RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-208ENST00000566059 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-208ENST00000566059 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-208ENST00000566059 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-208ENST00000566059 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS1-208ENST00000566059 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SPNS1-208ENST00000566059 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-208ENST00000566059 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-208ENST00000566059 NAIPQ13075 1403 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS1-208ENST00000566059 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SPNS1-208ENST00000566059 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
SPNS1-208ENST00000566059 ZMYM3Q14202 1370 aa27.03■■□□□ 1.92
SPNS1-208ENST00000566059 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-208ENST00000566059 DEPDC5O75140 1603 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-208ENST00000566059 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-208ENST00000566059 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-208ENST00000566059 HFM1A2PYH4 1435 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS1-208ENST00000566059 MROH2AA6NES4 1674 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC3O15438 1527 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-208ENST00000566059 C3P01024 1663 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-208ENST00000566059 KANK1Q14678 1352 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-208ENST00000566059 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS1-208ENST00000566059 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS1-208ENST00000566059 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SPNS1-208ENST00000566059 UNC13BO14795 1591 aa26.91■■□□□ 1.9
SPNS1-208ENST00000566059 CEP152O94986 1710 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS1-208ENST00000566059 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS1-208ENST00000566059 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SPNS1-208ENST00000566059 PZPP20742 1482 aa26.87■■□□□ 1.89
SPNS1-208ENST00000566059 NUP155O75694 1391 aa26.87■■□□□ 1.89
SPNS1-208ENST00000566059 NPATQ14207 1427 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS1-208ENST00000566059 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS1-208ENST00000566059 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-208ENST00000566059 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-208ENST00000566059 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-208ENST00000566059 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-208ENST00000566059 TRIM52Q96A61 297 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-208ENST00000566059 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 TET3O43151 1660 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 TNRQ92752 1358 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 ERVK-7P63135 1459 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-208ENST00000566059 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-208ENST00000566059 E9PCH4 1651 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-208ENST00000566059 NOS1P29475 1434 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-208ENST00000566059 HSPA2P54652 639 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-208ENST00000566059 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SPNS1-208ENST00000566059 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SPNS1-208ENST00000566059 HRCP23327 699 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-208ENST00000566059 NLRP1Q9C000 1473 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-208ENST00000566059 PKD2Q13563 968 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-208ENST00000566059 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-208ENST00000566059 SYNMO15061 1565 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-208ENST00000566059 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-208ENST00000566059 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-208ENST00000566059 IDI1Q13907 227 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS1-208ENST00000566059 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS1-208ENST00000566059 PTPRTO14522 1441 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-208ENST00000566059 FOXD1Q16676 465 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-208ENST00000566059 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-208ENST00000566059 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-208ENST00000566059 PLA2R1Q13018 1463 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS1-208ENST00000566059 PIK3C2BO00750 1634 aa26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-208ENST00000566059 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-208ENST00000566059 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-208ENST00000566059 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS1-208ENST00000566059 TRPM2O94759 1503 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-208ENST00000566059 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 STRCQ7RTU9 1775 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRB3O60242 1522 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 CLTCL1P53675 1640 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS1-208ENST00000566059 SLIT1O75093 1534 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-208ENST00000566059 LTKP29376 864 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS1-208ENST00000566059 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-208ENST00000566059 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-208ENST00000566059 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-208ENST00000566059 EID1Q9Y6B2 187 aa26.32■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 ZFYVE9O95405 1425 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 MED14O60244 1454 aa26.29■■□□□ 1.8
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