RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580308.5

EPB41L3-218, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3, humanhuman

TSL 4

Gene EPB41L3, Length 492 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3-218ENST00000580308 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.26■■■■■ 4.36
EPB41L3-218ENST00000580308 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
EPB41L3-218ENST00000580308 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
EPB41L3-218ENST00000580308 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.23■■■■■ 4.35
EPB41L3-218ENST00000580308 ABCC5O15440 1437 aa42.22■■■■■ 4.35
EPB41L3-218ENST00000580308 NCOA1Q15788 1441 aa42.22■■■■■ 4.35
EPB41L3-218ENST00000580308 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 PZPP20742 1482 aa42.17■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.17■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.17■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 PTPRTO14522 1441 aa42.16■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 FBXO41Q8TF61 875 aa42.16■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.15■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.15■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 DAPK1P53355 1430 aa42.13■■■■■ 4.34
EPB41L3-218ENST00000580308 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.12■■■■■ 4.33
EPB41L3-218ENST00000580308 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
EPB41L3-218ENST00000580308 ABCC3O15438 1527 aa42.09■■■■■ 4.33
EPB41L3-218ENST00000580308 PLA2R1Q13018 1463 aa42.07■■■■■ 4.33
EPB41L3-218ENST00000580308 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.06■■■■■ 4.32
EPB41L3-218ENST00000580308 KIF15Q9NS87 1388 aa42.06■■■■■ 4.32
EPB41L3-218ENST00000580308 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
EPB41L3-218ENST00000580308 TNRQ92752 1358 aa42.02■■■■■ 4.32
EPB41L3-218ENST00000580308 ERBINQ96RT1 1412 aa42.02■■■■■ 4.32
EPB41L3-218ENST00000580308 CERKQ8TCT0 537 aa42.01■■■■■ 4.32
EPB41L3-218ENST00000580308 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
EPB41L3-218ENST00000580308 CEP152O94986 1710 aa41.95■■■■■ 4.31
EPB41L3-218ENST00000580308 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.94■■■■■ 4.3
EPB41L3-218ENST00000580308 DEPDC5O75140 1603 aa41.94■■■■■ 4.3
EPB41L3-218ENST00000580308 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.93■■■■■ 4.3
EPB41L3-218ENST00000580308 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.92■■■■■ 4.3
EPB41L3-218ENST00000580308 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.9■■■■■ 4.3
EPB41L3-218ENST00000580308 ADGRL2O95490 1459 aa41.9■■■■■ 4.3
EPB41L3-218ENST00000580308 NLRP1Q9C000 1473 aa41.9■■■■■ 4.3
EPB41L3-218ENST00000580308 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.88■■■■■ 4.3
EPB41L3-218ENST00000580308 PKD2Q13563 968 aa41.88■■■■■ 4.29
EPB41L3-218ENST00000580308 ERVK-7P63135 1459 aa41.85■■■■■ 4.29
EPB41L3-218ENST00000580308 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.83■■■■■ 4.29
EPB41L3-218ENST00000580308 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
EPB41L3-218ENST00000580308 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.79■■■■■ 4.28
EPB41L3-218ENST00000580308 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
EPB41L3-218ENST00000580308 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.78■■■■■ 4.28
EPB41L3-218ENST00000580308 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.77■■■■■ 4.28
EPB41L3-218ENST00000580308 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.77■■■■■ 4.28
EPB41L3-218ENST00000580308 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.72■■■■■ 4.27
EPB41L3-218ENST00000580308 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.26
EPB41L3-218ENST00000580308 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
EPB41L3-218ENST00000580308 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.67■■■■■ 4.26
EPB41L3-218ENST00000580308 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
EPB41L3-218ENST00000580308 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
EPB41L3-218ENST00000580308 KANK1Q14678 1352 aa41.65■■■■■ 4.26
EPB41L3-218ENST00000580308 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.65■■■■■ 4.26
EPB41L3-218ENST00000580308 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.62■■■■■ 4.25
EPB41L3-218ENST00000580308 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.62■■■■■ 4.25
EPB41L3-218ENST00000580308 MED14O60244 1454 aa41.6■■■■■ 4.25
EPB41L3-218ENST00000580308 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.58■■■■■ 4.25
EPB41L3-218ENST00000580308 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.58■■■■■ 4.25
EPB41L3-218ENST00000580308 ROCK1Q13464 1354 aa41.53■■■■■ 4.24
EPB41L3-218ENST00000580308 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
EPB41L3-218ENST00000580308 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
EPB41L3-218ENST00000580308 IQGAP1P46940 1657 aa41.49■■■■■ 4.23
EPB41L3-218ENST00000580308 PIK3C2BO00750 1634 aa41.49■■■■■ 4.23
EPB41L3-218ENST00000580308 UNC13BO14795 1591 aa41.49■■■■■ 4.23
EPB41L3-218ENST00000580308 SYNMO15061 1565 aa41.48■■■■■ 4.23
EPB41L3-218ENST00000580308 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.47■■■■■ 4.23
EPB41L3-218ENST00000580308 SLIT1O75093 1534 aa41.47■■■■■ 4.23
EPB41L3-218ENST00000580308 NOS1P29475 1434 aa41.46■■■■■ 4.23
EPB41L3-218ENST00000580308 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
EPB41L3-218ENST00000580308 TET3O43151 1660 aa41.42■■■■■ 4.22
EPB41L3-218ENST00000580308 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
EPB41L3-218ENST00000580308 CPS1P31327 1500 aa41.39■■■■■ 4.22
EPB41L3-218ENST00000580308 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
EPB41L3-218ENST00000580308 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.36■■■■■ 4.21
EPB41L3-218ENST00000580308 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
EPB41L3-218ENST00000580308 IDI1Q13907 227 aa41.33■■■■■ 4.21
EPB41L3-218ENST00000580308 LTKP29376 864 aa41.31■■■■■ 4.2
EPB41L3-218ENST00000580308 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.31■■■■■ 4.2
EPB41L3-218ENST00000580308 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.3■■■■■ 4.2
EPB41L3-218ENST00000580308 ADGRB3O60242 1522 aa41.29■■■■■ 4.2
EPB41L3-218ENST00000580308 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.27■■■■■ 4.2
EPB41L3-218ENST00000580308 ITGAEP38570 1179 aa41.27■■■■■ 4.2
EPB41L3-218ENST00000580308 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.25■■■■■ 4.19
EPB41L3-218ENST00000580308 E9PCH4 1651 aa41.25■■■■■ 4.19
EPB41L3-218ENST00000580308 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.23■■■■■ 4.19
EPB41L3-218ENST00000580308 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.19■■■■■ 4.18
EPB41L3-218ENST00000580308 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.18■■■■■ 4.18
EPB41L3-218ENST00000580308 EID1Q9Y6B2 187 aa41.17■■■■■ 4.18
EPB41L3-218ENST00000580308 NUP155O75694 1391 aa41.12■■■■■ 4.17
EPB41L3-218ENST00000580308 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.12■■■■■ 4.17
EPB41L3-218ENST00000580308 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.11■■■■■ 4.17
EPB41L3-218ENST00000580308 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.11■■■■■ 4.17
EPB41L3-218ENST00000580308 ALKQ9UM73 1620 aa41.07■■■■■ 4.17
EPB41L3-218ENST00000580308 ZFYVE9O95405 1425 aa41.07■■■■■ 4.16
EPB41L3-218ENST00000580308 NAIPQ13075 1403 aa41.04■■■■■ 4.16
EPB41L3-218ENST00000580308 TOM1O60784 492 aa40.97■■■■■ 4.15
EPB41L3-218ENST00000580308 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
EPB41L3-218ENST00000580308 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.95■■■■■ 4.15
EPB41L3-218ENST00000580308 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.93■■■■■ 4.14
EPB41L3-218ENST00000580308 HFM1A2PYH4 1435 aa40.93■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms