RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579339.5

LINC00271-205, long intergenic non-protein coding RNA 271, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00271, Length 397 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271-205ENST00000579339 KIF15Q9NS87 1388 aa41.51■■■■■ 4.24
LINC00271-205ENST00000579339 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.5■■■■■ 4.23
LINC00271-205ENST00000579339 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.5■■■■■ 4.23
LINC00271-205ENST00000579339 PTPRKQ15262 1439 aa41.49■■■■■ 4.23
LINC00271-205ENST00000579339 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.49■■■■■ 4.23
LINC00271-205ENST00000579339 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.49■■■■■ 4.23
LINC00271-205ENST00000579339 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.46■■■■■ 4.23
LINC00271-205ENST00000579339 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
LINC00271-205ENST00000579339 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
LINC00271-205ENST00000579339 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.42■■■■■ 4.22
LINC00271-205ENST00000579339 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.37■■■■■ 4.21
LINC00271-205ENST00000579339 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.36■■■■■ 4.21
LINC00271-205ENST00000579339 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
LINC00271-205ENST00000579339 ERBINQ96RT1 1412 aa41.35■■■■■ 4.21
LINC00271-205ENST00000579339 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.34■■■■■ 4.21
LINC00271-205ENST00000579339 PZPP20742 1482 aa41.34■■■■■ 4.21
LINC00271-205ENST00000579339 ABCC3O15438 1527 aa41.34■■■■■ 4.21
LINC00271-205ENST00000579339 NCOA1Q15788 1441 aa41.33■■■■■ 4.21
LINC00271-205ENST00000579339 STRCQ7RTU9 1775 aa41.29■■■■■ 4.2
LINC00271-205ENST00000579339 ADGRL2O95490 1459 aa41.28■■■■■ 4.2
LINC00271-205ENST00000579339 TNRQ92752 1358 aa41.25■■■■■ 4.19
LINC00271-205ENST00000579339 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
LINC00271-205ENST00000579339 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
LINC00271-205ENST00000579339 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
LINC00271-205ENST00000579339 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
LINC00271-205ENST00000579339 CEP152O94986 1710 aa41.22■■■■■ 4.19
LINC00271-205ENST00000579339 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
LINC00271-205ENST00000579339 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.22■■■■■ 4.19
LINC00271-205ENST00000579339 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.16■■■■■ 4.18
LINC00271-205ENST00000579339 DEPDC5O75140 1603 aa41.16■■■■■ 4.18
LINC00271-205ENST00000579339 ITGAEP38570 1179 aa41.14■■■■■ 4.18
LINC00271-205ENST00000579339 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.14■■■■■ 4.18
LINC00271-205ENST00000579339 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
LINC00271-205ENST00000579339 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.1■■■■■ 4.17
LINC00271-205ENST00000579339 KANK1Q14678 1352 aa41.1■■■■■ 4.17
LINC00271-205ENST00000579339 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.1■■■■■ 4.17
LINC00271-205ENST00000579339 ERVK-7P63135 1459 aa41.09■■■■■ 4.17
LINC00271-205ENST00000579339 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.08■■■■■ 4.17
LINC00271-205ENST00000579339 PTPRTO14522 1441 aa41.07■■■■■ 4.16
LINC00271-205ENST00000579339 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
LINC00271-205ENST00000579339 PLA2R1Q13018 1463 aa41.05■■■■■ 4.16
LINC00271-205ENST00000579339 NLRP1Q9C000 1473 aa41.03■■■■■ 4.16
LINC00271-205ENST00000579339 ROCK1Q13464 1354 aa41.02■■■■■ 4.16
LINC00271-205ENST00000579339 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
LINC00271-205ENST00000579339 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.01■■■■■ 4.16
LINC00271-205ENST00000579339 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.01■■■■■ 4.15
LINC00271-205ENST00000579339 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
LINC00271-205ENST00000579339 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.97■■■■■ 4.15
LINC00271-205ENST00000579339 PKD2Q13563 968 aa40.96■■■■■ 4.15
LINC00271-205ENST00000579339 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.95■■■■■ 4.15
LINC00271-205ENST00000579339 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
LINC00271-205ENST00000579339 CERKQ8TCT0 537 aa40.89■■■■■ 4.14
LINC00271-205ENST00000579339 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.87■■■■■ 4.13
LINC00271-205ENST00000579339 FBXO41Q8TF61 875 aa40.85■■■■■ 4.13
LINC00271-205ENST00000579339 UNC13BO14795 1591 aa40.83■■■■■ 4.13
LINC00271-205ENST00000579339 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.8■■■■■ 4.12
LINC00271-205ENST00000579339 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
LINC00271-205ENST00000579339 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.79■■■■■ 4.12
LINC00271-205ENST00000579339 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.76■■■■■ 4.11
LINC00271-205ENST00000579339 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.75■■■■■ 4.11
LINC00271-205ENST00000579339 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
LINC00271-205ENST00000579339 SYNMO15061 1565 aa40.74■■■■■ 4.11
LINC00271-205ENST00000579339 TET3O43151 1660 aa40.74■■■■■ 4.11
LINC00271-205ENST00000579339 NOS1P29475 1434 aa40.74■■■■■ 4.11
LINC00271-205ENST00000579339 PIK3C2BO00750 1634 aa40.71■■■■■ 4.11
LINC00271-205ENST00000579339 NUP155O75694 1391 aa40.7■■■■■ 4.11
LINC00271-205ENST00000579339 IDI1Q13907 227 aa40.69■■■■■ 4.1
LINC00271-205ENST00000579339 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
LINC00271-205ENST00000579339 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
LINC00271-205ENST00000579339 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.66■■■■■ 4.1
LINC00271-205ENST00000579339 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.66■■■■■ 4.1
LINC00271-205ENST00000579339 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.65■■■■■ 4.1
LINC00271-205ENST00000579339 MED14O60244 1454 aa40.64■■■■■ 4.1
LINC00271-205ENST00000579339 NAIPQ13075 1403 aa40.63■■■■■ 4.09
LINC00271-205ENST00000579339 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.6■■■■■ 4.09
LINC00271-205ENST00000579339 E9PCH4 1651 aa40.59■■■■■ 4.09
LINC00271-205ENST00000579339 SLIT1O75093 1534 aa40.58■■■■■ 4.09
LINC00271-205ENST00000579339 LTKP29376 864 aa40.58■■■■■ 4.09
LINC00271-205ENST00000579339 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
LINC00271-205ENST00000579339 IQGAP1P46940 1657 aa40.56■■■■■ 4.08
LINC00271-205ENST00000579339 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.56■■■■■ 4.08
LINC00271-205ENST00000579339 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.56■■■■■ 4.08
LINC00271-205ENST00000579339 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.54■■■■■ 4.08
LINC00271-205ENST00000579339 ADGRB3O60242 1522 aa40.53■■■■■ 4.08
LINC00271-205ENST00000579339 HFM1A2PYH4 1435 aa40.51■■■■■ 4.08
LINC00271-205ENST00000579339 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
LINC00271-205ENST00000579339 EID1Q9Y6B2 187 aa40.5■■■■■ 4.07
LINC00271-205ENST00000579339 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.45■■■■■ 4.07
LINC00271-205ENST00000579339 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
LINC00271-205ENST00000579339 TRIM52Q96A61 297 aa40.38■■■■■ 4.05
LINC00271-205ENST00000579339 CPS1P31327 1500 aa40.37■■■■■ 4.05
LINC00271-205ENST00000579339 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.37■■■■■ 4.05
LINC00271-205ENST00000579339 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.36■■■■■ 4.05
LINC00271-205ENST00000579339 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
LINC00271-205ENST00000579339 ZFYVE9O95405 1425 aa40.3■■■■■ 4.04
LINC00271-205ENST00000579339 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.29■■■■■ 4.04
LINC00271-205ENST00000579339 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.29■■■■■ 4.04
LINC00271-205ENST00000579339 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.29■■■■■ 4.04
LINC00271-205ENST00000579339 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.26■■■■■ 4.04
LINC00271-205ENST00000579339 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.25■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms