RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574157.5

NOMO3-211, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 3

Gene NOMO3, Length 821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-211ENST00000574157 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.39□□□□□ -0.27
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NOMO3-211ENST00000574157 RNF39Q9H2S5 420 aa13.07□□□□□ -0.32
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NOMO3-211ENST00000574157 KIF1BO60333 1816 aa12.96□□□□□ -0.33
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