RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588971.1

HSPBP1-208, Transcript of HSPA (Hsp70) binding protein 1, human

TSL 3

Gene HSPBP1, Length 696 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HSPBP1-208	ENST00000588971	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
HSPBP1-208	ENST00000588971	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.79	■■■■□ 3
HSPBP1-208	ENST00000588971	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.77	■■■■□ 3
HSPBP1-208	ENST00000588971	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.77	■■■■□ 3
HSPBP1-208	ENST00000588971	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.76	■■■□□ 2.99
HSPBP1-208	ENST00000588971	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
HSPBP1-208	ENST00000588971	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
HSPBP1-208	ENST00000588971	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HSPBP1-208	ENST00000588971	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HSPBP1-208	ENST00000588971	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.72	■■■□□ 2.99
HSPBP1-208	ENST00000588971	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
HSPBP1-208	ENST00000588971	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.69	■■■□□ 2.98
HSPBP1-208	ENST00000588971	ITGAE	P38570	1179 aa		33.68	■■■□□ 2.98
HSPBP1-208	ENST00000588971	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.68	■■■□□ 2.98
HSPBP1-208	ENST00000588971	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.66	■■■□□ 2.98
HSPBP1-208	ENST00000588971	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.65	■■■□□ 2.98
HSPBP1-208	ENST00000588971	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.64	■■■□□ 2.98
HSPBP1-208	ENST00000588971	CEP152	O94986	1710 aa		33.63	■■■□□ 2.97
HSPBP1-208	ENST00000588971	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.62	■■■□□ 2.97
HSPBP1-208	ENST00000588971	NPAT	Q14207	1427 aa		33.62	■■■□□ 2.97
HSPBP1-208	ENST00000588971	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
HSPBP1-208	ENST00000588971	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.59	■■■□□ 2.97
HSPBP1-208	ENST00000588971	ABCC3	O15438	1527 aa		33.58	■■■□□ 2.97
HSPBP1-208	ENST00000588971	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.58	■■■□□ 2.97
HSPBP1-208	ENST00000588971	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HSPBP1-208	ENST00000588971	KANK1	Q14678	1352 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HSPBP1-208	ENST00000588971	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.54	■■■□□ 2.96
HSPBP1-208	ENST00000588971	PZP	P20742	1482 aa		33.54	■■■□□ 2.96
HSPBP1-208	ENST00000588971	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.5	■■■□□ 2.95
HSPBP1-208	ENST00000588971	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
HSPBP1-208	ENST00000588971	HSPA2	P54652	639 aa		33.47	■■■□□ 2.95
HSPBP1-208	ENST00000588971	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.45	■■■□□ 2.95
HSPBP1-208	ENST00000588971	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
HSPBP1-208	ENST00000588971	UNC13B	O14795	1591 aa		33.43	■■■□□ 2.94
HSPBP1-208	ENST00000588971	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
HSPBP1-208	ENST00000588971	TNR	Q92752	1358 aa		33.41	■■■□□ 2.94
HSPBP1-208	ENST00000588971	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.41	■■■□□ 2.94
HSPBP1-208	ENST00000588971	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.41	■■■□□ 2.94
HSPBP1-208	ENST00000588971	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
HSPBP1-208	ENST00000588971	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.38	■■■□□ 2.93
HSPBP1-208	ENST00000588971	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.38	■■■□□ 2.93
HSPBP1-208	ENST00000588971	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.35	■■■□□ 2.93
HSPBP1-208	ENST00000588971	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.33	■■■□□ 2.93
HSPBP1-208	ENST00000588971	TET3	O43151	1660 aa		33.33	■■■□□ 2.93
HSPBP1-208	ENST00000588971	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.32	■■■□□ 2.92
HSPBP1-208	ENST00000588971	NAIP	Q13075	1403 aa		33.31	■■■□□ 2.92
HSPBP1-208	ENST00000588971	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.31	■■■□□ 2.92
HSPBP1-208	ENST00000588971	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.3	■■■□□ 2.92
HSPBP1-208	ENST00000588971	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.29	■■■□□ 2.92
HSPBP1-208	ENST00000588971	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.28	■■■□□ 2.92
HSPBP1-208	ENST00000588971	NUP155	O75694	1391 aa		33.24	■■■□□ 2.91
HSPBP1-208	ENST00000588971	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
HSPBP1-208	ENST00000588971	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.21	■■■□□ 2.91
HSPBP1-208	ENST00000588971		E9PCH4	1651 aa		33.19	■■■□□ 2.9
HSPBP1-208	ENST00000588971	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.18	■■■□□ 2.9
HSPBP1-208	ENST00000588971	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.17	■■■□□ 2.9
HSPBP1-208	ENST00000588971	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HSPBP1-208	ENST00000588971	SYNM	O15061	1565 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HSPBP1-208	ENST00000588971	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
HSPBP1-208	ENST00000588971	NOS1	P29475	1434 aa		33.13	■■■□□ 2.89
HSPBP1-208	ENST00000588971	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
HSPBP1-208	ENST00000588971	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.11	■■■□□ 2.89
HSPBP1-208	ENST00000588971	PKD2	Q13563	968 aa		33.09	■■■□□ 2.89
HSPBP1-208	ENST00000588971	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.09	■■■□□ 2.89
HSPBP1-208	ENST00000588971	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.07	■■■□□ 2.88
HSPBP1-208	ENST00000588971	PTPRT	O14522	1441 aa		33.07	■■■□□ 2.88
HSPBP1-208	ENST00000588971	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
HSPBP1-208	ENST00000588971	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.04	■■■□□ 2.88
HSPBP1-208	ENST00000588971	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.04	■■■□□ 2.88
HSPBP1-208	ENST00000588971	IDI1	Q13907	227 aa		33.03	■■■□□ 2.88
HSPBP1-208	ENST00000588971	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.02	■■■□□ 2.88
HSPBP1-208	ENST00000588971	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.01	■■■□□ 2.87
HSPBP1-208	ENST00000588971	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33	■■■□□ 2.87
HSPBP1-208	ENST00000588971	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.97	■■■□□ 2.87
HSPBP1-208	ENST00000588971	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
HSPBP1-208	ENST00000588971	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
HSPBP1-208	ENST00000588971	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.96	■■■□□ 2.87
HSPBP1-208	ENST00000588971	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.95	■■■□□ 2.87
HSPBP1-208	ENST00000588971	SLIT1	O75093	1534 aa		32.94	■■■□□ 2.86
HSPBP1-208	ENST00000588971	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
HSPBP1-208	ENST00000588971	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.91	■■■□□ 2.86
HSPBP1-208	ENST00000588971	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.89	■■■□□ 2.86
HSPBP1-208	ENST00000588971	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.89	■■■□□ 2.86
HSPBP1-208	ENST00000588971	MED14	O60244	1454 aa		32.89	■■■□□ 2.86
HSPBP1-208	ENST00000588971	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
HSPBP1-208	ENST00000588971	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.87	■■■□□ 2.85
HSPBP1-208	ENST00000588971	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.87	■■■□□ 2.85
HSPBP1-208	ENST00000588971	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
HSPBP1-208	ENST00000588971	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.86	■■■□□ 2.85
HSPBP1-208	ENST00000588971	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
HSPBP1-208	ENST00000588971	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.85	■■■□□ 2.85
HSPBP1-208	ENST00000588971	TRPM2	O94759	1503 aa		32.84	■■■□□ 2.85
HSPBP1-208	ENST00000588971	KIF1B	O60333	1816 aa		32.81	■■■□□ 2.84
HSPBP1-208	ENST00000588971	LTK	P29376	864 aa		32.8	■■■□□ 2.84
HSPBP1-208	ENST00000588971	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.8	■■■□□ 2.84
HSPBP1-208	ENST00000588971	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.8	■■■□□ 2.84
HSPBP1-208	ENST00000588971	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
HSPBP1-208	ENST00000588971	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.73	■■■□□ 2.83
HSPBP1-208	ENST00000588971	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.73	■■■□□ 2.83
HSPBP1-208	ENST00000588971	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83

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