RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578709.5

ERBB2-209, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 2, human

TSL 4

Gene ERBB2, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB2-209	ENST00000578709	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	36.1	■■■■□ 3.37
ERBB2-209	ENST00000578709	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		36.09	■■■■□ 3.37
ERBB2-209	ENST00000578709	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	36.05	■■■■□ 3.36
ERBB2-209	ENST00000578709	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		36.04	■■■■□ 3.36
ERBB2-209	ENST00000578709	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		36.02	■■■■□ 3.36
ERBB2-209	ENST00000578709	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		36.01	■■■■□ 3.35
ERBB2-209	ENST00000578709	MROH2A	A6NES4	1674 aa		36	■■■■□ 3.35
ERBB2-209	ENST00000578709	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	35.99	■■■■□ 3.35
ERBB2-209	ENST00000578709	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		35.97	■■■■□ 3.35
ERBB2-209	ENST00000578709	DEPDC5	O75140	1603 aa		35.97	■■■■□ 3.35
ERBB2-209	ENST00000578709	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	35.95	■■■■□ 3.35
ERBB2-209	ENST00000578709	C3	P01024	1663 aa		35.94	■■■■□ 3.34
ERBB2-209	ENST00000578709	ZMYM3	Q14202	1370 aa		35.93	■■■■□ 3.34
ERBB2-209	ENST00000578709	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		35.91	■■■■□ 3.34
ERBB2-209	ENST00000578709	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	35.91	■■■■□ 3.34
ERBB2-209	ENST00000578709	ABCC3	O15438	1527 aa		35.89	■■■■□ 3.34
ERBB2-209	ENST00000578709	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	35.89	■■■■□ 3.34
ERBB2-209	ENST00000578709	NAIP	Q13075	1403 aa		35.86	■■■■□ 3.33
ERBB2-209	ENST00000578709	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		35.86	■■■■□ 3.33
ERBB2-209	ENST00000578709	HFM1	A2PYH4	1435 aa		35.85	■■■■□ 3.33
ERBB2-209	ENST00000578709	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		35.85	■■■■□ 3.33
ERBB2-209	ENST00000578709	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		35.84	■■■■□ 3.33
ERBB2-209	ENST00000578709	KANK1	Q14678	1352 aa		35.82	■■■■□ 3.32
ERBB2-209	ENST00000578709	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	35.82	■■■■□ 3.32
ERBB2-209	ENST00000578709	CEP152	O94986	1710 aa		35.81	■■■■□ 3.32
ERBB2-209	ENST00000578709	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	35.81	■■■■□ 3.32
ERBB2-209	ENST00000578709	UNC13B	O14795	1591 aa		35.81	■■■■□ 3.32
ERBB2-209	ENST00000578709	NPAT	Q14207	1427 aa		35.8	■■■■□ 3.32
ERBB2-209	ENST00000578709	PZP	P20742	1482 aa		35.78	■■■■□ 3.32
ERBB2-209	ENST00000578709	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		35.78	■■■■□ 3.32
ERBB2-209	ENST00000578709	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		35.75	■■■■□ 3.31
ERBB2-209	ENST00000578709	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		35.72	■■■■□ 3.31
ERBB2-209	ENST00000578709	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		35.69	■■■■□ 3.3
ERBB2-209	ENST00000578709	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		35.67	■■■■□ 3.3
ERBB2-209	ENST00000578709	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		35.66	■■■■□ 3.3
ERBB2-209	ENST00000578709	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	35.66	■■■■□ 3.3
ERBB2-209	ENST00000578709	NUP155	O75694	1391 aa		35.64	■■■■□ 3.3
ERBB2-209	ENST00000578709	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		35.64	■■■■□ 3.3
ERBB2-209	ENST00000578709	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		35.63	■■■■□ 3.29
ERBB2-209	ENST00000578709	TET3	O43151	1660 aa		35.62	■■■■□ 3.29
ERBB2-209	ENST00000578709	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		35.61	■■■■□ 3.29
ERBB2-209	ENST00000578709	ERVK-7	P63135	1459 aa		35.6	■■■■□ 3.29
ERBB2-209	ENST00000578709	TNR	Q92752	1358 aa		35.6	■■■■□ 3.29
ERBB2-209	ENST00000578709	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	35.57	■■■■□ 3.29
ERBB2-209	ENST00000578709	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		35.57	■■■■□ 3.28
ERBB2-209	ENST00000578709	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		35.57	■■■■□ 3.28
ERBB2-209	ENST00000578709	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	35.55	■■■■□ 3.28
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	35.52	■■■■□ 3.28
ERBB2-209	ENST00000578709	NLRP1	Q9C000	1473 aa		35.49	■■■■□ 3.27
ERBB2-209	ENST00000578709	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	35.48	■■■■□ 3.27
ERBB2-209	ENST00000578709		E9PCH4	1651 aa		35.48	■■■■□ 3.27
ERBB2-209	ENST00000578709	NOS1	P29475	1434 aa		35.48	■■■■□ 3.27
ERBB2-209	ENST00000578709	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		35.48	■■■■□ 3.27
ERBB2-209	ENST00000578709	TRIM52	Q96A61	297 aa		35.46	■■■■□ 3.27
ERBB2-209	ENST00000578709	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	35.46	■■■■□ 3.27
ERBB2-209	ENST00000578709	HSPA2	P54652	639 aa		35.45	■■■■□ 3.27
ERBB2-209	ENST00000578709	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		35.43	■■■■□ 3.26
ERBB2-209	ENST00000578709	SYNM	O15061	1565 aa		35.41	■■■■□ 3.26
ERBB2-209	ENST00000578709	HRC	P23327	699 aa		35.35	■■■■□ 3.25
ERBB2-209	ENST00000578709	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	35.33	■■■■□ 3.25
ERBB2-209	ENST00000578709	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	35.33	■■■■□ 3.25
ERBB2-209	ENST00000578709	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		35.33	■■■■□ 3.25
ERBB2-209	ENST00000578709	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		35.31	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	PKD2	Q13563	968 aa		35.3	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	PTPRT	O14522	1441 aa		35.3	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	IDI1	Q13907	227 aa		35.29	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	PLA2R1	Q13018	1463 aa		35.29	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	PIK3C2B	O00750	1634 aa		35.28	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		35.27	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		35.27	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	35.26	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		35.26	■■■■□ 3.24
ERBB2-209	ENST00000578709	STRC	Q7RTU9	1775 aa		35.25	■■■■□ 3.23
ERBB2-209	ENST00000578709	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	35.25	■■■■□ 3.23
ERBB2-209	ENST00000578709	TRPM2	O94759	1503 aa		35.2	■■■■□ 3.23
ERBB2-209	ENST00000578709	ADGRB3	O60242	1522 aa		35.19	■■■■□ 3.22
ERBB2-209	ENST00000578709	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		35.15	■■■■□ 3.22
ERBB2-209	ENST00000578709	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		35.14	■■■■□ 3.22
ERBB2-209	ENST00000578709	SLIT1	O75093	1534 aa		35.13	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		35.13	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	FOXD1	Q16676	465 aa		35.12	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		35.11	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		35.1	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		35.1	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	CLTCL1	P53675	1640 aa		35.1	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	35.09	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		35.09	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		35.08	■■■■□ 3.21
ERBB2-209	ENST00000578709	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		35.06	■■■■□ 3.2
ERBB2-209	ENST00000578709	MED14	O60244	1454 aa		35.03	■■■■□ 3.2
ERBB2-209	ENST00000578709	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	35.02	■■■■□ 3.2
ERBB2-209	ENST00000578709	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	35.01	■■■■□ 3.2
ERBB2-209	ENST00000578709	LTK	P29376	864 aa		35	■■■■□ 3.19
ERBB2-209	ENST00000578709	ZFYVE9	O95405	1425 aa		34.98	■■■■□ 3.19
ERBB2-209	ENST00000578709	KIF1B	O60333	1816 aa		34.98	■■■■□ 3.19
ERBB2-209	ENST00000578709	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		34.98	■■■■□ 3.19
ERBB2-209	ENST00000578709	EID1	Q9Y6B2	187 aa		34.98	■■■■□ 3.19
ERBB2-209	ENST00000578709	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		34.97	■■■■□ 3.19
ERBB2-209	ENST00000578709	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	34.96	■■■■□ 3.19
ERBB2-209	ENST00000578709	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		34.95	■■■■□ 3.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms