RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590551.1

U2AF2-206, Transcript of U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2, human

TSL 3 BASIC

Gene U2AF2, Length 1,104 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
U2AF2-206	ENST00000590551	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.95	■■■■■ 4.15
U2AF2-206	ENST00000590551	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.95	■■■■■ 4.15
U2AF2-206	ENST00000590551	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.92	■■■■■ 4.14
U2AF2-206	ENST00000590551	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.92	■■■■■ 4.14
U2AF2-206	ENST00000590551	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.9	■■■■■ 4.14
U2AF2-206	ENST00000590551	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		40.9	■■■■■ 4.14
U2AF2-206	ENST00000590551	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.9	■■■■■ 4.14
U2AF2-206	ENST00000590551	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.13
U2AF2-206	ENST00000590551	TNR	Q92752	1358 aa		40.87	■■■■■ 4.13
U2AF2-206	ENST00000590551	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.87	■■■■■ 4.13
U2AF2-206	ENST00000590551	PZP	P20742	1482 aa		40.87	■■■■■ 4.13
U2AF2-206	ENST00000590551	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.87	■■■■■ 4.13
U2AF2-206	ENST00000590551	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.86	■■■■■ 4.13
U2AF2-206	ENST00000590551	APLP2	Q06481	763 aa		40.84	■■■■■ 4.13
U2AF2-206	ENST00000590551	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.8	■■■■■ 4.12
U2AF2-206	ENST00000590551	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
U2AF2-206	ENST00000590551	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
U2AF2-206	ENST00000590551	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.72	■■■■■ 4.11
U2AF2-206	ENST00000590551	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.7	■■■■■ 4.11
U2AF2-206	ENST00000590551	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.66	■■■■■ 4.1
U2AF2-206	ENST00000590551	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
U2AF2-206	ENST00000590551	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
U2AF2-206	ENST00000590551	ABCC3	O15438	1527 aa		40.62	■■■■■ 4.09
U2AF2-206	ENST00000590551	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.62	■■■■■ 4.09
U2AF2-206	ENST00000590551	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.58	■■■■■ 4.09	8e-8	■■■■■ 38.9
U2AF2-206	ENST00000590551	ABCC5	O15440	1437 aa		40.58	■■■■■ 4.09
U2AF2-206	ENST00000590551	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		40.58	■■■■■ 4.09
U2AF2-206	ENST00000590551	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.57	■■■■■ 4.08
U2AF2-206	ENST00000590551	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.56	■■■■■ 4.08
U2AF2-206	ENST00000590551	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.56	■■■■■ 4.08
U2AF2-206	ENST00000590551	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		40.55	■■■■■ 4.08
U2AF2-206	ENST00000590551	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.53	■■■■■ 4.08
U2AF2-206	ENST00000590551	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.51	■■■■■ 4.08
U2AF2-206	ENST00000590551	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.5	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.5	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.5	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.49	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.48	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.47	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	DAPK1	P53355	1430 aa		40.47	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		40.46	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	MED14	O60244	1454 aa		40.45	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
U2AF2-206	ENST00000590551	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
U2AF2-206	ENST00000590551	CPS1	P31327	1500 aa		40.43	■■■■■ 4.06
U2AF2-206	ENST00000590551	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.42	■■■■■ 4.06
U2AF2-206	ENST00000590551	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.4	■■■■■ 4.06
U2AF2-206	ENST00000590551	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.4	■■■■■ 4.06
U2AF2-206	ENST00000590551	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.06
U2AF2-206	ENST00000590551	KANK1	Q14678	1352 aa		40.37	■■■■■ 4.05
U2AF2-206	ENST00000590551	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.37	■■■■■ 4.05	2e-7	■■■□□ 14.7
U2AF2-206	ENST00000590551	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.36	■■■■■ 4.05
U2AF2-206	ENST00000590551	TOM1	O60784	492 aa		40.33	■■■■■ 4.05
U2AF2-206	ENST00000590551	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.33	■■■■■ 4.05
U2AF2-206	ENST00000590551	CEP152	O94986	1710 aa		40.29	■■■■■ 4.04
U2AF2-206	ENST00000590551	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.29	■■■■■ 4.04
U2AF2-206	ENST00000590551	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.23	■■■■■ 4.03
U2AF2-206	ENST00000590551	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
U2AF2-206	ENST00000590551	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
U2AF2-206	ENST00000590551	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.21	■■■■■ 4.03
U2AF2-206	ENST00000590551	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.21	■■■■■ 4.03
U2AF2-206	ENST00000590551	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.2	■■■■■ 4.03
U2AF2-206	ENST00000590551	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.19	■■■■■ 4.02
U2AF2-206	ENST00000590551	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.19	■■■■■ 4.02
U2AF2-206	ENST00000590551	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.18	■■■■■ 4.02
U2AF2-206	ENST00000590551	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.18	■■■■■ 4.02
U2AF2-206	ENST00000590551	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.17	■■■■■ 4.02
U2AF2-206	ENST00000590551	LTK	P29376	864 aa		40.17	■■■■■ 4.02
U2AF2-206	ENST00000590551	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.17	■■■■■ 4.02
U2AF2-206	ENST00000590551	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.17	■■■■■ 4.02
U2AF2-206	ENST00000590551	SLIT1	O75093	1534 aa		40.16	■■■■■ 4.02
U2AF2-206	ENST00000590551	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01
U2AF2-206	ENST00000590551	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.1	■■■■■ 4.01
U2AF2-206	ENST00000590551	HSPA1L	P34931	641 aa		40.09	■■■■■ 4.01
U2AF2-206	ENST00000590551	IDI1	Q13907	227 aa		40.09	■■■■■ 4.01
U2AF2-206	ENST00000590551	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.08	■■■■■ 4.01
U2AF2-206	ENST00000590551	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.06	■■■■■ 4
U2AF2-206	ENST00000590551	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.05	■■■■■ 4
U2AF2-206	ENST00000590551	NOS1	P29475	1434 aa		40.03	■■■■■ 4
U2AF2-206	ENST00000590551	SOCS7	O14512	581 aa		40.03	■■■■■ 4
U2AF2-206	ENST00000590551	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.01	■■■■■ 4
U2AF2-206	ENST00000590551	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40	■■■■□ 3.99
U2AF2-206	ENST00000590551	SYNM	O15061	1565 aa		39.98	■■■■□ 3.99
U2AF2-206	ENST00000590551	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	39.96	■■■■□ 3.99
U2AF2-206	ENST00000590551	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	39.96	■■■■□ 3.99
U2AF2-206	ENST00000590551	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		39.92	■■■■□ 3.98
U2AF2-206	ENST00000590551	ALK	Q9UM73	1620 aa		39.9	■■■■□ 3.98
U2AF2-206	ENST00000590551	ROCK1	Q13464	1354 aa		39.89	■■■■□ 3.98
U2AF2-206	ENST00000590551	KCNA6	P17658	529 aa		39.85	■■■■□ 3.97
U2AF2-206	ENST00000590551	ADGRB3	O60242	1522 aa		39.85	■■■■□ 3.97
U2AF2-206	ENST00000590551	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	39.83	■■■■□ 3.97
U2AF2-206	ENST00000590551	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		39.8	■■■■□ 3.96
U2AF2-206	ENST00000590551	TET3	O43151	1660 aa		39.77	■■■■□ 3.96
U2AF2-206	ENST00000590551	BCAN	Q96GW7	911 aa		39.77	■■■■□ 3.96
U2AF2-206	ENST00000590551	TMEM94	Q12767	1356 aa		39.72	■■■■□ 3.95
U2AF2-206	ENST00000590551	UNC13B	O14795	1591 aa		39.72	■■■■□ 3.95
U2AF2-206	ENST00000590551	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	39.72	■■■■□ 3.95
U2AF2-206	ENST00000590551	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	39.72	■■■■□ 3.95
U2AF2-206	ENST00000590551	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	39.7	■■■■□ 3.95
U2AF2-206	ENST00000590551	ZFYVE9	O95405	1425 aa		39.69	■■■■□ 3.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms