RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571287.1

HOXB2-203, Transcript of homeobox B2, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB2, Length 625 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2-203ENST00000571287 PTPRMP28827 1452 aa36.67■■■■□ 3.46
HOXB2-203ENST00000571287 DEPDC5O75140 1603 aa36.66■■■■□ 3.46
HOXB2-203ENST00000571287 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.66■■■■□ 3.46
HOXB2-203ENST00000571287 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.65■■■■□ 3.46
HOXB2-203ENST00000571287 MROH2AA6NES4 1674 aa36.64■■■■□ 3.46
HOXB2-203ENST00000571287 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
HOXB2-203ENST00000571287 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.62■■■■□ 3.45
HOXB2-203ENST00000571287 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.62■■■■□ 3.45
HOXB2-203ENST00000571287 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXB2-203ENST00000571287 C3P01024 1663 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXB2-203ENST00000571287 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
HOXB2-203ENST00000571287 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.59■■■■□ 3.45
HOXB2-203ENST00000571287 CEP152O94986 1710 aa36.58■■■■□ 3.45
HOXB2-203ENST00000571287 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
HOXB2-203ENST00000571287 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
HOXB2-203ENST00000571287 NAIPQ13075 1403 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXB2-203ENST00000571287 HFM1A2PYH4 1435 aa36.53■■■■□ 3.44
HOXB2-203ENST00000571287 UNC13BO14795 1591 aa36.52■■■■□ 3.44
HOXB2-203ENST00000571287 ABCC3O15438 1527 aa36.51■■■■□ 3.44
HOXB2-203ENST00000571287 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.51■■■■□ 3.43
HOXB2-203ENST00000571287 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.49■■■■□ 3.43
HOXB2-203ENST00000571287 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
HOXB2-203ENST00000571287 ZMYM3Q14202 1370 aa36.48■■■■□ 3.43
HOXB2-203ENST00000571287 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXB2-203ENST00000571287 KANK1Q14678 1352 aa36.46■■■■□ 3.43
HOXB2-203ENST00000571287 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
HOXB2-203ENST00000571287 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.45■■■■□ 3.43
HOXB2-203ENST00000571287 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
HOXB2-203ENST00000571287 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
HOXB2-203ENST00000571287 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXB2-203ENST00000571287 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.37■■■■□ 3.41
HOXB2-203ENST00000571287 PZPP20742 1482 aa36.35■■■■□ 3.41
HOXB2-203ENST00000571287 TET3O43151 1660 aa36.32■■■■□ 3.41
HOXB2-203ENST00000571287 NUP155O75694 1391 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB2-203ENST00000571287 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB2-203ENST00000571287 NPATQ14207 1427 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB2-203ENST00000571287 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB2-203ENST00000571287 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXB2-203ENST00000571287 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.27■■■■□ 3.4
HOXB2-203ENST00000571287 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
HOXB2-203ENST00000571287 E9PCH4 1651 aa36.21■■■■□ 3.39
HOXB2-203ENST00000571287 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.2■■■■□ 3.39
HOXB2-203ENST00000571287 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
HOXB2-203ENST00000571287 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXB2-203ENST00000571287 ERVK-7P63135 1459 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXB2-203ENST00000571287 TRIM52Q96A61 297 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXB2-203ENST00000571287 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXB2-203ENST00000571287 TNRQ92752 1358 aa36.15■■■■□ 3.38
HOXB2-203ENST00000571287 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
HOXB2-203ENST00000571287 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.15■■■■□ 3.38
HOXB2-203ENST00000571287 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.15■■■■□ 3.38
HOXB2-203ENST00000571287 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
HOXB2-203ENST00000571287 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
HOXB2-203ENST00000571287 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
HOXB2-203ENST00000571287 NOS1P29475 1434 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXB2-203ENST00000571287 SYNMO15061 1565 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXB2-203ENST00000571287 NLRP1Q9C000 1473 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXB2-203ENST00000571287 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXB2-203ENST00000571287 HRCP23327 699 aa36.02■■■■□ 3.36
HOXB2-203ENST00000571287 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
HOXB2-203ENST00000571287 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.01■■■■□ 3.36
HOXB2-203ENST00000571287 PKD2Q13563 968 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXB2-203ENST00000571287 HSPA2P54652 639 aa35.95■■■■□ 3.35
HOXB2-203ENST00000571287 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.95■■■■□ 3.35
HOXB2-203ENST00000571287 PIK3C2BO00750 1634 aa35.94■■■■□ 3.34
HOXB2-203ENST00000571287 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB2-203ENST00000571287 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXB2-203ENST00000571287 PTPRTO14522 1441 aa35.9■■■■□ 3.34
HOXB2-203ENST00000571287 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.88■■■■□ 3.33
HOXB2-203ENST00000571287 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
HOXB2-203ENST00000571287 IDI1Q13907 227 aa35.87■■■■□ 3.33
HOXB2-203ENST00000571287 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.87■■■■□ 3.33
HOXB2-203ENST00000571287 TRPM2O94759 1503 aa35.86■■■■□ 3.33
HOXB2-203ENST00000571287 FOXD1Q16676 465 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB2-203ENST00000571287 STRCQ7RTU9 1775 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB2-203ENST00000571287 ADGRB3O60242 1522 aa35.82■■■■□ 3.32
HOXB2-203ENST00000571287 PLA2R1Q13018 1463 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXB2-203ENST00000571287 CLTCL1P53675 1640 aa35.8■■■■□ 3.32
HOXB2-203ENST00000571287 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
HOXB2-203ENST00000571287 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXB2-203ENST00000571287 KIF1BO60333 1816 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXB2-203ENST00000571287 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXB2-203ENST00000571287 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
HOXB2-203ENST00000571287 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.73■■■■□ 3.31
HOXB2-203ENST00000571287 SLIT1O75093 1534 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXB2-203ENST00000571287 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
HOXB2-203ENST00000571287 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXB2-203ENST00000571287 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXB2-203ENST00000571287 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXB2-203ENST00000571287 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXB2-203ENST00000571287 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXB2-203ENST00000571287 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.61■■■■□ 3.29
HOXB2-203ENST00000571287 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXB2-203ENST00000571287 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
HOXB2-203ENST00000571287 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.54■■■■□ 3.28
HOXB2-203ENST00000571287 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.54■■■■□ 3.28
HOXB2-203ENST00000571287 EID1Q9Y6B2 187 aa35.54■■■■□ 3.28
HOXB2-203ENST00000571287 ZFYVE9O95405 1425 aa35.54■■■■□ 3.28
HOXB2-203ENST00000571287 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.54■■■■□ 3.28
HOXB2-203ENST00000571287 IQGAP1P46940 1657 aa35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 179.5 ms