RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 AGLP35573 1532 aa27.82■■■□□ 2.04
SPNS1-210ENST00000568388 MADDQ8WXG6 1647 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-210ENST00000568388 UNC13BO14795 1591 aa27.8■■■□□ 2.04
SPNS1-210ENST00000568388 DEPDC5O75140 1603 aa27.79■■■□□ 2.04
SPNS1-210ENST00000568388 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SPNS1-210ENST00000568388 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
SPNS1-210ENST00000568388 PTPRMP28827 1452 aa27.76■■■□□ 2.04
SPNS1-210ENST00000568388 KIF3BO15066 747 aa27.76■■■□□ 2.03
SPNS1-210ENST00000568388 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.75■■■□□ 2.03
SPNS1-210ENST00000568388 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM52Q96A61 297 aa27.72■■■□□ 2.03
SPNS1-210ENST00000568388 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.71■■■□□ 2.03
SPNS1-210ENST00000568388 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.69■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 NUP155O75694 1391 aa27.69■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.69■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 PZPP20742 1482 aa27.66■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 KANK1Q14678 1352 aa27.64■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.64■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.64■■■□□ 2.02
SPNS1-210ENST00000568388 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.63■■■□□ 2.01
SPNS1-210ENST00000568388 GGT6Q6P531 493 aa27.62■■■□□ 2.01
SPNS1-210ENST00000568388 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.62■■■□□ 2.01
SPNS1-210ENST00000568388 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.6■■■□□ 2.01
SPNS1-210ENST00000568388 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
SPNS1-210ENST00000568388 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
SPNS1-210ENST00000568388 TET3O43151 1660 aa27.57■■■□□ 2
SPNS1-210ENST00000568388 CEP152O94986 1710 aa27.56■■■□□ 2
SPNS1-210ENST00000568388 MLECQ14165 292 aa27.55■■■□□ 2
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC3O15438 1527 aa27.54■■■□□ 2
SPNS1-210ENST00000568388 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.53■■■□□ 2
SPNS1-210ENST00000568388 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.51■■□□□ 1.99
SPNS1-210ENST00000568388 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SPNS1-210ENST00000568388 PKD2Q13563 968 aa27.5■■□□□ 1.99
SPNS1-210ENST00000568388 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.5■■□□□ 1.99
SPNS1-210ENST00000568388 E9PCH4 1651 aa27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-210ENST00000568388 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-210ENST00000568388 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.48■■□□□ 1.99
SPNS1-210ENST00000568388 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.46■■□□□ 1.99
SPNS1-210ENST00000568388 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.44■■□□□ 1.98
SPNS1-210ENST00000568388 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SPNS1-210ENST00000568388 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.43■■□□□ 1.98
SPNS1-210ENST00000568388 MROH2AA6NES4 1674 aa27.43■■□□□ 1.98
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.41■■□□□ 1.98
SPNS1-210ENST00000568388 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SPNS1-210ENST00000568388 FOXD1Q16676 465 aa27.4■■□□□ 1.98
SPNS1-210ENST00000568388 NPATQ14207 1427 aa27.39■■□□□ 1.97
SPNS1-210ENST00000568388 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
SPNS1-210ENST00000568388 PTPRTO14522 1441 aa27.37■■□□□ 1.97
SPNS1-210ENST00000568388 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.36■■□□□ 1.97
SPNS1-210ENST00000568388 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.35■■□□□ 1.97
SPNS1-210ENST00000568388 ZMYM3Q14202 1370 aa27.35■■□□□ 1.97
SPNS1-210ENST00000568388 C3P01024 1663 aa27.34■■□□□ 1.97
SPNS1-210ENST00000568388 PLA2R1Q13018 1463 aa27.33■■□□□ 1.97
SPNS1-210ENST00000568388 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SPNS1-210ENST00000568388 NOS1P29475 1434 aa27.31■■□□□ 1.96
SPNS1-210ENST00000568388 TRPM2O94759 1503 aa27.3■■□□□ 1.96
SPNS1-210ENST00000568388 HSPA2P54652 639 aa27.27■■□□□ 1.96
SPNS1-210ENST00000568388 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.26■■□□□ 1.95
SPNS1-210ENST00000568388 ERVK-7P63135 1459 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS1-210ENST00000568388 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.23■■□□□ 1.95
SPNS1-210ENST00000568388 SYNMO15061 1565 aa27.22■■□□□ 1.95
SPNS1-210ENST00000568388 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SPNS1-210ENST00000568388 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SPNS1-210ENST00000568388 PIK3C2BO00750 1634 aa27.2■■□□□ 1.95
SPNS1-210ENST00000568388 CLTCL1P53675 1640 aa27.2■■□□□ 1.95
SPNS1-210ENST00000568388 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
SPNS1-210ENST00000568388 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.18■■□□□ 1.94
SPNS1-210ENST00000568388 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.18■■□□□ 1.94
SPNS1-210ENST00000568388 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.17■■□□□ 1.94
SPNS1-210ENST00000568388 NEUROD1Q13562 356 aa27.17■■□□□ 1.94
SPNS1-210ENST00000568388 KIF1BO60333 1816 aa27.17■■□□□ 1.94
SPNS1-210ENST00000568388 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.14■■□□□ 1.94
SPNS1-210ENST00000568388 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SPNS1-210ENST00000568388 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.14■■□□□ 1.93
SPNS1-210ENST00000568388 TNRQ92752 1358 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-210ENST00000568388 STRCQ7RTU9 1775 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-210ENST00000568388 IDI1Q13907 227 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-210ENST00000568388 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-210ENST00000568388 TONSLQ96HA7 1378 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-210ENST00000568388 NLRP1Q9C000 1473 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS1-210ENST00000568388 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-210ENST00000568388 ADGRB3O60242 1522 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS1-210ENST00000568388 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.03■■□□□ 1.92
SPNS1-210ENST00000568388 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-210ENST00000568388 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-210ENST00000568388 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-210ENST00000568388 RGL3Q3MIN7 710 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-210ENST00000568388 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-210ENST00000568388 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-210ENST00000568388 STAC3Q96MF2 364 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-210ENST00000568388 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.95■■□□□ 1.91
SPNS1-210ENST00000568388 IFT172Q9UG01 1749 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS1-210ENST00000568388 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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