RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574236.5

PHF23-208, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-208ENST00000574236 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
PHF23-208ENST00000574236 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
PHF23-208ENST00000574236 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
PHF23-208ENST00000574236 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.36■■■■□ 3.41
PHF23-208ENST00000574236 NCOA1Q15788 1441 aa36.35■■■■□ 3.41
PHF23-208ENST00000574236 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.35■■■■□ 3.41
PHF23-208ENST00000574236 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
PHF23-208ENST00000574236 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
PHF23-208ENST00000574236 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.34■■■■□ 3.41
PHF23-208ENST00000574236 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.32■■■■□ 3.41
PHF23-208ENST00000574236 DAPK1P53355 1430 aa36.32■■■■□ 3.4
PHF23-208ENST00000574236 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
PHF23-208ENST00000574236 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.31■■■■□ 3.4
PHF23-208ENST00000574236 FBXO41Q8TF61 875 aa36.3■■■■□ 3.4
PHF23-208ENST00000574236 PZPP20742 1482 aa36.3■■■■□ 3.4
PHF23-208ENST00000574236 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.29■■■■□ 3.4
PHF23-208ENST00000574236 PTPRTO14522 1441 aa36.26■■■■□ 3.4
PHF23-208ENST00000574236 ABCC3O15438 1527 aa36.26■■■■□ 3.4
PHF23-208ENST00000574236 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.26■■■■□ 3.4
PHF23-208ENST00000574236 CEP152O94986 1710 aa36.25■■■■□ 3.39
PHF23-208ENST00000574236 KIF15Q9NS87 1388 aa36.25■■■■□ 3.39
PHF23-208ENST00000574236 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
PHF23-208ENST00000574236 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.22■■■■□ 3.39
PHF23-208ENST00000574236 TNRQ92752 1358 aa36.22■■■■□ 3.39
PHF23-208ENST00000574236 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.21■■■■□ 3.39
PHF23-208ENST00000574236 CERKQ8TCT0 537 aa36.21■■■■□ 3.39
PHF23-208ENST00000574236 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.21■■■■□ 3.39
PHF23-208ENST00000574236 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
PHF23-208ENST00000574236 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.17■■■■□ 3.38
PHF23-208ENST00000574236 PLA2R1Q13018 1463 aa36.17■■■■□ 3.38
PHF23-208ENST00000574236 ERBINQ96RT1 1412 aa36.15■■■■□ 3.38
PHF23-208ENST00000574236 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
PHF23-208ENST00000574236 DEPDC5O75140 1603 aa36.12■■■■□ 3.37
PHF23-208ENST00000574236 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
PHF23-208ENST00000574236 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.1■■■■□ 3.37
PHF23-208ENST00000574236 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.09■■■■□ 3.37
PHF23-208ENST00000574236 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.08■■■■□ 3.37
PHF23-208ENST00000574236 ERVK-7P63135 1459 aa36.06■■■■□ 3.36
PHF23-208ENST00000574236 ADGRL2O95490 1459 aa36.05■■■■□ 3.36
PHF23-208ENST00000574236 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
PHF23-208ENST00000574236 PKD2Q13563 968 aa36.04■■■■□ 3.36
PHF23-208ENST00000574236 NLRP1Q9C000 1473 aa36.03■■■■□ 3.36
PHF23-208ENST00000574236 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
PHF23-208ENST00000574236 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.01■■■■□ 3.35
PHF23-208ENST00000574236 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36■■■■□ 3.35
PHF23-208ENST00000574236 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.99■■■■□ 3.35
PHF23-208ENST00000574236 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.96■■■■□ 3.35
PHF23-208ENST00000574236 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.96■■■■□ 3.35
PHF23-208ENST00000574236 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
PHF23-208ENST00000574236 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.94■■■■□ 3.34
PHF23-208ENST00000574236 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.9■■■■□ 3.34
PHF23-208ENST00000574236 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.89■■■■□ 3.34
PHF23-208ENST00000574236 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
PHF23-208ENST00000574236 KANK1Q14678 1352 aa35.87■■■■□ 3.33
PHF23-208ENST00000574236 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.85■■■■□ 3.33
PHF23-208ENST00000574236 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.82■■■■□ 3.32
PHF23-208ENST00000574236 PIK3C2BO00750 1634 aa35.8■■■■□ 3.32
PHF23-208ENST00000574236 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.8■■■■□ 3.32
PHF23-208ENST00000574236 MED14O60244 1454 aa35.79■■■■□ 3.32
PHF23-208ENST00000574236 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.79■■■■□ 3.32
PHF23-208ENST00000574236 SYNMO15061 1565 aa35.77■■■■□ 3.32
PHF23-208ENST00000574236 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
PHF23-208ENST00000574236 IQGAP1P46940 1657 aa35.77■■■■□ 3.32
PHF23-208ENST00000574236 UNC13BO14795 1591 aa35.74■■■■□ 3.31
PHF23-208ENST00000574236 ROCK1Q13464 1354 aa35.74■■■■□ 3.31
PHF23-208ENST00000574236 ITGAEP38570 1179 aa35.73■■■■□ 3.31
PHF23-208ENST00000574236 TET3O43151 1660 aa35.7■■■■□ 3.31
PHF23-208ENST00000574236 NOS1P29475 1434 aa35.7■■■■□ 3.31
PHF23-208ENST00000574236 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.7■■■■□ 3.31
PHF23-208ENST00000574236 SLIT1O75093 1534 aa35.68■■■■□ 3.3
PHF23-208ENST00000574236 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.66■■■■□ 3.3
PHF23-208ENST00000574236 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.66■■■■□ 3.3
PHF23-208ENST00000574236 LTKP29376 864 aa35.65■■■■□ 3.3
PHF23-208ENST00000574236 IDI1Q13907 227 aa35.65■■■■□ 3.3
PHF23-208ENST00000574236 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
PHF23-208ENST00000574236 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
PHF23-208ENST00000574236 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PHF23-208ENST00000574236 CPS1P31327 1500 aa35.61■■■■□ 3.29
PHF23-208ENST00000574236 E9PCH4 1651 aa35.6■■■■□ 3.29
PHF23-208ENST00000574236 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.59■■■■□ 3.29
PHF23-208ENST00000574236 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
PHF23-208ENST00000574236 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.58■■■■□ 3.29
PHF23-208ENST00000574236 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.58■■■■□ 3.29
PHF23-208ENST00000574236 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.57■■■■□ 3.28
PHF23-208ENST00000574236 ADGRB3O60242 1522 aa35.56■■■■□ 3.28
PHF23-208ENST00000574236 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.54■■■■□ 3.28
PHF23-208ENST00000574236 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.53■■■■□ 3.28
PHF23-208ENST00000574236 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.48■■■■□ 3.27
PHF23-208ENST00000574236 EID1Q9Y6B2 187 aa35.47■■■■□ 3.27
PHF23-208ENST00000574236 NUP155O75694 1391 aa35.47■■■■□ 3.27
PHF23-208ENST00000574236 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.45■■■■□ 3.27
PHF23-208ENST00000574236 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.43■■■■□ 3.26
PHF23-208ENST00000574236 ALKQ9UM73 1620 aa35.42■■■■□ 3.26
PHF23-208ENST00000574236 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
PHF23-208ENST00000574236 NAIPQ13075 1403 aa35.38■■■■□ 3.25
PHF23-208ENST00000574236 ZFYVE9O95405 1425 aa35.36■■■■□ 3.25
PHF23-208ENST00000574236 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.32■■■■□ 3.24
PHF23-208ENST00000574236 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.31■■■■□ 3.24
PHF23-208ENST00000574236 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PHF23-208ENST00000574236 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.31■■■■□ 3.24
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