RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570125.5

CARHSP1-215, Transcript of calcium regulated heat stable protein 1, human

TSL 4

Gene CARHSP1, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CARHSP1-215	ENST00000570125	HSPA2	P54652	639 aa		43.77	■■■■■ 4.6
CARHSP1-215	ENST00000570125	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	43.76	■■■■■ 4.6
CARHSP1-215	ENST00000570125	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		43.74	■■■■■ 4.59
CARHSP1-215	ENST00000570125	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		43.74	■■■■■ 4.59
CARHSP1-215	ENST00000570125	NPAT	Q14207	1427 aa		43.73	■■■■■ 4.59
CARHSP1-215	ENST00000570125	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		43.73	■■■■■ 4.59
CARHSP1-215	ENST00000570125	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		43.73	■■■■■ 4.59
CARHSP1-215	ENST00000570125	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		43.72	■■■■■ 4.59
CARHSP1-215	ENST00000570125	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		43.67	■■■■■ 4.58
CARHSP1-215	ENST00000570125	PTPRK	Q15262	1439 aa		43.67	■■■■■ 4.58
CARHSP1-215	ENST00000570125	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		43.66	■■■■■ 4.58
CARHSP1-215	ENST00000570125	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.66	■■■■■ 4.58
CARHSP1-215	ENST00000570125	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		43.65	■■■■■ 4.58
CARHSP1-215	ENST00000570125	NCOA1	Q15788	1441 aa		43.65	■■■■■ 4.58
CARHSP1-215	ENST00000570125	ADGRL2	O95490	1459 aa		43.64	■■■■■ 4.58
CARHSP1-215	ENST00000570125	ABCC3	O15438	1527 aa		43.57	■■■■■ 4.56
CARHSP1-215	ENST00000570125	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	43.56	■■■■■ 4.56
CARHSP1-215	ENST00000570125	PZP	P20742	1482 aa		43.55	■■■■■ 4.56
CARHSP1-215	ENST00000570125	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		43.52	■■■■■ 4.56
CARHSP1-215	ENST00000570125	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	43.52	■■■■■ 4.56
CARHSP1-215	ENST00000570125	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	43.51	■■■■■ 4.56
CARHSP1-215	ENST00000570125	DEPDC5	O75140	1603 aa		43.49	■■■■■ 4.55
CARHSP1-215	ENST00000570125	CEP152	O94986	1710 aa		43.48	■■■■■ 4.55
CARHSP1-215	ENST00000570125	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	43.48	■■■■■ 4.55
CARHSP1-215	ENST00000570125	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	43.46	■■■■■ 4.55
CARHSP1-215	ENST00000570125	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.42	■■■■■ 4.54
CARHSP1-215	ENST00000570125	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	43.41	■■■■■ 4.54
CARHSP1-215	ENST00000570125	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		43.41	■■■■■ 4.54
CARHSP1-215	ENST00000570125	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43.41	■■■■■ 4.54
CARHSP1-215	ENST00000570125	TNR	Q92752	1358 aa		43.41	■■■■■ 4.54
CARHSP1-215	ENST00000570125	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	43.39	■■■■■ 4.54
CARHSP1-215	ENST00000570125	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		43.39	■■■■■ 4.54
CARHSP1-215	ENST00000570125	ROCK1	Q13464	1354 aa		43.38	■■■■■ 4.53
CARHSP1-215	ENST00000570125	ITGAE	P38570	1179 aa		43.36	■■■■■ 4.53
CARHSP1-215	ENST00000570125	KANK1	Q14678	1352 aa		43.33	■■■■■ 4.53
CARHSP1-215	ENST00000570125	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		43.33	■■■■■ 4.53
CARHSP1-215	ENST00000570125	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		43.32	■■■■■ 4.53
CARHSP1-215	ENST00000570125	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		43.3	■■■■■ 4.52
CARHSP1-215	ENST00000570125	ERVK-7	P63135	1459 aa		43.29	■■■■■ 4.52
CARHSP1-215	ENST00000570125	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		43.28	■■■■■ 4.52
CARHSP1-215	ENST00000570125	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		43.27	■■■■■ 4.52
CARHSP1-215	ENST00000570125	NLRP1	Q9C000	1473 aa		43.24	■■■■■ 4.51
CARHSP1-215	ENST00000570125	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	43.23	■■■■■ 4.51
CARHSP1-215	ENST00000570125	PLA2R1	Q13018	1463 aa		43.21	■■■■■ 4.51
CARHSP1-215	ENST00000570125	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		43.21	■■■■■ 4.51
CARHSP1-215	ENST00000570125	UNC13B	O14795	1591 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CARHSP1-215	ENST00000570125	PTPRT	O14522	1441 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CARHSP1-215	ENST00000570125	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		43.13	■■■■■ 4.5
CARHSP1-215	ENST00000570125	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		43.13	■■■■■ 4.49
CARHSP1-215	ENST00000570125	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		43.12	■■■■■ 4.49
CARHSP1-215	ENST00000570125	PKD2	Q13563	968 aa		43.07	■■■■■ 4.49
CARHSP1-215	ENST00000570125	TET3	O43151	1660 aa		43.04	■■■■■ 4.48
CARHSP1-215	ENST00000570125	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
CARHSP1-215	ENST00000570125	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.99	■■■■■ 4.47
CARHSP1-215	ENST00000570125	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.98	■■■■■ 4.47
CARHSP1-215	ENST00000570125	NOS1	P29475	1434 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CARHSP1-215	ENST00000570125	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
CARHSP1-215	ENST00000570125	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CARHSP1-215	ENST00000570125	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
CARHSP1-215	ENST00000570125	NAIP	Q13075	1403 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CARHSP1-215	ENST00000570125	SYNM	O15061	1565 aa		42.96	■■■■■ 4.47
CARHSP1-215	ENST00000570125	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CARHSP1-215	ENST00000570125	NUP155	O75694	1391 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CARHSP1-215	ENST00000570125	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.91	■■■■■ 4.46
CARHSP1-215	ENST00000570125	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.89	■■■■■ 4.46
CARHSP1-215	ENST00000570125	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
CARHSP1-215	ENST00000570125	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.88	■■■■■ 4.45
CARHSP1-215	ENST00000570125		E9PCH4	1651 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CARHSP1-215	ENST00000570125	IDI1	Q13907	227 aa		42.85	■■■■■ 4.45
CARHSP1-215	ENST00000570125	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CARHSP1-215	ENST00000570125	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CARHSP1-215	ENST00000570125	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
CARHSP1-215	ENST00000570125	MED14	O60244	1454 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CARHSP1-215	ENST00000570125	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.79	■■■■■ 4.44
CARHSP1-215	ENST00000570125	SLIT1	O75093	1534 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CARHSP1-215	ENST00000570125	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CARHSP1-215	ENST00000570125	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CARHSP1-215	ENST00000570125	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
CARHSP1-215	ENST00000570125	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
CARHSP1-215	ENST00000570125	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CARHSP1-215	ENST00000570125	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CARHSP1-215	ENST00000570125	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CARHSP1-215	ENST00000570125	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
CARHSP1-215	ENST00000570125	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CARHSP1-215	ENST00000570125	LTK	P29376	864 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CARHSP1-215	ENST00000570125	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CARHSP1-215	ENST00000570125	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CARHSP1-215	ENST00000570125	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CARHSP1-215	ENST00000570125	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CARHSP1-215	ENST00000570125	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CARHSP1-215	ENST00000570125	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CARHSP1-215	ENST00000570125	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CARHSP1-215	ENST00000570125	ZFYVE9	O95405	1425 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CARHSP1-215	ENST00000570125	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
CARHSP1-215	ENST00000570125	CPS1	P31327	1500 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CARHSP1-215	ENST00000570125	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CARHSP1-215	ENST00000570125	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
CARHSP1-215	ENST00000570125	TRPM2	O94759	1503 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CARHSP1-215	ENST00000570125	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.4	■■■■■ 4.38
CARHSP1-215	ENST00000570125	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.4	■■■■■ 4.38

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