 1.86
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