RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566199.1

JMJD8-208, Transcript of jumonji domain containing 8, human

TSL 3

Gene JMJD8, Length 719 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD8-208	ENST00000566199	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	40.83	■■■■■ 4.13
JMJD8-208	ENST00000566199	ABCC5	O15440	1437 aa		40.8	■■■■■ 4.12
JMJD8-208	ENST00000566199	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.78	■■■■■ 4.12
JMJD8-208	ENST00000566199	DAPK1	P53355	1430 aa		40.77	■■■■■ 4.12
JMJD8-208	ENST00000566199	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.76	■■■■■ 4.12
JMJD8-208	ENST00000566199	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.76	■■■■■ 4.12
JMJD8-208	ENST00000566199	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.76	■■■■■ 4.11
JMJD8-208	ENST00000566199	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
JMJD8-208	ENST00000566199	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
JMJD8-208	ENST00000566199	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.67	■■■■■ 4.1
JMJD8-208	ENST00000566199	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.65	■■■■■ 4.1
JMJD8-208	ENST00000566199	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		40.65	■■■■■ 4.1
JMJD8-208	ENST00000566199	PZP	P20742	1482 aa		40.64	■■■■■ 4.1
JMJD8-208	ENST00000566199	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.64	■■■■■ 4.1
JMJD8-208	ENST00000566199	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
JMJD8-208	ENST00000566199	CEP152	O94986	1710 aa		40.61	■■■■■ 4.09
JMJD8-208	ENST00000566199	ABCC3	O15438	1527 aa		40.6	■■■■■ 4.09
JMJD8-208	ENST00000566199	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.58	■■■■■ 4.09
JMJD8-208	ENST00000566199	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.08
JMJD8-208	ENST00000566199	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.56	■■■■■ 4.08
JMJD8-208	ENST00000566199	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.56	■■■■■ 4.08
JMJD8-208	ENST00000566199	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.55	■■■■■ 4.08
JMJD8-208	ENST00000566199	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.54	■■■■■ 4.08
JMJD8-208	ENST00000566199	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.54	■■■■■ 4.08
JMJD8-208	ENST00000566199	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.54	■■■■■ 4.08
JMJD8-208	ENST00000566199	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
JMJD8-208	ENST00000566199	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
JMJD8-208	ENST00000566199	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.5	■■■■■ 4.07
JMJD8-208	ENST00000566199	TNR	Q92752	1358 aa		40.49	■■■■■ 4.07
JMJD8-208	ENST00000566199	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.47	■■■■■ 4.07
JMJD8-208	ENST00000566199	PTPRT	O14522	1441 aa		40.47	■■■■■ 4.07
JMJD8-208	ENST00000566199	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.46	■■■■■ 4.07
JMJD8-208	ENST00000566199	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
JMJD8-208	ENST00000566199	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.42	■■■■■ 4.06
JMJD8-208	ENST00000566199	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.4	■■■■■ 4.06
JMJD8-208	ENST00000566199	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
JMJD8-208	ENST00000566199	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.35	■■■■■ 4.05
JMJD8-208	ENST00000566199	KANK1	Q14678	1352 aa		40.35	■■■■■ 4.05
JMJD8-208	ENST00000566199	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.33	■■■■■ 4.05
JMJD8-208	ENST00000566199	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.33	■■■■■ 4.05
JMJD8-208	ENST00000566199	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.31	■■■■■ 4.04
JMJD8-208	ENST00000566199	PKD2	Q13563	968 aa		40.3	■■■■■ 4.04
JMJD8-208	ENST00000566199	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.3	■■■■■ 4.04
JMJD8-208	ENST00000566199	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.28	■■■■■ 4.04
JMJD8-208	ENST00000566199	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
JMJD8-208	ENST00000566199	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.27	■■■■■ 4.04
JMJD8-208	ENST00000566199	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.27	■■■■■ 4.04
JMJD8-208	ENST00000566199	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.26	■■■■■ 4.04
JMJD8-208	ENST00000566199	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.24	■■■■■ 4.03
JMJD8-208	ENST00000566199	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.24	■■■■■ 4.03
JMJD8-208	ENST00000566199	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.21	■■■■■ 4.03
JMJD8-208	ENST00000566199	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.19	■■■■■ 4.02
JMJD8-208	ENST00000566199	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.18	■■■■■ 4.02
JMJD8-208	ENST00000566199	UNC13B	O14795	1591 aa		40.18	■■■■■ 4.02
JMJD8-208	ENST00000566199	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
JMJD8-208	ENST00000566199	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.15	■■■■■ 4.02
JMJD8-208	ENST00000566199	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.14	■■■■■ 4.02
JMJD8-208	ENST00000566199	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.14	■■■■■ 4.02
JMJD8-208	ENST00000566199	TET3	O43151	1660 aa		40.12	■■■■■ 4.01
JMJD8-208	ENST00000566199	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.11	■■■■■ 4.01
JMJD8-208	ENST00000566199	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.07	■■■■■ 4
JMJD8-208	ENST00000566199	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.05	■■■■■ 4
JMJD8-208	ENST00000566199	ITGAE	P38570	1179 aa		40.05	■■■■■ 4
JMJD8-208	ENST00000566199	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.05	■■■■■ 4
JMJD8-208	ENST00000566199	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.05	■■■■■ 4
JMJD8-208	ENST00000566199	SYNM	O15061	1565 aa		40.02	■■■■■ 4
JMJD8-208	ENST00000566199	MED14	O60244	1454 aa		40.02	■■■■■ 4
JMJD8-208	ENST00000566199	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.02	■■■■■ 4
JMJD8-208	ENST00000566199	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.02	■■■■■ 4
JMJD8-208	ENST00000566199	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40	■■■■□ 3.99
JMJD8-208	ENST00000566199	NOS1	P29475	1434 aa		39.99	■■■■□ 3.99
JMJD8-208	ENST00000566199	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	39.95	■■■■□ 3.99
JMJD8-208	ENST00000566199	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	39.95	■■■■□ 3.99
JMJD8-208	ENST00000566199	SLIT1	O75093	1534 aa		39.95	■■■■□ 3.99
JMJD8-208	ENST00000566199	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		39.93	■■■■□ 3.98
JMJD8-208	ENST00000566199		E9PCH4	1651 aa		39.92	■■■■□ 3.98
JMJD8-208	ENST00000566199	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	39.88	■■■■□ 3.98
JMJD8-208	ENST00000566199	ADGRB3	O60242	1522 aa		39.87	■■■■□ 3.97
JMJD8-208	ENST00000566199	IDI1	Q13907	227 aa		39.84	■■■■□ 3.97
JMJD8-208	ENST00000566199	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		39.84	■■■■□ 3.97
JMJD8-208	ENST00000566199	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		39.84	■■■■□ 3.97
JMJD8-208	ENST00000566199	CPS1	P31327	1500 aa		39.83	■■■■□ 3.97
JMJD8-208	ENST00000566199	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		39.83	■■■■□ 3.97
JMJD8-208	ENST00000566199	NUP155	O75694	1391 aa		39.82	■■■■□ 3.96
JMJD8-208	ENST00000566199	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		39.8	■■■■□ 3.96
JMJD8-208	ENST00000566199	NAIP	Q13075	1403 aa		39.76	■■■■□ 3.96
JMJD8-208	ENST00000566199	EID1	Q9Y6B2	187 aa		39.76	■■■■□ 3.96
JMJD8-208	ENST00000566199	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		39.74	■■■■□ 3.95
JMJD8-208	ENST00000566199	LTK	P29376	864 aa		39.72	■■■■□ 3.95
JMJD8-208	ENST00000566199	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		39.71	■■■■□ 3.95
JMJD8-208	ENST00000566199	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		39.71	■■■■□ 3.95
JMJD8-208	ENST00000566199	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		39.71	■■■■□ 3.95
JMJD8-208	ENST00000566199	HFM1	A2PYH4	1435 aa		39.7	■■■■□ 3.95
JMJD8-208	ENST00000566199	ZFYVE9	O95405	1425 aa		39.57	■■■■□ 3.92
JMJD8-208	ENST00000566199	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		39.52	■■■■□ 3.92
JMJD8-208	ENST00000566199	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		39.52	■■■■□ 3.92
JMJD8-208	ENST00000566199	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		39.5	■■■■□ 3.91
JMJD8-208	ENST00000566199	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	39.49	■■■■□ 3.91
JMJD8-208	ENST00000566199	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	39.47	■■■■□ 3.91
JMJD8-208	ENST00000566199	TRPM2	O94759	1503 aa		39.46	■■■■□ 3.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms