RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 KIF3BO15066 747 aa21.17■□□□□ 0.98
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GGA3-216ENST00000583282 NAIPQ13075 1403 aa21.16■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 UNC13BO14795 1591 aa21.15■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 GGT6Q6P531 493 aa21.14■□□□□ 0.97
GGA3-216ENST00000583282 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
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GGA3-216ENST00000583282 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.08■□□□□ 0.96
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GGA3-216ENST00000583282 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21■□□□□ 0.95
GGA3-216ENST00000583282 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21■□□□□ 0.95
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GGA3-216ENST00000583282 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.9■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 ERVK-7P63135 1459 aa20.89■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.88■□□□□ 0.93
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GGA3-216ENST00000583282 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.86■□□□□ 0.93
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GGA3-216ENST00000583282 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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GGA3-216ENST00000583282 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.75■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.75■□□□□ 0.91
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GGA3-216ENST00000583282 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.71■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.71■□□□□ 0.91
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GGA3-216ENST00000583282 PTPRTO14522 1441 aa20.69■□□□□ 0.9
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GGA3-216ENST00000583282 KIF1BO60333 1816 aa20.66■□□□□ 0.9
GGA3-216ENST00000583282 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
GGA3-216ENST00000583282 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
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GGA3-216ENST00000583282 HSPA2P54652 639 aa20.63■□□□□ 0.89
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GGA3-216ENST00000583282 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.59■□□□□ 0.89
GGA3-216ENST00000583282 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.58■□□□□ 0.88
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GGA3-216ENST00000583282 IFT172Q9UG01 1749 aa20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 PPLO60437 1756 aa20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 ZFYVE9O95405 1425 aa20.48■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.48■□□□□ 0.87
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