RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 USP35Q9P2H5 1018 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 SMARCA2P51531 1590 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 ST18O60284 1047 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.51■■□□□ 1.84
PTPRM-211ENST00000580170 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 PDE4AP27815 886 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 PANK3Q9H999 370 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 PLIN1O60240 522 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 FAM161AQ3B820 660 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.831e-6■■□□□ 13.3
PTPRM-211ENST00000580170 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 PHF14O94880 888 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 SLC4A3P48751 1232 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 WIZO95785 1651 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 KIF16BQ96L93 1317 aa26.45■■□□□ 1.83
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 GSE1Q14687 1217 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 CRBNQ96SW2 442 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 AMPHP49418 695 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 E9PSI1 815 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRM-211ENST00000580170 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 RILPL2Q969X0 211 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 USP47Q96K76 1375 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 COG6Q9Y2V7 657 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 KIF3AQ9Y496 699 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRM-211ENST00000580170 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 TOMM22Q9NS69 142 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 NUTM2FA1L443 756 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 EID1Q9Y6B2 187 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 H3BQV1 296 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 IFFO2Q5TF58 517 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 UACAQ9BZF9 1416 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRM-211ENST00000580170 TPM3P06753 285 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 APAF1O14727 1248 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 COG3Q96JB2 828 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 EVC2Q86UK5 1308 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 PDE4CQ08493 712 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-211ENST00000580170 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 BECN2A8MW95 431 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 JPH4Q96JJ6 628 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 MARCH6O60337 910 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 REC8O95072 547 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 G3V3G9 751 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRM-211ENST00000580170 MCTP1Q6DN14 999 aa26.14■■□□□ 1.77
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