RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
ITGAE-202ENST00000570360 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.53■■□□□ 1.68
ITGAE-202ENST00000570360 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.53■■□□□ 1.68
ITGAE-202ENST00000570360 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.53■■□□□ 1.68
ITGAE-202ENST00000570360 CEP152O94986 1710 aa25.52■■□□□ 1.68
ITGAE-202ENST00000570360 KIF3BO15066 747 aa25.52■■□□□ 1.68
ITGAE-202ENST00000570360 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ITGAE-202ENST00000570360 HRCP23327 699 aa25.48■■□□□ 1.67
ITGAE-202ENST00000570360 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.46■■□□□ 1.67
ITGAE-202ENST00000570360 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.45■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 PZPP20742 1482 aa25.45■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 TET3O43151 1660 aa25.44■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 ABCC3O15438 1527 aa25.43■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.43■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.42■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.42■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 GGT6Q6P531 493 aa25.4■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 NUP155O75694 1391 aa25.4■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 MADDQ8WXG6 1647 aa25.39■■□□□ 1.66
ITGAE-202ENST00000570360 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.663e-7■■□□□ 13.1
ITGAE-202ENST00000570360 MROH2AA6NES4 1674 aa25.39■■□□□ 1.65
ITGAE-202ENST00000570360 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ITGAE-202ENST00000570360 E9PCH4 1651 aa25.38■■□□□ 1.65
ITGAE-202ENST00000570360 KANK1Q14678 1352 aa25.37■■□□□ 1.65
ITGAE-202ENST00000570360 MLECQ14165 292 aa25.37■■□□□ 1.65
ITGAE-202ENST00000570360 TRIM52Q96A61 297 aa25.37■■□□□ 1.65
ITGAE-202ENST00000570360 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.37■■□□□ 1.65
ITGAE-202ENST00000570360 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
ITGAE-202ENST00000570360 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.32■■□□□ 1.64
ITGAE-202ENST00000570360 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ITGAE-202ENST00000570360 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ITGAE-202ENST00000570360 C3P01024 1663 aa25.29■■□□□ 1.64
ITGAE-202ENST00000570360 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.29■■□□□ 1.64
ITGAE-202ENST00000570360 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.28■■□□□ 1.64
ITGAE-202ENST00000570360 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.27■■□□□ 1.64
ITGAE-202ENST00000570360 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.26■■□□□ 1.63
ITGAE-202ENST00000570360 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.26■■□□□ 1.63
ITGAE-202ENST00000570360 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ITGAE-202ENST00000570360 NPATQ14207 1427 aa25.25■■□□□ 1.63
ITGAE-202ENST00000570360 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.25■■□□□ 1.63
ITGAE-202ENST00000570360 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ITGAE-202ENST00000570360 PKD2Q13563 968 aa25.2■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 ZMYM3Q14202 1370 aa25.18■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.18■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 SYNMO15061 1565 aa25.17■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 FOXD1Q16676 465 aa25.16■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 TRPM2O94759 1503 aa25.16■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 ERVK-7P63135 1459 aa25.15■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 PLA2R1Q13018 1463 aa25.15■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 PTPRTO14522 1441 aa25.14■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 NOS1P29475 1434 aa25.14■■□□□ 1.62
ITGAE-202ENST00000570360 PTPRMP28827 1452 aa25.13■■□□□ 1.61
ITGAE-202ENST00000570360 PIK3C2BO00750 1634 aa25.12■■□□□ 1.61
ITGAE-202ENST00000570360 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.11■■□□□ 1.61
ITGAE-202ENST00000570360 CLTCL1P53675 1640 aa25.11■■□□□ 1.61
ITGAE-202ENST00000570360 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.1■■□□□ 1.61
ITGAE-202ENST00000570360 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.09■■□□□ 1.61
ITGAE-202ENST00000570360 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
ITGAE-202ENST00000570360 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
ITGAE-202ENST00000570360 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
ITGAE-202ENST00000570360 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.05■■□□□ 1.6
ITGAE-202ENST00000570360 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ITGAE-202ENST00000570360 KIF1BO60333 1816 aa25.04■■□□□ 1.6
ITGAE-202ENST00000570360 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.03■■□□□ 1.6
ITGAE-202ENST00000570360 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ITGAE-202ENST00000570360 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.01■■□□□ 1.59
ITGAE-202ENST00000570360 TNRQ92752 1358 aa25.01■■□□□ 1.59
ITGAE-202ENST00000570360 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.99■■□□□ 1.59
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ITGAE-202ENST00000570360 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ITGAE-202ENST00000570360 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.97■■□□□ 1.59
ITGAE-202ENST00000570360 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.96■■□□□ 1.59
ITGAE-202ENST00000570360 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.96■■□□□ 1.59
ITGAE-202ENST00000570360 ADGRB3O60242 1522 aa24.96■■□□□ 1.59
ITGAE-202ENST00000570360 NLRP1Q9C000 1473 aa24.95■■□□□ 1.58
ITGAE-202ENST00000570360 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.94■■□□□ 1.58
ITGAE-202ENST00000570360 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.93■■□□□ 1.58
ITGAE-202ENST00000570360 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ITGAE-202ENST00000570360 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.91■■□□□ 1.58
ITGAE-202ENST00000570360 IFT172Q9UG01 1749 aa24.9■■□□□ 1.58
ITGAE-202ENST00000570360 IDI1Q13907 227 aa24.9■■□□□ 1.58
ITGAE-202ENST00000570360 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.9■■□□□ 1.58
ITGAE-202ENST00000570360 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.88■■□□□ 1.57
ITGAE-202ENST00000570360 PPLO60437 1756 aa24.86■■□□□ 1.57
ITGAE-202ENST00000570360 NEUROD1Q13562 356 aa24.83■■□□□ 1.57
ITGAE-202ENST00000570360 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.82■■□□□ 1.56
ITGAE-202ENST00000570360 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.81■■□□□ 1.56
ITGAE-202ENST00000570360 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.77■■□□□ 1.56
ITGAE-202ENST00000570360 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
ITGAE-202ENST00000570360 SLIT1O75093 1534 aa24.76■■□□□ 1.55
ITGAE-202ENST00000570360 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.75■■□□□ 1.55
ITGAE-202ENST00000570360 ZFYVE9O95405 1425 aa24.73■■□□□ 1.55
ITGAE-202ENST00000570360 TONSLQ96HA7 1378 aa24.73■■□□□ 1.55
ITGAE-202ENST00000570360 RGL3Q3MIN7 710 aa24.72■■□□□ 1.55
ITGAE-202ENST00000570360 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.72■■□□□ 1.55
ITGAE-202ENST00000570360 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ITGAE-202ENST00000570360 MYOM2P54296 1465 aa24.7■■□□□ 1.55
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