RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575288.5

PITPNA-207, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PITPNA, Length 1,264 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNA-207ENST00000575288 KIF15Q9NS87 1388 aa42.26■■■■■ 4.35
PITPNA-207ENST00000575288 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.25■■■■■ 4.35
PITPNA-207ENST00000575288 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.25■■■■■ 4.35
PITPNA-207ENST00000575288 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.24■■■■■ 4.35
PITPNA-207ENST00000575288 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.21■■■■■ 4.35
PITPNA-207ENST00000575288 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
PITPNA-207ENST00000575288 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.2■■■■■ 4.35
PITPNA-207ENST00000575288 PTPRKQ15262 1439 aa42.2■■■■■ 4.35
PITPNA-207ENST00000575288 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
PITPNA-207ENST00000575288 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.19■■■■■ 4.34
PITPNA-207ENST00000575288 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.14■■■■■ 4.34
PITPNA-207ENST00000575288 ERBINQ96RT1 1412 aa42.12■■■■■ 4.33
PITPNA-207ENST00000575288 NCOA1Q15788 1441 aa42.11■■■■■ 4.33
PITPNA-207ENST00000575288 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.1■■■■■ 4.33
PITPNA-207ENST00000575288 ABCC3O15438 1527 aa42.06■■■■■ 4.32
PITPNA-207ENST00000575288 ADGRL2O95490 1459 aa42.06■■■■■ 4.32
PITPNA-207ENST00000575288 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
PITPNA-207ENST00000575288 PZPP20742 1482 aa42.05■■■■■ 4.32
PITPNA-207ENST00000575288 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.04■■■■■ 4.32
PITPNA-207ENST00000575288 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
PITPNA-207ENST00000575288 STRCQ7RTU9 1775 aa41.99■■■■■ 4.31
PITPNA-207ENST00000575288 CEP152O94986 1710 aa41.97■■■■■ 4.31
PITPNA-207ENST00000575288 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
PITPNA-207ENST00000575288 TNRQ92752 1358 aa41.96■■■■■ 4.31
PITPNA-207ENST00000575288 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
PITPNA-207ENST00000575288 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.95■■■■■ 4.314e-8■■■□□ 19.2
PITPNA-207ENST00000575288 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
PITPNA-207ENST00000575288 DEPDC5O75140 1603 aa41.93■■■■■ 4.3
PITPNA-207ENST00000575288 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.9■■■■■ 4.3
PITPNA-207ENST00000575288 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.39e-7■■■■■ 29.3
PITPNA-207ENST00000575288 ITGAEP38570 1179 aa41.88■■■■■ 4.29
PITPNA-207ENST00000575288 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.87■■■■■ 4.29
PITPNA-207ENST00000575288 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.86■■■■■ 4.29
PITPNA-207ENST00000575288 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.85■■■■■ 4.29
PITPNA-207ENST00000575288 KANK1Q14678 1352 aa41.85■■■■■ 4.29
PITPNA-207ENST00000575288 ROCK1Q13464 1354 aa41.81■■■■■ 4.28
PITPNA-207ENST00000575288 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.8■■■■■ 4.28
PITPNA-207ENST00000575288 ERVK-7P63135 1459 aa41.8■■■■■ 4.28
PITPNA-207ENST00000575288 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
PITPNA-207ENST00000575288 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
PITPNA-207ENST00000575288 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.77■■■■■ 4.28
PITPNA-207ENST00000575288 NLRP1Q9C000 1473 aa41.76■■■■■ 4.28
PITPNA-207ENST00000575288 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.76■■■■■ 4.28
PITPNA-207ENST00000575288 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.75■■■■■ 4.27
PITPNA-207ENST00000575288 PLA2R1Q13018 1463 aa41.75■■■■■ 4.27
PITPNA-207ENST00000575288 PTPRTO14522 1441 aa41.75■■■■■ 4.27
PITPNA-207ENST00000575288 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.72■■■■■ 4.27
PITPNA-207ENST00000575288 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
PITPNA-207ENST00000575288 PKD2Q13563 968 aa41.66■■■■■ 4.26
PITPNA-207ENST00000575288 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.66■■■■■ 4.26
PITPNA-207ENST00000575288 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
PITPNA-207ENST00000575288 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.61■■■■■ 4.25
PITPNA-207ENST00000575288 UNC13BO14795 1591 aa41.6■■■■■ 4.25
PITPNA-207ENST00000575288 CERKQ8TCT0 537 aa41.53■■■■■ 4.24
PITPNA-207ENST00000575288 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
PITPNA-207ENST00000575288 TET3O43151 1660 aa41.5■■■■■ 4.23
PITPNA-207ENST00000575288 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.5■■■■■ 4.23
PITPNA-207ENST00000575288 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.49■■■■■ 4.23
PITPNA-207ENST00000575288 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.48■■■■■ 4.23
PITPNA-207ENST00000575288 NOS1P29475 1434 aa41.47■■■■■ 4.23
PITPNA-207ENST00000575288 FBXO41Q8TF61 875 aa41.47■■■■■ 4.23
PITPNA-207ENST00000575288 SYNMO15061 1565 aa41.46■■■■■ 4.23
PITPNA-207ENST00000575288 NUP155O75694 1391 aa41.45■■■■■ 4.23
PITPNA-207ENST00000575288 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
PITPNA-207ENST00000575288 PIK3C2BO00750 1634 aa41.44■■■■■ 4.22
PITPNA-207ENST00000575288 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.44■■■■■ 4.22
PITPNA-207ENST00000575288 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.43■■■■■ 4.22
PITPNA-207ENST00000575288 IDI1Q13907 227 aa41.42■■■■■ 4.22
PITPNA-207ENST00000575288 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.42■■■■■ 4.22
PITPNA-207ENST00000575288 NAIPQ13075 1403 aa41.4■■■■■ 4.22
PITPNA-207ENST00000575288 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
PITPNA-207ENST00000575288 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.35■■■■■ 4.21
PITPNA-207ENST00000575288 E9PCH4 1651 aa41.35■■■■■ 4.21
PITPNA-207ENST00000575288 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
PITPNA-207ENST00000575288 MED14O60244 1454 aa41.34■■■■■ 4.21
PITPNA-207ENST00000575288 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.32■■■■■ 4.21
PITPNA-207ENST00000575288 SLIT1O75093 1534 aa41.31■■■■■ 4.2
PITPNA-207ENST00000575288 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.31■■■■■ 4.2
PITPNA-207ENST00000575288 HFM1A2PYH4 1435 aa41.3■■■■■ 4.2
PITPNA-207ENST00000575288 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
PITPNA-207ENST00000575288 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
PITPNA-207ENST00000575288 LTKP29376 864 aa41.27■■■■■ 4.2
PITPNA-207ENST00000575288 IQGAP1P46940 1657 aa41.26■■■■■ 4.2
PITPNA-207ENST00000575288 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.26■■■■■ 4.2
PITPNA-207ENST00000575288 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.25■■■■■ 4.19
PITPNA-207ENST00000575288 ADGRB3O60242 1522 aa41.24■■■■■ 4.19
PITPNA-207ENST00000575288 EID1Q9Y6B2 187 aa41.21■■■■■ 4.19
PITPNA-207ENST00000575288 TRIM52Q96A61 297 aa41.13■■■■■ 4.17
PITPNA-207ENST00000575288 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.12■■■■■ 4.17
PITPNA-207ENST00000575288 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.11■■■■■ 4.17
PITPNA-207ENST00000575288 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.11■■■■■ 4.17
PITPNA-207ENST00000575288 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
PITPNA-207ENST00000575288 CPS1P31327 1500 aa41.06■■■■■ 4.16
PITPNA-207ENST00000575288 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.05■■■■■ 4.16
PITPNA-207ENST00000575288 ZFYVE9O95405 1425 aa41.01■■■■■ 4.16
PITPNA-207ENST00000575288 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41■■■■■ 4.15
PITPNA-207ENST00000575288 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.98■■■■■ 4.15
PITPNA-207ENST00000575288 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
PITPNA-207ENST00000575288 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
PITPNA-207ENST00000575288 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms