RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.46■■□□□ 1.67
GDE1-203ENST00000564172 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.45■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 TSPOAP1O95153 1857 aa25.45■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.43■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.43■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.42■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.42■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 TONSLQ96HA7 1378 aa25.4■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 RICTORQ6R327 1708 aa25.4■■□□□ 1.66
GDE1-203ENST00000564172 KIF3BO15066 747 aa25.38■■□□□ 1.65
GDE1-203ENST00000564172 A2MP01023 1474 aa25.38■■□□□ 1.65
GDE1-203ENST00000564172 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.36■■□□□ 1.65
GDE1-203ENST00000564172 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
GDE1-203ENST00000564172 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
GDE1-203ENST00000564172 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.34■■□□□ 1.65
GDE1-203ENST00000564172 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
GDE1-203ENST00000564172 ABCA6Q8N139 1617 aa25.32■■□□□ 1.64
GDE1-203ENST00000564172 DEPDC5O75140 1603 aa25.32■■□□□ 1.64
GDE1-203ENST00000564172 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.29■■□□□ 1.64
GDE1-203ENST00000564172 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.29■■□□□ 1.64
GDE1-203ENST00000564172 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.29■■□□□ 1.64
GDE1-203ENST00000564172 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.28■■□□□ 1.64
GDE1-203ENST00000564172 KANK1Q14678 1352 aa25.27■■□□□ 1.64
GDE1-203ENST00000564172 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
GDE1-203ENST00000564172 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.25■■□□□ 1.63
GDE1-203ENST00000564172 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.25■■□□□ 1.63
GDE1-203ENST00000564172 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
GDE1-203ENST00000564172 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
GDE1-203ENST00000564172 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.25■■□□□ 1.63
GDE1-203ENST00000564172 PLA2R1Q13018 1463 aa25.21■■□□□ 1.63
GDE1-203ENST00000564172 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GDE1-203ENST00000564172 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
GDE1-203ENST00000564172 GGT6Q6P531 493 aa25.2■■□□□ 1.62
GDE1-203ENST00000564172 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.19■■□□□ 1.62
GDE1-203ENST00000564172 ATP10AO60312 1499 aa25.18■■□□□ 1.62
GDE1-203ENST00000564172 TET3O43151 1660 aa25.16■■□□□ 1.62
GDE1-203ENST00000564172 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.16■■□□□ 1.62
GDE1-203ENST00000564172 E9PCH4 1651 aa25.15■■□□□ 1.62
GDE1-203ENST00000564172 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.13■■□□□ 1.61
GDE1-203ENST00000564172 PTPRTO14522 1441 aa25.1■■□□□ 1.61
GDE1-203ENST00000564172 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.09■■□□□ 1.61
GDE1-203ENST00000564172 REREQ9P2R6 1566 aa25.08■■□□□ 1.61
GDE1-203ENST00000564172 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.08■■□□□ 1.61
GDE1-203ENST00000564172 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.06■■□□□ 1.6
GDE1-203ENST00000564172 CEP152O94986 1710 aa25.06■■□□□ 1.6
GDE1-203ENST00000564172 ABCC3O15438 1527 aa25.05■■□□□ 1.6
GDE1-203ENST00000564172 TRPM2O94759 1503 aa25.05■■□□□ 1.6
GDE1-203ENST00000564172 AGLP35573 1532 aa25.04■■□□□ 1.6
GDE1-203ENST00000564172 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.04■■□□□ 1.6
GDE1-203ENST00000564172 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.02■■□□□ 1.6
GDE1-203ENST00000564172 NPATQ14207 1427 aa25.02■■□□□ 1.6
GDE1-203ENST00000564172 RGL3Q3MIN7 710 aa25.01■■□□□ 1.59
GDE1-203ENST00000564172 DCAF11Q8TEB1 546 aa25■■□□□ 1.59
GDE1-203ENST00000564172 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.97■■□□□ 1.59
GDE1-203ENST00000564172 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.96■■□□□ 1.59
GDE1-203ENST00000564172 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.96■■□□□ 1.59
GDE1-203ENST00000564172 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.96■■□□□ 1.59
GDE1-203ENST00000564172 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
GDE1-203ENST00000564172 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.96■■□□□ 1.59
GDE1-203ENST00000564172 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 CLTCL1P53675 1640 aa24.95■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.95■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.94■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.9■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.9■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 MLECQ14165 292 aa24.9■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 NOS1P29475 1434 aa24.89■■□□□ 1.58
GDE1-203ENST00000564172 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GDE1-203ENST00000564172 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
GDE1-203ENST00000564172 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.85■■□□□ 1.57
GDE1-203ENST00000564172 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
GDE1-203ENST00000564172 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GDE1-203ENST00000564172 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.85■■□□□ 1.57
GDE1-203ENST00000564172 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.83■■□□□ 1.57
GDE1-203ENST00000564172 STAC3Q96MF2 364 aa24.82■■□□□ 1.56
GDE1-203ENST00000564172 SYNMO15061 1565 aa24.79■■□□□ 1.56
GDE1-203ENST00000564172 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
GDE1-203ENST00000564172 KIF1BO60333 1816 aa24.79■■□□□ 1.56
GDE1-203ENST00000564172 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
GDE1-203ENST00000564172 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
GDE1-203ENST00000564172 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
GDE1-203ENST00000564172 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.77■■□□□ 1.56
GDE1-203ENST00000564172 IDI1Q13907 227 aa24.76■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.76■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 ADGRB3O60242 1522 aa24.75■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.75■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 PIK3C2BO00750 1634 aa24.75■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 ERVK-7P63135 1459 aa24.74■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.73■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 USP47Q96K76 1375 aa24.73■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.73■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 ZMYM3Q14202 1370 aa24.72■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 MROH2AA6NES4 1674 aa24.72■■□□□ 1.55
GDE1-203ENST00000564172 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.7■■□□□ 1.54
GDE1-203ENST00000564172 MADDQ8WXG6 1647 aa24.69■■□□□ 1.54
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