RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568252.1

MKRN3-203, Transcript of makorin ring finger protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MKRN3, Length 1,312 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3-203ENST00000568252 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.8■■□□□ 1.56
MKRN3-203ENST00000568252 KIF15Q9NS87 1388 aa24.8■■□□□ 1.56
MKRN3-203ENST00000568252 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.79■■□□□ 1.56
MKRN3-203ENST00000568252 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.79■■□□□ 1.56
MKRN3-203ENST00000568252 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.78■■□□□ 1.56
MKRN3-203ENST00000568252 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
MKRN3-203ENST00000568252 ZMYM3Q14202 1370 aa24.76■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.76■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 ADGRL2O95490 1459 aa24.75■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.75■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.74■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 NCOA1Q15788 1441 aa24.74■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.73■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 ERBINQ96RT1 1412 aa24.73■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 PTPRKQ15262 1439 aa24.72■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.71■■□□□ 1.55
MKRN3-203ENST00000568252 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.69■■□□□ 1.54
MKRN3-203ENST00000568252 NPATQ14207 1427 aa24.68■■□□□ 1.54
MKRN3-203ENST00000568252 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
MKRN3-203ENST00000568252 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.67■■□□□ 1.54
MKRN3-203ENST00000568252 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
MKRN3-203ENST00000568252 HSPA2P54652 639 aa24.65■■□□□ 1.54
MKRN3-203ENST00000568252 ABCC3O15438 1527 aa24.65■■□□□ 1.54
MKRN3-203ENST00000568252 DEPDC5O75140 1603 aa24.64■■□□□ 1.54
MKRN3-203ENST00000568252 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
MKRN3-203ENST00000568252 CEP152O94986 1710 aa24.63■■□□□ 1.53
MKRN3-203ENST00000568252 ITGAEP38570 1179 aa24.62■■□□□ 1.53
MKRN3-203ENST00000568252 PZPP20742 1482 aa24.62■■□□□ 1.53
MKRN3-203ENST00000568252 ROCK1Q13464 1354 aa24.61■■□□□ 1.53
MKRN3-203ENST00000568252 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.6■■□□□ 1.53
MKRN3-203ENST00000568252 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.59■■□□□ 1.53
MKRN3-203ENST00000568252 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.58■■□□□ 1.52
MKRN3-203ENST00000568252 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
MKRN3-203ENST00000568252 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
MKRN3-203ENST00000568252 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
MKRN3-203ENST00000568252 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.54■■□□□ 1.52
MKRN3-203ENST00000568252 KANK1Q14678 1352 aa24.53■■□□□ 1.52
MKRN3-203ENST00000568252 TNRQ92752 1358 aa24.52■■□□□ 1.52
MKRN3-203ENST00000568252 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
MKRN3-203ENST00000568252 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.5■■□□□ 1.51
MKRN3-203ENST00000568252 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.49■■□□□ 1.51
MKRN3-203ENST00000568252 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.49■■□□□ 1.51
MKRN3-203ENST00000568252 STRCQ7RTU9 1775 aa24.48■■□□□ 1.51
MKRN3-203ENST00000568252 ERVK-7P63135 1459 aa24.48■■□□□ 1.51
MKRN3-203ENST00000568252 UNC13BO14795 1591 aa24.48■■□□□ 1.51
MKRN3-203ENST00000568252 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
MKRN3-203ENST00000568252 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.46■■□□□ 1.51
MKRN3-203ENST00000568252 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.43■■□□□ 1.5
MKRN3-203ENST00000568252 ADRA2BP18089 450 aa24.42■■□□□ 1.5
MKRN3-203ENST00000568252 NLRP1Q9C000 1473 aa24.42■■□□□ 1.5
MKRN3-203ENST00000568252 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.41■■□□□ 1.5
MKRN3-203ENST00000568252 NAIPQ13075 1403 aa24.39■■□□□ 1.5
MKRN3-203ENST00000568252 TET3O43151 1660 aa24.39■■□□□ 1.5
MKRN3-203ENST00000568252 PLA2R1Q13018 1463 aa24.38■■□□□ 1.49
MKRN3-203ENST00000568252 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.38■■□□□ 1.49
MKRN3-203ENST00000568252 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.36■■□□□ 1.49
MKRN3-203ENST00000568252 HFM1A2PYH4 1435 aa24.35■■□□□ 1.49
MKRN3-203ENST00000568252 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.34■■□□□ 1.49
MKRN3-203ENST00000568252 NUP155O75694 1391 aa24.33■■□□□ 1.49
MKRN3-203ENST00000568252 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
MKRN3-203ENST00000568252 NOS1P29475 1434 aa24.32■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 SYNMO15061 1565 aa24.32■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.32■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 PTPRTO14522 1441 aa24.31■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 E9PCH4 1651 aa24.31■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.3■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 PKD2Q13563 968 aa24.29■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 PIK3C2BO00750 1634 aa24.28■■□□□ 1.48
MKRN3-203ENST00000568252 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.24■■□□□ 1.47
MKRN3-203ENST00000568252 IDI1Q13907 227 aa24.24■■□□□ 1.47
MKRN3-203ENST00000568252 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
MKRN3-203ENST00000568252 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.21■■□□□ 1.47
MKRN3-203ENST00000568252 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.2■■□□□ 1.46
MKRN3-203ENST00000568252 ADGRB3O60242 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
MKRN3-203ENST00000568252 SLIT1O75093 1534 aa24.18■■□□□ 1.46
MKRN3-203ENST00000568252 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.18■■□□□ 1.46
MKRN3-203ENST00000568252 TRIM52Q96A61 297 aa24.17■■□□□ 1.46
MKRN3-203ENST00000568252 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.17■■□□□ 1.46
MKRN3-203ENST00000568252 MED14O60244 1454 aa24.16■■□□□ 1.46
MKRN3-203ENST00000568252 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.15■■□□□ 1.46
MKRN3-203ENST00000568252 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.13■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 IQGAP1P46940 1657 aa24.13■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.13■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.11■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.11■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.11■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 LTKP29376 864 aa24.1■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.1■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 CERKQ8TCT0 537 aa24.09■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
MKRN3-203ENST00000568252 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
MKRN3-203ENST00000568252 EID1Q9Y6B2 187 aa24.08■■□□□ 1.44
MKRN3-203ENST00000568252 TRPM2O94759 1503 aa24.06■■□□□ 1.44
MKRN3-203ENST00000568252 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms